111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4437 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4437  autoinducer synthesis protein  100 
 
 
195 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0608  putative autoinducer synthesis protein  77.16 
 
 
197 aa  306  9e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4275  autoinducer synthesis protein  77.16 
 
 
197 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.722573  normal  0.550742 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45940  autoinducer synthesis protein LasI  51.67 
 
 
201 aa  191  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3897  autoinducer synthesis protein LasI  51.67 
 
 
201 aa  191  8e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156305  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2390  autoinducer synthesis protein  51.79 
 
 
203 aa  169  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3498  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.94 
 
 
191 aa  150  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.364609 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0259  autoinducer synthesis protein TraI (conjugation factor synthetase)  42.27 
 
 
211 aa  143  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0361  autoinducer synthesis protein  42.26 
 
 
197 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0941  autoinducer synthesis protein  44.77 
 
 
212 aa  125  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1889  autoinducer synthesis protein  41.62 
 
 
214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889914  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8335  putative autoinducer synthesis protein  39.78 
 
 
212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.613519  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0957  autoinducer synthesis protein LuxI  40.41 
 
 
193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1560  autoinducer synthesis protein  40.24 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.766209  normal  0.485309 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5481  putative autoinducer synthesis protein  37.43 
 
 
208 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1666  autoinducer synthesis protein  33.71 
 
 
183 aa  106  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.852162 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1999  autoinducer synthesis protein  33.71 
 
 
183 aa  106  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.556283  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0123  autoinducer synthesis protein  40.28 
 
 
210 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1760  autoinducer synthesis protein  39.58 
 
 
210 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0965  Acyl-homoserine-lactone synthase  31.76 
 
 
188 aa  102  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.397594  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9270  putative autoinducer synthesis protein  36.7 
 
 
212 aa  102  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1710  autoinducer synthesis protein  38.19 
 
 
210 aa  101  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0765757  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0145  N-acylhomoserine lactone synthase  32 
 
 
206 aa  98.2  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0460086  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1658  autoinducer synthetase  32 
 
 
206 aa  98.2  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0115176  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1577  autoinducer synthetase  32 
 
 
206 aa  98.2  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24654  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5375  putative autoinducer synthesis protein  37.21 
 
 
206 aa  97.8  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0563585  normal  0.248437 
 
 
-
 
NC_003296  RS01928  autoinducer synthase  31.28 
 
 
182 aa  94.4  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.697337 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4570  putative autoinducer synthesis protein  41.1 
 
 
207 aa  94.4  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6053  autoinducer synthesis protein  28.42 
 
 
201 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5823  autoinducer synthesis protein  28.42 
 
 
201 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960322  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5808  Acyl-homoserine-lactone synthase  31.28 
 
 
220 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.167675  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1227  N-acyl homoserine lactone synthase  30.05 
 
 
206 aa  92.8  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2483  N-acylhomoserine lactone synthase  34.57 
 
 
203 aa  91.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1293  autoinducer synthase BpsI  34.57 
 
 
203 aa  91.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133764  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1221  autoinducer synthase BpsI  34.57 
 
 
203 aa  91.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.653596  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1512  N-acyl homoserine lactone synthase  35.19 
 
 
203 aa  89.4  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0575581  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1347  autoinducer synthetase family protein  33.95 
 
 
203 aa  88.6  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0331  autoinducer synthase BpsI  33.95 
 
 
203 aa  88.6  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0609  autoinducer synthase BpsI  33.95 
 
 
203 aa  88.6  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0960  autoinducer synthase BpsI  33.95 
 
 
203 aa  88.6  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3969  autoinducer synthesis protein  31.93 
 
 
213 aa  86.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163172  normal  0.0220737 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3641  autoinducer synthesis protein  33.33 
 
 
202 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000011065  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4726  autoinducer synthesis protein  33.33 
 
 
202 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455128  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1650  autoinducer synthesis protein RhlI  32.54 
 
 
202 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1050  autoinducer synthesis protein  33.33 
 
 
202 aa  85.5  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000000830053  normal  0.1745 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3286  autoinducer synthesis protein SOLI  35.12 
 
 
204 aa  85.5  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.498186  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2929  autoinducer synthesis protein  34.21 
 
 
221 aa  85.5  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.71548  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5574  autoinducer synthesis protein  33.33 
 
 
202 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000539644  hitchhiker  0.00691296 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2668  autoinducer synthesis protein  33.12 
 
 
221 aa  84.7  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637117  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0415  putative autoinducer synthesis protein  31.74 
 
 
249 aa  84.3  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6489  autoinducer synthesis protein  53.85 
 
 
119 aa  84.3  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191421  normal  0.837558 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4583  autoinducer synthesis protein  32.53 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000141788  hitchhiker  0.0000655879 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0804  N-acyl homoserine lactone synthase  36.36 
 
 
268 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.648666  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4118  autoinducer synthesis protein  32.53 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000553872  hitchhiker  0.00840845 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19130  autoinducer synthesis protein RhlI  32.93 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347386  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1577  N-acyl homoserine lactone synthase  35.15 
 
 
202 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0618  N-acylhomoserine lactone synthase  35.19 
 
 
289 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0541466  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2526  autoinducer synthesis protein  33.33 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2589  autoinducer synthesis protein  32.07 
 
 
208 aa  77  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2022  autoinducer synthetase  35.15 
 
 
202 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2216  autoinducer synthetase BpmI  35.19 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0690156  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2129  autoinducer synthetase BpmI  35.15 
 
 
202 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.466862  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0700  autoinducer synthetase BpmI  35.15 
 
 
202 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0126  autoinducer synthesis protein  31.76 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3811  autoinducer synthesis protein  24.69 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2029  autoinducer synthesis protein  32.05 
 
 
216 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0626  autoinducer synthesis protein  31.52 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196351  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0620  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like  30.34 
 
 
195 aa  70.1  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3396  autoinducer synthesis protein  29.09 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1621  autoinducer synthesis protein  27.01 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.672835  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4429  Acyl-homoserine-lactone synthase  27.88 
 
 
217 aa  68.2  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0101  Acyl-homoserine-lactone synthase  27.91 
 
 
212 aa  67.8  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0959  autoinducer synthesis protein  30.43 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0369652  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2312  autoinducer synthesis protein  29.34 
 
 
200 aa  63.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.362295  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2851  autoinducer synthetase  34.38 
 
 
206 aa  64.3  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5028  autoinducer synthesis protein  30.54 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.548856 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0701  autoinducer synthesis protein  28.31 
 
 
208 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0719  N-acylhomoserine lactone synthase YtbI  27.88 
 
 
216 aa  62.8  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0792  autoinducer synthesis protein  27.88 
 
 
216 aa  62.8  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2974  autoinducer synthesis protein  36.67 
 
 
223 aa  62.8  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.402938 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4513  autoinducer synthesis protein  29.34 
 
 
211 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4976  autoinducer synthesis protein  29.34 
 
 
211 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3320  autoinducer synthesis protein  27.38 
 
 
210 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5461  autoinducer synthesis protein  29.34 
 
 
201 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1765  autoinducer synthesis protein  29.34 
 
 
201 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4152  autoinducer synthesis protein  23.38 
 
 
211 aa  57.4  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.290737 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4280  autoinducer synthesis protein  28.17 
 
 
207 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0241247  normal  0.0105559 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0919  autoinducer synthesis protein  27.03 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.142092 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3864  autoinducer synthesis protein PsyI  24.5 
 
 
244 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.70516  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2175  autoinducer synthesis protein  25.15 
 
 
212 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.533935 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4148  Acyl-homoserine-lactone synthase  26.8 
 
 
216 aa  55.8  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5763  autoinducer synthesis protein  37.5 
 
 
207 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124199  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2331  autoinducer synthesis protein  25.15 
 
 
212 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.933975  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1546  N-acylhomoserine lactone synthase YpsI  26.04 
 
 
214 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1656  autoinducer synthesis protein  26.04 
 
 
214 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0098  autoinducer synthesis protein  27.78 
 
 
205 aa  53.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5196  autoinducer synthesis protein  28.17 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.0648346 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1716  N-acylhomoserine lactone synthase YpsI  26.04 
 
 
218 aa  52.8  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105822  hitchhiker  0.000229344 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0417  autoinducer synthesis protein  27.84 
 
 
218 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0283  autoinducer synthesis protein  36.11 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>