266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4051 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
319 aa  657  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  2.19811e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  94.04 
 
 
319 aa  629  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  6.73109e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  93.42 
 
 
319 aa  625  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  90.88 
 
 
339 aa  603  1e-172  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  90.57 
 
 
336 aa  601  1e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  90.88 
 
 
319 aa  603  1e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  90.57 
 
 
319 aa  601  1e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  90.25 
 
 
319 aa  602  1e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  90.57 
 
 
339 aa  602  1e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  90.57 
 
 
319 aa  601  1e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  88.99 
 
 
319 aa  597  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  89.62 
 
 
319 aa  598  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  85.22 
 
 
319 aa  577  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  86.21 
 
 
319 aa  564  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  86.21 
 
 
319 aa  564  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  76.73 
 
 
335 aa  519  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  76.73 
 
 
335 aa  519  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  69.94 
 
 
321 aa  473  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  68.29 
 
 
329 aa  466  1e-130  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  64.04 
 
 
318 aa  416  1e-115  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  64.04 
 
 
318 aa  416  1e-115  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  64.04 
 
 
318 aa  416  1e-115  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  64.04 
 
 
318 aa  416  1e-115  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  64.04 
 
 
318 aa  416  1e-115  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  64.04 
 
 
318 aa  416  1e-115  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  64.04 
 
 
318 aa  416  1e-115  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  63.61 
 
 
318 aa  416  1e-115  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  60.69 
 
 
321 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  60.25 
 
 
321 aa  404  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  59.87 
 
 
317 aa  398  1e-110  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  58.93 
 
 
317 aa  400  1e-110  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  58.62 
 
 
318 aa  400  1e-110  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  59.75 
 
 
319 aa  396  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  1.47099e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  58.62 
 
 
316 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  58.31 
 
 
316 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  59.25 
 
 
319 aa  391  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  57.37 
 
 
317 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  56.92 
 
 
318 aa  385  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  57.86 
 
 
332 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  55.17 
 
 
316 aa  372  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  53.92 
 
 
316 aa  358  9e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  53.77 
 
 
316 aa  355  5e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  63.64 
 
 
264 aa  320  1e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  48.58 
 
 
321 aa  314  1e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1920  beta-lactamase domain protein  47.98 
 
 
320 aa  295  8e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3778  beta-lactamase domain-containing protein  46.11 
 
 
319 aa  293  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1866  beta-lactamase domain protein  47.98 
 
 
320 aa  288  8e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.914687  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0775  beta-lactamase domain-containing protein  47.52 
 
 
319 aa  287  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  44.72 
 
 
319 aa  276  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0813  beta-lactamase domain protein  43.57 
 
 
322 aa  249  3e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  35 
 
 
298 aa  141  2e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.1498e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
299 aa  139  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  31.37 
 
 
302 aa  127  2e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
312 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  31.53 
 
 
287 aa  116  4e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1709  beta-lactamase-like  30.12 
 
 
353 aa  110  4e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  31.33 
 
 
318 aa  107  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  36.13 
 
 
323 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  28.99 
 
 
332 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  28.14 
 
 
438 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  30.08 
 
 
318 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  29.46 
 
 
321 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  29.24 
 
 
305 aa  102  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  31.05 
 
 
308 aa  101  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  29.06 
 
 
318 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  30.08 
 
 
318 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  31.02 
 
 
333 aa  99.8  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3400  beta-lactamase domain-containing protein  25.84 
 
 
292 aa  99  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.386e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  33.51 
 
 
315 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 
321 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  27.39 
 
 
362 aa  95.1  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  29.06 
 
 
304 aa  93.6  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  24.9 
 
 
300 aa  93.6  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  28.79 
 
 
342 aa  93.2  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  30.42 
 
 
364 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  30.34 
 
 
313 aa  92.8  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  27.14 
 
 
312 aa  92.4  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  25.87 
 
 
300 aa  92.4  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  27 
 
 
318 aa  92.4  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  30.42 
 
 
364 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  28.05 
 
 
271 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  28.22 
 
 
318 aa  90.9  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  30.64 
 
 
337 aa  91.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  29.66 
 
 
319 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  28.11 
 
 
312 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  26.01 
 
 
310 aa  90.9  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  34.1 
 
 
310 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
312 aa  87  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1030  metallo-beta-lactamase family protein  27.57 
 
 
282 aa  85.9  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00771484  hitchhiker  0.000295307 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  28.21 
 
 
309 aa  85.9  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  31.53 
 
 
308 aa  85.1  1e-15  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  28.39 
 
 
314 aa  85.5  1e-15  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  28.81 
 
 
307 aa  84.7  2e-15  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  28.81 
 
 
307 aa  84.7  2e-15  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  27.38 
 
 
330 aa  85.1  2e-15  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  27.12 
 
 
644 aa  84.7  2e-15  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  33.76 
 
 
325 aa  83.6  4e-15  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  30.17 
 
 
313 aa  83.6  4e-15  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  27.91 
 
 
315 aa  83.6  4e-15  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  28.86 
 
 
331 aa  83.2  5e-15  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0153941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>