More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4383 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4383  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2872  AraC family transcriptional regulator  75.58 
 
 		 259 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6833  transcriptional regulator, AraC family  75.97 
 
 		 259 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540277 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2613  AraC family transcriptional regulator  69.88 
 
 		 255 aa  349  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2475  AraC family transcriptional regulator  69.88 
 
 		 255 aa  349  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0908  hypothetical protein  69.48 
 
 		 255 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0553  AraC family transcriptional regulator  68.67 
 
 		 255 aa  341  5.999999999999999e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3690  AraC family transcriptional regulator  68.63 
 
 		 257 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4528  AraC family transcriptional regulator  68.63 
 
 		 257 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3835  AraC family transcriptional regulator  68.63 
 
 		 257 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4906  AraC family transcriptional regulator  69.69 
 
 		 256 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.209639  hitchhiker  0.0012176 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2262  AraC family transcriptional regulator  65.38 
 
 		 257 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.302077  normal  0.0338598 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5558  AraC family transcriptional regulator  68.9 
 
 		 255 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3735  AraC family transcriptional regulator  68.11 
 
 		 255 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4881  AraC family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 263 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000645238  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4719  AraC family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 255 aa  191  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22580  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  118  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000567306  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1906  putative transcriptional regulator  32.94 
 
 		 254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4427  helix-turn-helix domain-containing protein  29.41 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  30.25 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  30.54 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3800  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000600898 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 287 aa  101  9e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07095  hypothetical protein  28.8 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001016  transcriptional regulator AraC/XylS family  29.24 
 
 		 270 aa  99.4  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0540486  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1474  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 254 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1820  AraC family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 248 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.167781  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1861  helix-turn-helix domain-containing protein  28.69 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0711253  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4017  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173287 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4511  AraC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 255 aa  92  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0764519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0083  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 240 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0820  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  24.15 
 
 		 259 aa  89.7  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1400  helix-turn-helix domain-containing protein  30.92 
 
 		 255 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113749  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4042  helix-turn-helix domain-containing protein  28.05 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0091  transcriptional regulator, AraC family  28.74 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.994797 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0234  transcription regulator protein  28.85 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3309  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6428  AraC family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.980502 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6085  AraC family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1747  transcriptional regulator, AraC family  26.38 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.49476  normal  0.0537138 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0773  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  35.35 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12290  Transcriptional regulator, AraC family  41.86 
 
 		 325 aa  75.9  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05505  putative transcription regulator protein  39.58 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  41.57 
 
 		 150 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1820  AraC family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0677  transposon Tn10 TetD protein  33.67 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0620  transposon Tn10 TetD protein  33.67 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0693  transposon Tn10 TetD protein  33.67 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0392  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0634  transposon Tn10 TetD protein  33.67 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0629  transcriptional regulator, AraC family  42.99 
 
 		 354 aa  72.4  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0739  transposon Tn10 TetD protein  34.38 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  39.58 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  38.2 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  35.05 
 
 		 331 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 345 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  32.14 
 
 		 334 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  40.21 
 
 		 288 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 334 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  34.02 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  41.98 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2057  helix-turn-helix domain-containing protein  37.63 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  34.02 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0330  AraC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.78 
 
 		 164 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2175  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0644092  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2669  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  34.02 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2978  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  39.6 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  37.08 
 
 		 140 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  38.3 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  33.68 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1220  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3232  transcriptional regulator, AraC family  36.11 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0599312  hitchhiker  0.0000105754 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0628  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3030  AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.331387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1279  helix-turn-helix domain-containing protein  38.26 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 332 aa  68.9  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  38.64 
 
 		 308 aa  68.9  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1138  helix-turn-helix domain-containing protein  29.75 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3975  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  35.42 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>