84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4174 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4174  major facilitator transporter  100 
 
 		 433 aa  855    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5278  major facilitator superfamily MFS_1  66.28 
 
 		 444 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804388  normal  0.835878 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1339  major facilitator superfamily sugar efflux pump  68.77 
 
 		 456 aa  484  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6028  major facilitator transporter  58.27 
 
 		 431 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320097  normal  0.669923 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6328  major facilitator transporter  58.78 
 
 		 431 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3289  major facilitator transporter  55.67 
 
 		 431 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4876  major facilitator transporter  55.67 
 
 		 431 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0740  sugar efflux transporter  31.42 
 
 		 399 aa  157  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.797465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  31.59 
 
 		 409 aa  156  9e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446244 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1163  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 415 aa  153  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0194  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 405 aa  153  7e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2427  sugar efflux transporter  30.81 
 
 		 393 aa  150  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2330  sugar efflux transporter  31.85 
 
 		 392 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0046  sugar efflux transporter  29.22 
 
 		 394 aa  146  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0041  sugar efflux transporter  29.22 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3871  sugar efflux transporter C  29.22 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4166  sugar efflux transporter C  29.22 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4014  sugar efflux transporter C  28.95 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03542  predicted sugar efflux system  29.22 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03484  hypothetical protein  29.22 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0618  sugar efflux transporter  29.64 
 
 		 392 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1651  sugar efflux transporter  31.82 
 
 		 392 aa  144  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1922  sugar efflux transporter  30.91 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0164772  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3539  sugar efflux transporter  29.05 
 
 		 393 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2940  sugar efflux transporter A  29.05 
 
 		 393 aa  139  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3409  sugar efflux transporter A  29.05 
 
 		 393 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1233  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0103633  normal  0.340559 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3528  sugar efflux transporter  29.26 
 
 		 392 aa  132  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00071  hypothetical protein  29.34 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00072  broad specificity sugar efflux system  29.34 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0073  major facilitator superfamily sugar transporter  29.26 
 
 		 392 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2537  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224335  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3587  sugar efflux transporter  29.08 
 
 		 392 aa  131  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416053 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0075  sugar efflux transporter A  29.08 
 
 		 392 aa  131  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4114  sugar efflux transporter C  29.02 
 
 		 344 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741083  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2319  sugar efflux transporter B  28.42 
 
 		 393 aa  124  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000297031  hitchhiker  0.00120871 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0792  sugar efflux transporter B  28.42 
 
 		 393 aa  124  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000601589  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3308  sugar efflux transporter B  28.69 
 
 		 393 aa  124  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000181486  normal  0.0175789 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2356  sugar efflux transporter B  29.11 
 
 		 393 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000027927  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02058  hypothetical protein  28.15 
 
 		 393 aa  123  8e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.175397  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2445  sugar efflux transporter B  28.84 
 
 		 393 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000000169528 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02099  lactose/glucose efflux system  28.15 
 
 		 393 aa  123  8e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131835  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1478  sugar efflux transporter  28.15 
 
 		 393 aa  123  8e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000191341  hitchhiker  0.0000212529 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1488  sugar efflux transporter  28.15 
 
 		 393 aa  123  8e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2468  sugar efflux transporter B  28.15 
 
 		 393 aa  123  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000203316  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2308  sugar efflux transporter B  28.15 
 
 		 393 aa  123  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000102092  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2764  sugar efflux transporter  27.74 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.846637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2401  sugar efflux transporter B  28.57 
 
 		 393 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0487824  hitchhiker  0.0000630797 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2559  sugar efflux transporter B  28.57 
 
 		 393 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0168132  hitchhiker  0.000108533 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2447  sugar efflux transporter B  28.57 
 
 		 393 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.018902  normal  0.791409 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0880  hypothetical protein  27.72 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00224194  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0713  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000944208  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0697  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0329  sugar efflux transporter, putative  23.87 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3834  sugar efflux transporter  25.13 
 
 		 371 aa  103  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0064  sugar efflux transporter A  26.85 
 
 		 360 aa  99.4  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2547  major facilitator transporter  22.96 
 
 		 402 aa  98.2  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0783  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374247  normal  0.125612 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1027  hypothetical protein  36.77 
 
 		 160 aa  84.7  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0911644  hitchhiker  0.0000959225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0897  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 403 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00906  major facilitator family protein  22.97 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31250  Major Facilitator Superfamily transporter  29.56 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.229188  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5677  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 407 aa  73.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6253  MFS permease  24.6 
 
 		 402 aa  72.8  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2508  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  hitchhiker  0.00122667 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6620  major facilitator superfamily MFS_1  23.65 
 
 		 399 aa  67  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4655  major facilitator transporter  24.36 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347673  normal  0.129123 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1192  MFS permease  22.25 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.879235  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0009  major facilitator transporter  23.02 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  23.32 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4281  major facilitator superfamily MFS_1  35.14 
 
 		 423 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.502977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  23.63 
 
 		 404 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0397  major facilitator transporter  21.29 
 
 		 415 aa  47.4  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  27.68 
 
 		 397 aa  46.6  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5291  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6796  hypothetical protein  27.23 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356439 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 391 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1664  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 406 aa  43.9  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3039  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 473 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 381 aa  43.1  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 393 aa  43.1  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 393 aa  43.1  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 393 aa  43.1  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>