More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4594 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4594  porin  100 
 
 
376 aa  747  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  54.1 
 
 
387 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  54.73 
 
 
394 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  58.01 
 
 
385 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  56.04 
 
 
523 aa  386  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  57.73 
 
 
385 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  58.01 
 
 
385 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  54.52 
 
 
386 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  55 
 
 
430 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  55 
 
 
430 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  53.49 
 
 
386 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  55.56 
 
 
384 aa  381  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  54.01 
 
 
386 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  55 
 
 
384 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  55 
 
 
411 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  55 
 
 
384 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  54.26 
 
 
386 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  55 
 
 
384 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  54.01 
 
 
386 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  54.26 
 
 
386 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  55.7 
 
 
385 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  55.44 
 
 
385 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  55.7 
 
 
385 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  53.44 
 
 
393 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  54.26 
 
 
386 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  54.62 
 
 
376 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  52.16 
 
 
393 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  54.62 
 
 
376 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  54.35 
 
 
376 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  53.64 
 
 
390 aa  362  6e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  51.66 
 
 
390 aa  359  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  48.47 
 
 
390 aa  359  5e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  53.44 
 
 
388 aa  358  7e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  52.76 
 
 
386 aa  358  1e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  51.04 
 
 
430 aa  357  2e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  50.52 
 
 
430 aa  357  2e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  51.04 
 
 
430 aa  357  3e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  50.78 
 
 
390 aa  355  5e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  50.78 
 
 
430 aa  355  6e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  50.78 
 
 
430 aa  355  6e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  50.78 
 
 
430 aa  355  6e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  52.59 
 
 
390 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  52.86 
 
 
390 aa  354  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  52.86 
 
 
390 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  52.86 
 
 
390 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  50.9 
 
 
390 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  49.01 
 
 
404 aa  340  3e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  46.46 
 
 
386 aa  322  5e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3838  porin  48.44 
 
 
386 aa  314  1e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6027  porin  49.59 
 
 
389 aa  315  1e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6177  porin  47.92 
 
 
386 aa  312  5e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2426  outer membrane protein (porin)  49.04 
 
 
386 aa  305  7e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5188  porin  48.6 
 
 
381 aa  303  3e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3684  porin  47.66 
 
 
386 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243056  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4679  porin  47.66 
 
 
386 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169136  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  43.88 
 
 
397 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  44.9 
 
 
397 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  43.62 
 
 
421 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  43.62 
 
 
421 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  44.81 
 
 
389 aa  272  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  43.62 
 
 
397 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  42.47 
 
 
399 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  42.47 
 
 
399 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  42.47 
 
 
399 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  42.47 
 
 
399 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  41.75 
 
 
397 aa  269  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  44.92 
 
 
383 aa  268  8e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  42.09 
 
 
397 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  44.33 
 
 
395 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  44.62 
 
 
436 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  42.22 
 
 
399 aa  266  3e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  44.62 
 
 
436 aa  266  3e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  43.77 
 
 
445 aa  266  3e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  44.62 
 
 
386 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  44.62 
 
 
386 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  44.62 
 
 
386 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  44.62 
 
 
386 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  44.62 
 
 
386 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  42.3 
 
 
391 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  43.65 
 
 
383 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  43.99 
 
 
385 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  43.65 
 
 
383 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  44.25 
 
 
385 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  43.4 
 
 
383 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  44.36 
 
 
386 aa  262  7e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  45.45 
 
 
391 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  43.57 
 
 
389 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  45.24 
 
 
402 aa  259  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  42.09 
 
 
389 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  9.90839e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  44.76 
 
 
389 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  42.32 
 
 
391 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  42.72 
 
 
400 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  42.16 
 
 
395 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  42.22 
 
 
400 aa  245  1e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  40.51 
 
 
390 aa  244  2e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4922  porin  40.26 
 
 
390 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3241  porin  40.26 
 
 
390 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  38.42 
 
 
422 aa  243  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  40.81 
 
 
394 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1057  OmpC family outer membrane porin  40.24 
 
 
408 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117495  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>