More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3899 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  68.61 
 
 		 743 aa  996    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  69.68 
 
 		 846 aa  940    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  72.69 
 
 		 888 aa  1063    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  72.75 
 
 		 844 aa  1078    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  72.75 
 
 		 844 aa  1078    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 821 aa  1678    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  73.11 
 
 		 839 aa  1076    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  66.42 
 
 		 698 aa  941    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  69.75 
 
 		 850 aa  1105    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  50 
 
 		 783 aa  638    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  72.62 
 
 		 928 aa  1076    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  62.76 
 
 		 846 aa  921    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  65.48 
 
 		 810 aa  934    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  67.71 
 
 		 742 aa  990    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  72.03 
 
 		 862 aa  1101    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  62.35 
 
 		 846 aa  918    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  72.01 
 
 		 858 aa  1091    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  74.01 
 
 		 787 aa  1045    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  67.09 
 
 		 787 aa  992    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  61.67 
 
 		 678 aa  793    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  60.55 
 
 		 675 aa  803    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  67.19 
 
 		 801 aa  942    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  74.38 
 
 		 838 aa  1164    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  72.52 
 
 		 826 aa  1056    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  65.84 
 
 		 732 aa  973    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  68.04 
 
 		 743 aa  989    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  71.59 
 
 		 857 aa  1073    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  73.15 
 
 		 857 aa  1099    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  72.89 
 
 		 844 aa  1070    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  63.9 
 
 		 841 aa  896    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  71.6 
 
 		 834 aa  1139    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2065  glycosyl transferase family protein  60.24 
 
 		 686 aa  808    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  72.75 
 
 		 844 aa  1078    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  73.29 
 
 		 870 aa  1098    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  65.84 
 
 		 728 aa  964    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  73.11 
 
 		 839 aa  1075    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  71.59 
 
 		 857 aa  1073    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  68.04 
 
 		 743 aa  989    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  38.72 
 
 		 850 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  38.55 
 
 		 743 aa  464  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  39.91 
 
 		 774 aa  461  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  39.22 
 
 		 750 aa  458  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  38.86 
 
 		 762 aa  431  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  38.96 
 
 		 730 aa  431  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  36.97 
 
 		 854 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  39.25 
 
 		 755 aa  425  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  38.65 
 
 		 752 aa  425  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  37.9 
 
 		 740 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  36.45 
 
 		 786 aa  422  1e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  37.52 
 
 		 760 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  35.49 
 
 		 815 aa  418  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  35.4 
 
 		 762 aa  410  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  35.96 
 
 		 772 aa  406  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  36.1 
 
 		 794 aa  401  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  37.1 
 
 		 907 aa  402  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  35.8 
 
 		 767 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  33.93 
 
 		 768 aa  402  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  34.33 
 
 		 759 aa  402  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  33.06 
 
 		 786 aa  394  1e-108  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  34.38 
 
 		 785 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  36.02 
 
 		 765 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  34.91 
 
 		 773 aa  383  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  33.19 
 
 		 776 aa  364  4e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  33.33 
 
 		 809 aa  330  8e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  31.63 
 
 		 792 aa  323  8e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  32.12 
 
 		 797 aa  321  3e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  32.77 
 
 		 797 aa  320  9e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1972  1A family penicillin-binding protein  32.26 
 
 		 839 aa  320  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125323  normal  0.0456782 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6131  penicillin-binding protein 1A  32.17 
 
 		 839 aa  319  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1948  1A family penicillin-binding protein  32.17 
 
 		 839 aa  319  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135129  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  34.95 
 
 		 661 aa  318  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  32.28 
 
 		 791 aa  319  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  32.16 
 
 		 794 aa  318  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1961  putative penicillin-binding (peptidoglycan synthetase) transmembrane protein, mrcA  32.14 
 
 		 836 aa  319  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.935067  normal  0.0226413 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  32.3 
 
 		 779 aa  318  3e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5259  penicillin-binding protein 1A  31.89 
 
 		 838 aa  318  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000072806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  30.98 
 
 		 771 aa  316  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  31.74 
 
 		 824 aa  314  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1862  1A family penicillin-binding protein  31.09 
 
 		 839 aa  314  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.000000145704  hitchhiker  0.0000925337 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  35.47 
 
 		 646 aa  313  6.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1268  1A family penicillin-binding protein  32.17 
 
 		 786 aa  313  7.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00608444  normal  0.905221 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  30.62 
 
 		 804 aa  312  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  33.2 
 
 		 819 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1321  1A family penicillin-binding protein  31 
 
 		 837 aa  310  5e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000393559 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1935  1A family penicillin-binding protein  30.9 
 
 		 839 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000247834  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  32.13 
 
 		 766 aa  309  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0274  penicillin-binding protein, 1A family  33.05 
 
 		 790 aa  303  9e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.565405  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  29.87 
 
 		 805 aa  302  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  30.6 
 
 		 777 aa  301  2e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  33.33 
 
 		 679 aa  300  9e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0024  penicillin-binding protein, 1A family  31.47 
 
 		 802 aa  299  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  35.32 
 
 		 648 aa  299  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  30.11 
 
 		 823 aa  299  1e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  32.52 
 
 		 810 aa  298  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  30.54 
 
 		 748 aa  297  5e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  30.59 
 
 		 777 aa  296  7e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  30.59 
 
 		 777 aa  296  9e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  30.69 
 
 		 801 aa  296  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1139  penicillin-binding protein, 1A family  30.78 
 
 		 774 aa  296  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0388878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  32.47 
 
 		 648 aa  293  7e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>