More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4038 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  37.08 
 
 
3470 aa  841    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4220  non-ribosomal peptide synthetase  34.51 
 
 
2628 aa  640    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.663079 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  35.29 
 
 
2174 aa  777    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  38.92 
 
 
4317 aa  785    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  36.24 
 
 
5953 aa  783    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  37.78 
 
 
6889 aa  830    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2785  amino acid adenylation domain-containing protein  42.95 
 
 
1370 aa  729    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.178611 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  35.34 
 
 
4336 aa  822    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  34.6 
 
 
2573 aa  743    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  29.41 
 
 
2193 aa  711    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  35.81 
 
 
2151 aa  838    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  34.03 
 
 
2875 aa  642    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  32.55 
 
 
3291 aa  801    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  35.42 
 
 
3331 aa  720    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  34.08 
 
 
3432 aa  732    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  39.43 
 
 
4317 aa  786    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  36.17 
 
 
4342 aa  806    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  31.93 
 
 
2581 aa  768    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  33.77 
 
 
6176 aa  659    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1180  non-ribosomal peptide synthetase, putative  59.6 
 
 
1732 aa  1800    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  32.11 
 
 
4960 aa  774    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  36.32 
 
 
5230 aa  819    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1881  amino acid adenylation domain-containing protein  33.07 
 
 
1689 aa  672    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  38.56 
 
 
4136 aa  717    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  36.26 
 
 
8914 aa  769    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  35.81 
 
 
4336 aa  824    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1957  amino acid adenylation  38.52 
 
 
1136 aa  648    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  36.23 
 
 
2845 aa  678    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  37.36 
 
 
2154 aa  850    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  34.76 
 
 
2883 aa  649    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  32.75 
 
 
5926 aa  643    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  34.91 
 
 
9498 aa  740    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  37.67 
 
 
3432 aa  737    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  34.68 
 
 
13537 aa  764    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  35.75 
 
 
6676 aa  778    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  36.32 
 
 
6081 aa  772    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  31.76 
 
 
2867 aa  652    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  39.47 
 
 
5213 aa  785    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  28.36 
 
 
4196 aa  658    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  33.33 
 
 
3308 aa  823    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  32.94 
 
 
3498 aa  786    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  33.09 
 
 
2033 aa  640    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25560  Non-ribosomal peptide synthase, PvdD-like protein  39.73 
 
 
2878 aa  808    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  31.89 
 
 
4960 aa  764    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  40.68 
 
 
5467 aa  691    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1943  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaI  59.54 
 
 
1741 aa  1796    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2088  pyoverdine synthetase D  59.42 
 
 
1739 aa  1804    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.393572  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  35.83 
 
 
3942 aa  704    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4086  amino acid adenylation domain-containing protein  36.84 
 
 
2155 aa  852    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  35.43 
 
 
6072 aa  743    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  33.88 
 
 
2137 aa  648    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  30.08 
 
 
3086 aa  697    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  36.65 
 
 
5654 aa  719    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  36.67 
 
 
4502 aa  893    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1597  amino acid adenylation domain-containing protein  59.65 
 
 
1658 aa  1680    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026449 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  35.27 
 
 
4882 aa  694    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  35.75 
 
 
6661 aa  748    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4073  amino acid adenylation domain protein  61.4 
 
 
1674 aa  1876    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  35.26 
 
 
4332 aa  815    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  32.61 
 
 
1569 aa  733    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4787  amino acid adenylation  58.68 
 
 
1663 aa  1682    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177872  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  39.54 
 
 
4991 aa  885    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  39.99 
 
 
4037 aa  866    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1830  amino acid adenylation  40.54 
 
 
1138 aa  760    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  41.29 
 
 
1801 aa  775    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4038  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 
1659 aa  3298    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2417  non-ribosomal peptide synthetase, putative  56.96 
 
 
1772 aa  1183    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  31.9 
 
 
1550 aa  758    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  37.08 
 
 
3639 aa  705    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  35.34 
 
 
4489 aa  676    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4084  amino acid adenylation domain-containing protein  38.42 
 
 
1114 aa  685    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85613  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1559  amino acid adenylation domain-containing protein  58.48 
 
 
1669 aa  1643    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.203226  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  34.32 
 
 
7785 aa  657    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0526  non-ribosomal peptide synthetase  61.15 
 
 
1675 aa  1883    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  36.32 
 
 
2370 aa  734    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1161  amino acid adenylation  58.78 
 
 
1662 aa  1718    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1928  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaI  59.29 
 
 
1745 aa  1798    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.361647  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  38.81 
 
 
4317 aa  783    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1538  amino acid adenylation domain-containing protein  58.92 
 
 
1670 aa  1636    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  35.67 
 
 
2606 aa  645    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  31.1 
 
 
1556 aa  685    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  35.7 
 
 
4342 aa  796    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  39.08 
 
 
5149 aa  748    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  38.21 
 
 
2189 aa  923    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  37.63 
 
 
2448 aa  887    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0874  putative non-ribosomal peptide synthetase  59.6 
 
 
1732 aa  1800    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267769  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  32.88 
 
 
2561 aa  638    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1641  amino acid adenylation domain-containing protein  58.78 
 
 
1662 aa  1718    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515371  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1616  amino acid adenylation domain-containing protein  58.85 
 
 
1665 aa  1682    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0177803 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  37.84 
 
 
5328 aa  909    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  36.2 
 
 
2125 aa  715    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  32.13 
 
 
4968 aa  771    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  40.57 
 
 
2651 aa  736    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  33.23 
 
 
2571 aa  657    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  35.49 
 
 
5596 aa  738    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1624  putative non-ribosomal peptide synthetase  59.54 
 
 
1732 aa  1796    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0134366  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  38.24 
 
 
3404 aa  703    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2093  amino acid adenylation domain-containing protein  26.95 
 
 
2410 aa  640    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1675  amino acid adenylation domain-containing protein  40 
 
 
1129 aa  689    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0287  putative non-ribosomal peptide synthetase  59.6 
 
 
1732 aa  1800    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0997015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>