More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4692 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4692  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  100 
 
 
278 aa  553  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243539  normal  0.0624727 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1453  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  78.26 
 
 
291 aa  447  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.33077  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1212  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  82.25 
 
 
292 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1624  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  75.72 
 
 
291 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.392007  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4358  succinyl-CoA synthetase, subunit alpha  84.42 
 
 
290 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.122556 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2882  succinyl-CoA ligase [ADP-forming] subunit alpha  74.46 
 
 
293 aa  422  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1299  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  74.19 
 
 
294 aa  421  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.825438  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0078  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  73.74 
 
 
294 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal  0.735177 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0966  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  73.38 
 
 
294 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2626  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  73.38 
 
 
294 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.639809  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0394  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  73.48 
 
 
294 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1181  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  73.12 
 
 
296 aa  416  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115705  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0827  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  73.74 
 
 
293 aa  416  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.623831 
 
 
-
 
NC_002978  WD1209  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  68.84 
 
 
291 aa  414  1e-114  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0185  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  73.12 
 
 
294 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0279  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  73.48 
 
 
294 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0600383 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0921  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  72.76 
 
 
294 aa  410  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.324584 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0230  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  73.12 
 
 
294 aa  413  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3397  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  72.73 
 
 
293 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.891805 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0539  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  72.76 
 
 
294 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0543  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  72.4 
 
 
294 aa  408  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2229  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  71.33 
 
 
296 aa  407  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1125  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  71.68 
 
 
294 aa  408  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0337157  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0491  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  71.33 
 
 
294 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1585  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  71.68 
 
 
294 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0155  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  71.33 
 
 
294 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.941694  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1645  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  72.4 
 
 
295 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.277929  normal  0.44525 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0192  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  72.4 
 
 
294 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1927  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  72.4 
 
 
295 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0416872  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2163  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  70.61 
 
 
294 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.612608  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0421  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  72.04 
 
 
294 aa  404  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0250  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  71.22 
 
 
290 aa  401  1e-111  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0810  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  71.96 
 
 
288 aa  401  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.674167  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30915  predicted protein  72.1 
 
 
344 aa  394  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1100  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  69.93 
 
 
300 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0979666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3877  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  69.2 
 
 
300 aa  392  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000526587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3686  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  69.2 
 
 
300 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0387134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3576  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  69.2 
 
 
300 aa  392  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0154825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3594  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  69.2 
 
 
300 aa  392  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.372712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3933  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  69.2 
 
 
300 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1465  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  69.93 
 
 
308 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3882  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  69.2 
 
 
300 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000124479  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2788  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  70.29 
 
 
308 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3973  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  69.2 
 
 
300 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00161204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1310  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  69.2 
 
 
300 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000061731  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1993  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  69.93 
 
 
300 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2487  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  69.2 
 
 
300 aa  392  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000153221  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3847  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  69.2 
 
 
300 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3606  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  70.44 
 
 
294 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0496602 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4348  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  69.2 
 
 
291 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.265556  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1041  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  69.2 
 
 
290 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.201704 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1888  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  70.65 
 
 
292 aa  390  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3658  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  68.48 
 
 
300 aa  388  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000316664  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2039  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  67.64 
 
 
291 aa  387  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1376  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  69.2 
 
 
299 aa  390  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3222  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  69.2 
 
 
290 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0862  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  69 
 
 
289 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0472557 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0156  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  68.48 
 
 
290 aa  384  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.852217  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0895  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  69 
 
 
289 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0404555  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0714  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  68 
 
 
291 aa  387  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000108729  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0798  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  69 
 
 
289 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0283915  normal  0.188512 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1239  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  69 
 
 
290 aa  384  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.961959  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0772  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  69 
 
 
289 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1373  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  68.48 
 
 
293 aa  386  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0833  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  68.63 
 
 
289 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0260305  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3485  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  68.48 
 
 
290 aa  384  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.622532  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3097  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  69 
 
 
290 aa  384  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3512  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  70.5 
 
 
295 aa  384  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2911  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  69 
 
 
290 aa  384  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.861372  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1430  succinyl-CoA synthetase alpha chain  69 
 
 
290 aa  385  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204322  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00688  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  68.63 
 
 
289 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2907  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  68.63 
 
 
289 aa  384  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0776  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  68.63 
 
 
289 aa  384  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2927  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  68.63 
 
 
289 aa  384  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0755  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  68.63 
 
 
289 aa  384  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00677  hypothetical protein  68.63 
 
 
289 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01878  Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  67.9 
 
 
290 aa  382  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1229  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  68.27 
 
 
289 aa  382  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2260  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  68.5 
 
 
291 aa  381  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.237246  hitchhiker  0.0000000231889 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0648  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  68.63 
 
 
289 aa  384  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1989  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  68.13 
 
 
295 aa  382  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2548  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  66.91 
 
 
290 aa  384  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.12229 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0741  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  68.63 
 
 
289 aa  384  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1270  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  68.63 
 
 
290 aa  381  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.531627  hitchhiker  0.00241286 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0821  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  68.63 
 
 
289 aa  384  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2499  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  68.63 
 
 
295 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.285546  normal  0.123009 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3685  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  68.63 
 
 
295 aa  377  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1791  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  67.9 
 
 
290 aa  378  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.66969  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2068  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  67.77 
 
 
296 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000768235  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2180  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  67.16 
 
 
290 aa  379  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1147  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  67.9 
 
 
290 aa  378  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1658  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  67.9 
 
 
290 aa  378  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0294249  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43940  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  68.63 
 
 
295 aa  377  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1748  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  74.91 
 
 
290 aa  380  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.13514 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0558  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  70.5 
 
 
294 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2625  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  67.53 
 
 
290 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000598296  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2222  succinyl-CoA synthase, alpha subunit  69.03 
 
 
290 aa  375  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0851667  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2266  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  67.53 
 
 
290 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1670  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  67.53 
 
 
290 aa  374  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2505  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  67.53 
 
 
290 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00526313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>