34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4624 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4624  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 		 344 aa  704    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.144195 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4525  zinc carboxypeptidase-related protein  79.71 
 
 		 344 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.988976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0840  zinc carboxypeptidase-related protein  80 
 
 		 344 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.387339  normal  0.0855585 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4289  hypothetical protein  71.99 
 
 		 340 aa  509  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4190  putative metalloproteinase (zinc carboxypeptidase-related protein)  71.43 
 
 		 343 aa  495  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1285  hypothetical protein  69.28 
 
 		 356 aa  478  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3437  hypothetical protein  66.97 
 
 		 365 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0051  putative carboxypeptidase  54.63 
 
 		 365 aa  385  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.203157 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2025  putative carboxypeptidase  54.29 
 
 		 373 aa  363  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3538  hypothetical protein  46.97 
 
 		 355 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2903  hypothetical protein  44.58 
 
 		 337 aa  295  6e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  41.95 
 
 		 365 aa  295  7e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0368  zinc-binding domain-containing protein  47.78 
 
 		 363 aa  290  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.499164  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0774  zinc carboxypeptidase-related protein  43.98 
 
 		 340 aa  287  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1742  zinc carboxypeptidase-related protein  45.4 
 
 		 342 aa  279  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.212306  hitchhiker  0.00119795 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2604  zinc carboxypeptidase-related protein  45.99 
 
 		 342 aa  278  7e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2643  zinc carboxypeptidase-related protein  45.4 
 
 		 342 aa  278  7e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2718  zinc carboxypeptidase-related protein  45.4 
 
 		 342 aa  278  7e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.792819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2282  zinc carboxypeptidase-related protein  46.73 
 
 		 346 aa  278  9e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.548754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2354  zinc carboxypeptidase-related protein  46.43 
 
 		 341 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2472  oxoglutarate dehydrogenase (succinyl-transferring)  46.11 
 
 		 341 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.319923  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1975  Zinc carboxypeptidase-related protein  44.18 
 
 		 342 aa  263  4e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3019  zinc carboxypeptidase-related protein  43.28 
 
 		 340 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.266904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1183  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.06 
 
 		 1061 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  29.06 
 
 		 821 aa  49.7  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_4102  predicted protein  34.52 
 
 		 241 aa  47.4  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  unclonable  0.0000187913 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.48 
 
 		 606 aa  47  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.48 
 
 		 606 aa  47  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  38.36 
 
 		 618 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3043  hypothetical protein  29.13 
 
 		 490 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0217728 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05225  hypothetical protein  26.15 
 
 		 305 aa  43.9  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001335  hypothetical protein  25.38 
 
 		 305 aa  43.9  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000552003  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  36.99 
 
 		 506 aa  43.5  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5494  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.97 
 
 		 218 aa  43.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136631  normal  0.114762 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>