More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4246 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 319 aa  652    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  83.6 
 
 		 319 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  80.88 
 
 		 319 aa  528  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  54.46 
 
 		 321 aa  345  5e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  53.31 
 
 		 331 aa  333  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1615  transcriptional regulator  53.14 
 
 		 333 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  51.43 
 
 		 341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  48.26 
 
 		 316 aa  317  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  47.8 
 
 		 344 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  46.84 
 
 		 361 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  49.04 
 
 		 319 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  46.18 
 
 		 348 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  48.24 
 
 		 317 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  44.94 
 
 		 358 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  46.93 
 
 		 327 aa  280  3e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0227  AraC family transcriptional regulator  46.82 
 
 		 324 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  48.57 
 
 		 319 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  45.31 
 
 		 341 aa  272  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  46.96 
 
 		 328 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  49.52 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  46.1 
 
 		 356 aa  265  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  47.95 
 
 		 321 aa  265  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  47.32 
 
 		 341 aa  261  8e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  46.06 
 
 		 321 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  46.06 
 
 		 321 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  46.06 
 
 		 321 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  46.37 
 
 		 348 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  46.06 
 
 		 321 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  45.43 
 
 		 325 aa  246  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 336 aa  245  9e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5148  AraC family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0642429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1145  AraC family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 326 aa  242  6e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480921  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  42.72 
 
 		 341 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  41.69 
 
 		 362 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  42.63 
 
 		 338 aa  239  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  41.38 
 
 		 336 aa  239  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 321 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  45.69 
 
 		 327 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  41.85 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  43.63 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1880  AraC family transcriptional regulator  44.69 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 336 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  41.88 
 
 		 330 aa  233  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 357 aa  232  7.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  41.08 
 
 		 335 aa  229  4e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 322 aa  229  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.82 
 
 		 338 aa  229  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  39.44 
 
 		 334 aa  229  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  42.45 
 
 		 338 aa  227  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 329 aa  226  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  41.93 
 
 		 327 aa  226  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  40.69 
 
 		 334 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  42.54 
 
 		 323 aa  225  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  39.51 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 345 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  39.69 
 
 		 331 aa  222  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 322 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1219  transcriptional regulator  41.61 
 
 		 329 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 		 338 aa  222  6e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 344 aa  222  7e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  38.68 
 
 		 344 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  38.68 
 
 		 345 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  38.68 
 
 		 344 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  41.41 
 
 		 334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  39.81 
 
 		 325 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  39.94 
 
 		 334 aa  219  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2560  transcriptional regulator, AraC family  41.05 
 
 		 333 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  38.36 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  40.06 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  38.36 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  38.36 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  36.05 
 
 		 330 aa  216  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5829  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 338 aa  216  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  40.06 
 
 		 322 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3225  transcriptional regulator, AraC family  40.39 
 
 		 322 aa  216  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448526 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  39.69 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 346 aa  211  9e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  41.61 
 
 		 314 aa  211  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1036  transcriptional regulator  38.94 
 
 		 375 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  41.77 
 
 		 369 aa  208  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  41.77 
 
 		 369 aa  208  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  41.77 
 
 		 374 aa  208  9e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  37.58 
 
 		 349 aa  208  9e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 343 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  40.06 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 346 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  39.35 
 
 		 312 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  40.06 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 346 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 346 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>