More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4544 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 260 aa  525  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  47.41 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  44.8 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  45.66 
 
 		 240 aa  188  9e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  42.99 
 
 		 262 aa  179  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  43.05 
 
 		 228 aa  175  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  41.45 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 236 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  40.51 
 
 		 266 aa  168  7e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3836  GntR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 312 aa  168  8e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155558  normal  0.0735717 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 255 aa  168  8e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 239 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  41.94 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2747  transcriptional regulator, GntR family  39.81 
 
 		 233 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.756614  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 252 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5236  transcriptional regulator, GntR family  38.89 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2564  transcriptional regulator GntR  37.9 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  34.7 
 
 		 238 aa  123  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5712  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 		 223 aa  109  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 232 aa  105  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  35.78 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 231 aa  102  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 233 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 233 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 233 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16960  transcriptional regulator, GntR family  33.48 
 
 		 229 aa  99  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.916885 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0705  transcriptional regulator, GntR family  34.02 
 
 		 243 aa  99  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 254 aa  99  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  30.62 
 
 		 219 aa  97.4  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 227 aa  94.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 230 aa  92.4  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5932  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 210 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.733777  normal  0.0408892 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 227 aa  90.1  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  31.65 
 
 		 225 aa  89.4  6e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 233 aa  89.4  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3215  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 256 aa  89  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0184388 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 		 218 aa  89  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4063  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 243 aa  88.6  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.299746  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 242 aa  88.6  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0481  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 214 aa  88.2  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1517  transcriptional regulator, GntR family  28.46 
 
 		 225 aa  88.6  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 233 aa  88.2  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 229 aa  88.6  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3952  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 221 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.942603  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  28.63 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  31.35 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 257 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 219 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 234 aa  87  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 		 244 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  31.6 
 
 		 230 aa  87  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2595  GntR domain protein  30.1 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709124  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 216 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1522  transcriptional regulator, GntR family  32.68 
 
 		 218 aa  86.3  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 239 aa  86.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00895  transcription regulator protein  33.51 
 
 		 205 aa  86.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0473063  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0496  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 214 aa  86.3  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.118787  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 265 aa  86.3  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 241 aa  85.9  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 265 aa  85.9  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 229 aa  85.9  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 		 231 aa  85.5  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  32.68 
 
 		 243 aa  85.5  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4133  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 231 aa  85.1  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3216  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0185552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5826  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644703 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3213  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3552  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.430063  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  26.54 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3559  transcriptional regulator, GntR family  30.69 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  28.71 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  26.07 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0287  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  29.06 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0530  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710712  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3621  transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1138  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128923 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  31.78 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  27.82 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>