More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4244 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  82.87 
 
 		 467 aa  788    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  69.11 
 
 		 467 aa  635    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  70.52 
 
 		 478 aa  671    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4244  major facilitator transporter  100 
 
 		 467 aa  934    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  83.73 
 
 		 479 aa  793    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  69.11 
 
 		 467 aa  635    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4557  major facilitator transporter  70.02 
 
 		 466 aa  631  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00783301 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4092  major facilitator transporter  70.02 
 
 		 466 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal  0.978075 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1116  major facilitator transporter  68.95 
 
 		 466 aa  627  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.10577  normal  0.134 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5602  major facilitator transporter  69.59 
 
 		 466 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.610871 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1490  major facilitator family transporter  70.81 
 
 		 468 aa  625  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3669  major facilitator transporter  69.59 
 
 		 466 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1318  major facilitator family transporter  70.02 
 
 		 468 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4698  major facilitator transporter  69.59 
 
 		 466 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.585046  normal  0.168682 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2505  major facilitator family transporter  69.98 
 
 		 468 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0308  major facilitator family transporter  69.91 
 
 		 474 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1245  major facilitator family transporter  69.91 
 
 		 468 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1325  major facilitator family transporter  69.91 
 
 		 468 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68992  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0983  major facilitator family transporter  69.91 
 
 		 468 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0584  major facilitator family transporter  69.91 
 
 		 474 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3995  major facilitator transporter  68.95 
 
 		 466 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0613817 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  39.7 
 
 		 480 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  39.7 
 
 		 480 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  39.28 
 
 		 480 aa  342  9e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  39.83 
 
 		 480 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  39.83 
 
 		 480 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  38.98 
 
 		 463 aa  316  7e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  36.77 
 
 		 459 aa  310  4e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  37.31 
 
 		 461 aa  309  8e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  38.17 
 
 		 460 aa  307  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0632  general substrate transporter  38.28 
 
 		 471 aa  298  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000142658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5071  major facilitator superfamily MFS_1  36.08 
 
 		 485 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.706796  normal  0.279172 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  37.9 
 
 		 434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0909  major facilitator transporter  36.72 
 
 		 455 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0703326  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 		 451 aa  209  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 447 aa  184  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  31.92 
 
 		 457 aa  179  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 462 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  29.96 
 
 		 451 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  30.79 
 
 		 455 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  31.33 
 
 		 455 aa  177  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 474 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 470 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 474 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 474 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 462 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.46 
 
 		 470 aa  170  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 		 459 aa  169  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 473 aa  169  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.67 
 
 		 468 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  31.94 
 
 		 476 aa  167  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  29.71 
 
 		 459 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.99 
 
 		 472 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 472 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 438 aa  163  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 474 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 		 473 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.56 
 
 		 461 aa  161  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  30.68 
 
 		 478 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  30.68 
 
 		 478 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  30.68 
 
 		 478 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  30.68 
 
 		 478 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  30.68 
 
 		 478 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 473 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  30.68 
 
 		 478 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  30.68 
 
 		 478 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.88 
 
 		 468 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 456 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  30.13 
 
 		 467 aa  156  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 446 aa  156  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 462 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  28.67 
 
 		 456 aa  151  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  28.6 
 
 		 466 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 404 aa  149  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  27.54 
 
 		 450 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.41 
 
 		 474 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 430 aa  146  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 437 aa  143  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  31.19 
 
 		 473 aa  142  9e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 467 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  29.77 
 
 		 526 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 		 446 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  29.75 
 
 		 438 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 		 460 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 450 aa  142  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 468 aa  141  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 459 aa  141  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1969  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 467 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364305  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2580  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 467 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 		 470 aa  140  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30 
 
 		 462 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 459 aa  140  7e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  30.37 
 
 		 449 aa  139  7.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.23 
 
 		 462 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1885  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 454 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.135874  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 444 aa  139  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 		 465 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>