More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4422 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4422  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  90.6 
 
 		 234 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  89.74 
 
 		 234 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3501  GntR domain-containing protein  83.76 
 
 		 234 aa  371  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0479  GntR family transcriptional regulator  83.76 
 
 		 234 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0978  GntR family transcriptional regulator  82.91 
 
 		 234 aa  348  5e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5125  GntR domain-containing protein  82.48 
 
 		 234 aa  346  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1919  GntR family transcriptional regulator  82.48 
 
 		 234 aa  341  5e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1856  GntR family transcriptional regulator  82.48 
 
 		 234 aa  341  5e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0578  GntR family transcriptional regulator  82.48 
 
 		 234 aa  341  5e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0437  GntR family transcriptional regulator  82.48 
 
 		 234 aa  341  5e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2012  GntR family transcriptional regulator  82.48 
 
 		 234 aa  341  5e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.888081  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0889  GntR family transcriptional regulator  82.48 
 
 		 234 aa  341  5e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4549  GntR domain-containing protein  83.33 
 
 		 234 aa  340  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5072  GntR domain-containing protein  82.91 
 
 		 234 aa  338  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3213  GntR-like  82.48 
 
 		 234 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5154  GntR domain-containing protein  82.48 
 
 		 234 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  71.55 
 
 		 245 aa  327  7e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  70.69 
 
 		 247 aa  322  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3731  GntR domain protein  62.23 
 
 		 238 aa  261  6e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3408  GntR domain protein  62.23 
 
 		 253 aa  261  6e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  52.65 
 
 		 264 aa  210  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4884  GntR family transcriptional regulator  51.95 
 
 		 258 aa  188  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  51.52 
 
 		 264 aa  185  6e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5148  GntR domain protein  50.22 
 
 		 258 aa  181  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178203  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1636  GntR domain-containing protein  43.84 
 
 		 266 aa  174  7e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195276  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5903  GntR family transcriptional regulator  47.03 
 
 		 288 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210517  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5113  GntR family transcriptional regulator  48.46 
 
 		 274 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 251 aa  166  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  41.82 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  38.46 
 
 		 235 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 255 aa  135  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  38.74 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  38.29 
 
 		 262 aa  130  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  39.48 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  37.44 
 
 		 249 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  37.27 
 
 		 249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 251 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 274 aa  125  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 268 aa  125  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  39.65 
 
 		 253 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  36.05 
 
 		 248 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  36.49 
 
 		 272 aa  123  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  38.36 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  39.21 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  39.65 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  39.65 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  39.21 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  39.65 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2484  GntR domain-containing protein  36.73 
 
 		 238 aa  122  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 272 aa  122  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4447  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 252 aa  122  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.614266  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 254 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  35.86 
 
 		 246 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  38.36 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  38.36 
 
 		 249 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 234 aa  119  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 248 aa  119  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  39.04 
 
 		 246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  35.19 
 
 		 251 aa  118  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  34.93 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  36.75 
 
 		 253 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  36.36 
 
 		 243 aa  115  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1260  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  35.29 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1141  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1691  GntR domain protein  39.73 
 
 		 236 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1877  GntR domain protein  39.27 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380896  normal  0.264595 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  35.81 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  33.91 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  35.78 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  34.96 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  36 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8124  GntR domain protein  34.21 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  35.11 
 
 		 241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  33.63 
 
 		 273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  37.61 
 
 		 232 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  35.35 
 
 		 284 aa  108  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  35.11 
 
 		 237 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0317585 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1641  GntR-like  36.61 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4100  GntR domain protein  34.96 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3321  GntR domain-containing protein  40.24 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1469  GntR domain protein  34.39 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1308  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 240 aa  105  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0031  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 230 aa  105  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  35.62 
 
 		 252 aa  104  9e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5539  regulatory protein GntR HTH  33.77 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1116  GntR domain-containing protein  37.39 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  29.91 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  35.02 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5153  GntR domain-containing protein  34.78 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25689  normal  0.577182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>