More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3864 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3864  threonine dehydratase  100 
 
 
330 aa  651    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0056  threonine dehydratase  75.7 
 
 
344 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.595  hitchhiker  0.00751641 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6145  threonine dehydratase  70.95 
 
 
323 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5774  threonine dehydratase  70.28 
 
 
323 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154998  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6018  threonine dehydratase  69.97 
 
 
323 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5805  threonine dehydratase  72.45 
 
 
323 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6169  threonine dehydratase  72.45 
 
 
323 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0794807  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6650  threonine dehydratase  72.14 
 
 
323 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.987033  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2151  threonine dehydratase  71.88 
 
 
319 aa  396  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.232832  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4430  threonine dehydratase  57.49 
 
 
330 aa  349  3e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000773933 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3469  threonine dehydratase  59.56 
 
 
324 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4376  ectoine utilization protein EutB  61.47 
 
 
325 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5240  threonine dehydratase  58.2 
 
 
333 aa  328  8e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.303967 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3695  threonine dehydratase  56.74 
 
 
334 aa  320  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5519  threonine dehydratase  57.37 
 
 
333 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0114285 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000638  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme beta subunit  51.96 
 
 
324 aa  290  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0285  threonine dehydratase  56.21 
 
 
318 aa  280  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.832074  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2723  threonine dehydratase  54.45 
 
 
331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3175  threonine dehydratase  56.72 
 
 
318 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.465407  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  41.25 
 
 
405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  39.38 
 
 
403 aa  215  7e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  41.43 
 
 
403 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  35.9 
 
 
402 aa  206  6e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  35.9 
 
 
402 aa  205  7e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  40.31 
 
 
403 aa  205  8e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  37.46 
 
 
401 aa  203  3e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  39.18 
 
 
402 aa  202  5e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  35.51 
 
 
403 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  41.98 
 
 
415 aa  200  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  37.93 
 
 
402 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  39.41 
 
 
418 aa  199  3.9999999999999996e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  34.89 
 
 
403 aa  199  6e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  41.74 
 
 
403 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  43.67 
 
 
402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  42.48 
 
 
402 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  34.89 
 
 
403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  34.58 
 
 
403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  41.69 
 
 
506 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  41.12 
 
 
403 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  41.69 
 
 
506 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0405  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.43 
 
 
315 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0956264  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  41.23 
 
 
403 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  34.38 
 
 
404 aa  192  8e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  42.24 
 
 
411 aa  192  9e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.05 
 
 
320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  39.05 
 
 
408 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  44.3 
 
 
404 aa  190  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  40.45 
 
 
414 aa  190  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  40.38 
 
 
403 aa  189  5e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1939  threonine dehydratase  40.31 
 
 
410 aa  189  5e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  41.23 
 
 
402 aa  188  9e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  40.63 
 
 
403 aa  188  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  40 
 
 
358 aa  188  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  40.25 
 
 
403 aa  187  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  40.63 
 
 
412 aa  187  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  34.98 
 
 
403 aa  187  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  38.73 
 
 
412 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  42.77 
 
 
402 aa  187  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  41.38 
 
 
410 aa  186  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  34.37 
 
 
403 aa  185  7e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0128  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.95 
 
 
343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  40 
 
 
402 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  37.34 
 
 
509 aa  182  9.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2325  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.87 
 
 
333 aa  182  9.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213895 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  38.19 
 
 
520 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1720  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.75 
 
 
330 aa  181  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  35.99 
 
 
395 aa  180  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  35.8 
 
 
400 aa  181  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.87 
 
 
332 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  40.51 
 
 
416 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  37.22 
 
 
503 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  36.79 
 
 
514 aa  180  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  39.25 
 
 
401 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  39.25 
 
 
401 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1763  threonine dehydratase, biosynthetic  39.75 
 
 
512 aa  179  8e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  42.07 
 
 
404 aa  179  8e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3319  threonine dehydratase  42.32 
 
 
410 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.813213  normal  0.377065 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1467  threonine dehydratase  41.01 
 
 
403 aa  177  2e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.912465  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  36.54 
 
 
401 aa  177  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  41.48 
 
 
406 aa  177  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1498  threonine dehydratase  42.63 
 
 
421 aa  176  3e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  42.04 
 
 
401 aa  176  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0057  threonine dehydratase  42.06 
 
 
410 aa  176  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.835911  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  36.99 
 
 
509 aa  176  7e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  34.78 
 
 
408 aa  176  7e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  39.75 
 
 
403 aa  176  7e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31740  predicted protein  39.81 
 
 
468 aa  174  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.414163 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  35.78 
 
 
507 aa  174  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  37.74 
 
 
507 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  38.66 
 
 
399 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  41.23 
 
 
412 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3081  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.83 
 
 
320 aa  172  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  39.22 
 
 
412 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3564  threonine dehydratase  39.06 
 
 
329 aa  172  6.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  36.22 
 
 
531 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  38.17 
 
 
411 aa  172  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1177  threonine dehydratase  38.19 
 
 
523 aa  171  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  40.32 
 
 
443 aa  171  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  41.51 
 
 
407 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0961  threonine dehydratase  40.94 
 
 
404 aa  172  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.569986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>