More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4345 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4345  type II and III secretion system protein  100 
 
 
451 aa  902    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222675  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2920  putative type II and III secretion system outermembrane protein, secretin  68.64 
 
 
595 aa  555  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6875  type II and III secretion system protein  68.12 
 
 
561 aa  552  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.52559  normal  0.294616 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2310  type II and III secretion system protein  38.5 
 
 
443 aa  272  8.000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0749  type II and III secretion system protein  35.73 
 
 
436 aa  232  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0707  putative type II and III secretion system outermembrane protein, secretin  33.17 
 
 
423 aa  226  6e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.848525  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2693  type II and III secretion system protein  34.32 
 
 
479 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0645  type II and III secretion system protein  34.16 
 
 
436 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0246  type II and III secretion system protein  29.36 
 
 
714 aa  176  9e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2117  type II and III secretion system protein  29.45 
 
 
356 aa  152  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  29.23 
 
 
454 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  29.23 
 
 
454 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  29.77 
 
 
473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4403  type II and III secretion system protein  32.4 
 
 
495 aa  147  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  30.35 
 
 
469 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  29.95 
 
 
464 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  30.48 
 
 
454 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  30.49 
 
 
468 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  28.53 
 
 
482 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  30.86 
 
 
460 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  31.43 
 
 
454 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  31.42 
 
 
460 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  31 
 
 
490 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  28.79 
 
 
477 aa  136  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  29.21 
 
 
457 aa  136  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  29.98 
 
 
460 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  28.95 
 
 
493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  29.93 
 
 
493 aa  130  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  29.56 
 
 
492 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  40.28 
 
 
526 aa  130  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1658  type II and III secretion system protein  29.95 
 
 
483 aa  130  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  28.73 
 
 
484 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  30.75 
 
 
482 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  30.75 
 
 
482 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  30.35 
 
 
479 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  30.75 
 
 
482 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  30.75 
 
 
482 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  30.75 
 
 
482 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  30.75 
 
 
482 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2827  type II and III secretion system protein  27.74 
 
 
487 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.863407  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1642  type II and III secretion system protein  26.11 
 
 
453 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00375821  normal  0.501633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  30.03 
 
 
496 aa  126  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  30.58 
 
 
444 aa  126  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  29.6 
 
 
494 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1732  type II and III secretion system protein  29.15 
 
 
443 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793195  hitchhiker  0.00000430206 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  31.58 
 
 
479 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4661  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  29.52 
 
 
443 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000794738  hitchhiker  0.00340482 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2915  type II and III secretion system protein  27.55 
 
 
484 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  28.46 
 
 
461 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.549017 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  29.98 
 
 
499 aa  124  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2384  type II and III secretion system protein  28.72 
 
 
501 aa  124  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0712341  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2480  type II and III secretion system protein  28.34 
 
 
502 aa  124  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  27.51 
 
 
466 aa  123  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1497  type II and III secretion system protein  28.35 
 
 
443 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0318341  hitchhiker  0.0000037114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7031  putative pilus assembly protein cpaC  27.48 
 
 
497 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157408  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2408  type II and III secretion system protein  28.01 
 
 
502 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1041  type II and III secretion system protein  28.35 
 
 
443 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00604679  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  28.35 
 
 
443 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  28.14 
 
 
483 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  29.22 
 
 
455 aa  121  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  28.07 
 
 
633 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002644  type II/IV secretion system secretin RcpA/CpaC associated with Flp pilus assembly  27.25 
 
 
487 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0070  type II and III secretion system protein  29.46 
 
 
461 aa  120  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  29.82 
 
 
432 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  29.82 
 
 
432 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0591  type II and III secretion system protein  28.07 
 
 
663 aa  120  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341845  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  29.82 
 
 
432 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  29.82 
 
 
441 aa  120  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  29.82 
 
 
441 aa  120  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  29.82 
 
 
441 aa  120  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  29.82 
 
 
441 aa  120  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  28.84 
 
 
620 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  30 
 
 
441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2321  type II and III secretion system protein  29.91 
 
 
452 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0848  type II and III secretion system protein  28.51 
 
 
419 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  30.38 
 
 
530 aa  116  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3204  type II and III secretion system protein  25.73 
 
 
451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.154583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  28.37 
 
 
480 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1057  type II and III secretion system protein  24.83 
 
 
451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  27.84 
 
 
491 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  30.16 
 
 
517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3713  type II and III secretion system protein  26.73 
 
 
492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  28.68 
 
 
690 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  39.38 
 
 
466 aa  114  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  27.67 
 
 
482 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2960  type II/III secretion system protein  28.68 
 
 
690 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  29.13 
 
 
679 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  26.2 
 
 
492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  33.05 
 
 
473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55920  putative type II secretion system protein  29.77 
 
 
416 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275442  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  40.91 
 
 
461 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  40.26 
 
 
461 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  40.26 
 
 
461 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  27.89 
 
 
497 aa  111  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  27.2 
 
 
491 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3085  type II/III secretion system protein  28.91 
 
 
690 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  40.52 
 
 
539 aa  109  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  27.41 
 
 
657 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0685  type II and III secretion system protein  24.28 
 
 
423 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  28.29 
 
 
642 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>