174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3871 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4299  hypothetical protein  85.04 
 
 
254 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.293361  normal  0.44964 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0627  hypothetical protein  85.04 
 
 
254 aa  435  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  80.31 
 
 
251 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1913  sugar nucleotidyltransferase-like  78.6 
 
 
255 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4017  sugar nucleotidyltransferase-like protein  78.21 
 
 
255 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3536  sugar nucleotidyltransferase-like protein  78.21 
 
 
255 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3397  sugar nucleotidyltransferase-like protein  78.21 
 
 
255 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4244  sugar nucleotidyltransferases-like  78.21 
 
 
255 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4122  sugar nucleotidyltransferases-like protein  78.21 
 
 
255 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282311  normal  0.65781 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4470  sugar nucleotidyltransferase-like protein  77.43 
 
 
255 aa  381  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.75477  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1767  hypothetical protein  76.65 
 
 
255 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2067  ADP-glucose pyrophosphorylase  77.04 
 
 
255 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0757  hypothetical protein  76.65 
 
 
260 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1050  hypothetical protein  76.65 
 
 
255 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0781  hypothetical protein  77.04 
 
 
255 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0692  hypothetical protein  76.65 
 
 
255 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2025  hypothetical protein  76.65 
 
 
255 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458858  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1907  hypothetical protein  75.88 
 
 
255 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1318  hypothetical protein  51.82 
 
 
256 aa  252  3e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  32.68 
 
 
250 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  30.13 
 
 
241 aa  99  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  30.67 
 
 
256 aa  85.1  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  27.2 
 
 
232 aa  81.6  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  32.32 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  27.39 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  31.4 
 
 
263 aa  76.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  28.74 
 
 
246 aa  75.5  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  29.25 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  28.4 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  22.93 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0726  transferase, putative  27.87 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1415  nucleotidyl transferase/aminotransferase, class V  26.19 
 
 
616 aa  68.2  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  24.8 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  24.12 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  28.57 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  22.09 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5681  nucleotidyl transferase  31.25 
 
 
242 aa  65.1  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  23.02 
 
 
630 aa  64.3  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  31.5 
 
 
237 aa  62  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  23.86 
 
 
247 aa  61.6  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000014669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0891  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  28.4 
 
 
230 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  29.92 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1841  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  26.36 
 
 
225 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  25.52 
 
 
254 aa  59.3  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0438  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  27.35 
 
 
224 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1212  di-myo-inositol-1,3'-phosphate-1'-phosphate synthase / CTP:L-myo-inositol-1-phosphate cytidylyltransferase  29.18 
 
 
436 aa  59.3  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  26.32 
 
 
244 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  24.9 
 
 
256 aa  58.5  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0738  Nucleotidyl transferase  37.69 
 
 
346 aa  58.2  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0293389  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  23.27 
 
 
249 aa  58.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12410  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  26.47 
 
 
603 aa  58.2  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  31.36 
 
 
227 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  31.36 
 
 
227 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  33.07 
 
 
254 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  25.51 
 
 
243 aa  56.6  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  34.34 
 
 
522 aa  56.2  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2534  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  25.51 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398326  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.24 
 
 
428 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  31.5 
 
 
400 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  44.83 
 
 
595 aa  53.1  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4442  Nucleotidyl transferase  39.73 
 
 
306 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.876023  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4108  Nucleotidyl transferase  25 
 
 
243 aa  52.4  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0093  sugar nucleotidyltransferase-like protein  34.43 
 
 
226 aa  52  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3392  transferase, putative  27.07 
 
 
253 aa  52  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05586  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (EC 2.7.7.13)(GTP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase)(GDP-mannose pyrophosphorylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B1J4]  34.18 
 
 
364 aa  51.6  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44310  nucleotidyltransferase family protein  28.09 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.918845  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  23.53 
 
 
263 aa  51.6  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0843  nucleotidyl transferase  28.7 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000793597 
 
 
-
 
NC_002936  DET0205  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  41.94 
 
 
236 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03020  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  37.31 
 
 
364 aa  50.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  29.82 
 
 
349 aa  50.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  30.71 
 
 
400 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1992  aminoglycoside phosphotransferase  34.82 
 
 
581 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.775829  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  33.62 
 
 
222 aa  50.1  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1652  nucleotidyl transferase  34.48 
 
 
232 aa  50.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0175  nucleotidyl transferase  46.15 
 
 
234 aa  50.1  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.340342  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 
596 aa  50.1  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  30 
 
 
400 aa  49.7  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3804  nucleotidyl transferase  32.54 
 
 
305 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.305091  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50310  sugar nucleotidyltransferase  35.09 
 
 
220 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000057924  hitchhiker  0.000309665 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  27.78 
 
 
348 aa  49.3  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  27.48 
 
 
592 aa  49.3  0.00006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3244  nucleotidyl transferase  33.62 
 
 
243 aa  48.9  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0148  nucleotidyl transferase  40.32 
 
 
236 aa  48.9  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  40.68 
 
 
590 aa  48.9  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1173  hypothetical protein  27.1 
 
 
237 aa  48.9  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0210885  normal  0.86006 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  32.35 
 
 
222 aa  48.9  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3436  nucleotidyl transferase  43.08 
 
 
253 aa  48.5  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.604999  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1188  phosphotransferase enzyme family protein  40.35 
 
 
619 aa  48.5  0.00009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1164  sugar nucleotidyltransferases-like protein  25 
 
 
294 aa  48.5  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74665  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (ATP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase) (CASRB1)  32.91 
 
 
362 aa  48.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  41.38 
 
 
589 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0722  nucleotidyltransferase family protein  24.7 
 
 
243 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.646872  normal  0.0100327 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  27.07 
 
 
411 aa  47.4  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0197  hypothetical protein  30.77 
 
 
219 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.950311  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0109  nucleotidyl transferase family protein  37.5 
 
 
219 aa  47  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00238886  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5632  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  34.21 
 
 
240 aa  47  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5598  histidinol-phosphate phosphatase family protein  32.76 
 
 
649 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  37.5 
 
 
219 aa  47  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>