279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4508 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5415  amino acid/peptide transporter  76.13 
 
 		 506 aa  743    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0348  amino acid/peptide transporter  75.15 
 
 		 500 aa  733    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.781642  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3261  amino acid/peptide transporter  77.15 
 
 		 506 aa  777    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0234728 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4440  amino acid/peptide transporter  83.7 
 
 		 513 aa  800    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1255  amino acid/peptide transporter  75.35 
 
 		 551 aa  737    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0113  amino acid/peptide transporter  75.25 
 
 		 506 aa  748    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2221  amino acid/peptide transporter  77.21 
 
 		 551 aa  739    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0759  major facilitator superfamily peptide/H(+)symporter  84 
 
 		 513 aa  811    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5316  amino acid/peptide transporter  77.55 
 
 		 506 aa  724    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.179594  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4728  amino acid/peptide transporter  77.55 
 
 		 506 aa  738    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4868  amino acid/peptide transporter  76.33 
 
 		 507 aa  744    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5544  amino acid/peptide transporter  77.55 
 
 		 506 aa  724    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4508  amino acid/peptide transporter  100 
 
 		 507 aa  1016    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1531  amino acid/peptide transporter  75.15 
 
 		 500 aa  733    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1721  amino acid/peptide transporter  75.15 
 
 		 500 aa  733    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97984  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3023  amino acid/peptide transporter  75.35 
 
 		 500 aa  736    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2907  amino acid/peptide transporter  75.35 
 
 		 500 aa  736    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0382  amino acid/peptide transporter  75.15 
 
 		 500 aa  733    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3183  amino acid/peptide transporter  60.79 
 
 		 517 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0376329 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1174  amino acid/peptide transporter  59.11 
 
 		 521 aa  618  1e-176  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.211879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1207  amino acid/peptide transporter  59.92 
 
 		 517 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0390922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1117  amino acid/peptide transporter  60 
 
 		 523 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1102  amino acid/peptide transporter  59.72 
 
 		 546 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1277  proton-dependent oligopeptide transporter (POT) family protein  59.64 
 
 		 516 aa  611  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2910  amino acid/peptide transporter  58.28 
 
 		 516 aa  608  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.380758  normal  0.476442 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2992  amino acid/peptide transporter  58.28 
 
 		 516 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0360187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3089  amino acid/peptide transporter  58.28 
 
 		 516 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000368989  normal  0.0911268 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1177  proton-dependent oligopeptide transporter (POT) family protein  59.63 
 
 		 506 aa  590  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.980946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0623  amino acid/peptide transporter  38.87 
 
 		 495 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000100169  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2318  putative tripeptide transporter permease  39.44 
 
 		 506 aa  378  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1189  amino acid/peptide transporter  48.35 
 
 		 501 aa  373  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.500547 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0652  tripeptide permease TppB  41.13 
 
 		 504 aa  374  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.068993  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1525  di-/tripeptide transporter  41.13 
 
 		 528 aa  374  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0251804  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2017  putative tripeptide transporter permease  39.96 
 
 		 506 aa  372  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.617443  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1562  putative tripeptide transporter permease  39.92 
 
 		 501 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0485322  normal  0.102163 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1622  putative tripeptide transporter permease  39.71 
 
 		 501 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.185719  normal  0.452221 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1722  putative tripeptide transporter permease  39.92 
 
 		 501 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00217506  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1549  putative tripeptide transporter permease  39.71 
 
 		 501 aa  369  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.507438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1890  putative tripeptide transporter permease  39.71 
 
 		 501 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1710  putative tripeptide transporter permease  39.54 
 
 		 500 aa  364  3e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0064967  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01604  putative tripeptide transporter permease  39.54 
 
 		 500 aa  363  4e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00542523  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2006  amino acid/peptide transporter  39.54 
 
 		 500 aa  363  4e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0749107  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1995  putative tripeptide transporter permease  39.54 
 
 		 500 aa  363  4e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46141  normal  0.0309863 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01594  hypothetical protein  39.54 
 
 		 500 aa  363  4e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00471162  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1824  putative tripeptide transporter permease  39.33 
 
 		 500 aa  363  4e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1844  putative tripeptide transporter permease  39.33 
 
 		 500 aa  363  4e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345542  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2346  putative tripeptide transporter permease  39.54 
 
 		 500 aa  363  4e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0609489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1565  putative tripeptide transporter permease  39.54 
 
 		 500 aa  363  4e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1814  putative tripeptide transporter permease  39.62 
 
 		 502 aa  363  4e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000684589  decreased coverage  0.000347242 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1886  putative tripeptide transporter permease  40.42 
 
 		 511 aa  362  7.0000000000000005e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348979  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1778  putative tripeptide transporter permease  40.42 
 
 		 501 aa  362  8e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2548  putative tripeptide transporter permease  40.42 
 
 		 488 aa  362  1e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0509  putative tripeptide transporter permease  40.7 
 
 		 514 aa  354  2.9999999999999997e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2233  putative tripeptide transporter permease  39.43 
 
 		 506 aa  352  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000348133 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2720  hypothetical protein  38.05 
 
 		 500 aa  350  3e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3785  inner membrane transporter YhiP  37.24 
 
 		 490 aa  346  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0323752  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2851  hypothetical protein  37.07 
 
 		 500 aa  345  2e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03345  predicted transporter  37.24 
 
 		 489 aa  341  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.199197  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03298  hypothetical protein  37.24 
 
 		 489 aa  341  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.240113  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3978  inner membrane transporter YhiP  37.24 
 
 		 489 aa  341  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3826  inner membrane transporter YhiP  37.24 
 
 		 489 aa  342  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0219  amino acid/peptide transporter  37.24 
 
 		 489 aa  341  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3696  inner membrane transporter YhiP  37.24 
 
 		 489 aa  341  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0220  inner membrane transporter YhiP  37.24 
 
 		 489 aa  341  2e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4843  inner membrane transporter YhiP  37.03 
 
 		 489 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3966  inner membrane transporter YhiP  37.03 
 
 		 490 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.826151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3785  inner membrane transporter YhiP  37.03 
 
 		 489 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3905  inner membrane transporter YhiP  37.03 
 
 		 490 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3795  inner membrane transporter YhiP  37.03 
 
 		 490 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3862  inner membrane transporter YhiP  37.03 
 
 		 490 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  30.08 
 
 		 494 aa  224  4e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  33.4 
 
 		 495 aa  221  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  28.6 
 
 		 516 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  30.94 
 
 		 492 aa  216  7e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  30.24 
 
 		 516 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  29.78 
 
 		 510 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  30.74 
 
 		 492 aa  215  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  29.98 
 
 		 544 aa  214  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  30.63 
 
 		 527 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  30.97 
 
 		 509 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  31.91 
 
 		 499 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0770  inner membrane transporter YbgH  30.85 
 
 		 493 aa  210  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.493131 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  31.12 
 
 		 451 aa  209  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0867  inner membrane transporter YbgH  30.65 
 
 		 493 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0757  inner membrane transporter YbgH  30.65 
 
 		 493 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0832  inner membrane transporter YbgH  30.65 
 
 		 493 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  hitchhiker  0.00189799 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  30.33 
 
 		 534 aa  208  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0818  inner membrane transporter YbgH  30.65 
 
 		 493 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3766  amino acid/peptide transporter  32.34 
 
 		 482 aa  206  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000840749  normal  0.111557 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  29.53 
 
 		 510 aa  206  9e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03963  hypothetical protein  32.23 
 
 		 485 aa  206  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04001  predicted transporter  32.23 
 
 		 485 aa  206  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3861  amino acid/peptide transporter  32.02 
 
 		 485 aa  205  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4685  amino acid/peptide transporter  32.23 
 
 		 485 aa  206  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4371  amino acid/peptide transporter  32.02 
 
 		 485 aa  205  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.113976  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3897  amino acid/peptide transporter  32.02 
 
 		 485 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  32.99 
 
 		 496 aa  205  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5646  amino acid/peptide transporter  32.23 
 
 		 485 aa  205  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  30.32 
 
 		 501 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  30.11 
 
 		 501 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>