More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3825 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 559 aa  1122    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  57.56 
 
 		 546 aa  589  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  56.74 
 
 		 545 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  55.18 
 
 		 545 aa  565  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  55.99 
 
 		 545 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  55.81 
 
 		 545 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  52.8 
 
 		 588 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  58.08 
 
 		 571 aa  536  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  57.01 
 
 		 600 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  57.79 
 
 		 496 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  57.31 
 
 		 573 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  60.93 
 
 		 593 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4231  TPR repeat-containing protein  53.01 
 
 		 536 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  39.86 
 
 		 611 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  44.3 
 
 		 607 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0955  TPR domain-containing protein  44.49 
 
 		 705 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497218  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0462  TPR domain-containing protein  46.88 
 
 		 711 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317996  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2044  TPR domain-containing protein  46.67 
 
 		 598 aa  333  5e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1949  TPR repeat-containing protein  46.67 
 
 		 598 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.411479  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  37.93 
 
 		 703 aa  258  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  34.16 
 
 		 1038 aa  250  5e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.51 
 
 		 689 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 		 523 aa  244  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  34.76 
 
 		 602 aa  230  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  38.36 
 
 		 601 aa  230  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  35.02 
 
 		 740 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  35.52 
 
 		 608 aa  224  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  34.36 
 
 		 1450 aa  221  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.66 
 
 		 1034 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 1827 aa  219  7.999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  36.1 
 
 		 577 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  34.19 
 
 		 747 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 		 767 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 		 574 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 3145 aa  217  4e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 688 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1568  TPR repeat-containing protein  38.15 
 
 		 487 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  34.19 
 
 		 1005 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  34.95 
 
 		 473 aa  211  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  33.54 
 
 		 578 aa  209  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 		 529 aa  206  7e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  36.12 
 
 		 615 aa  206  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 542 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  39.42 
 
 		 747 aa  203  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 		 592 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 		 653 aa  201  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  30.14 
 
 		 653 aa  201  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  34.05 
 
 		 626 aa  199  9e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1218  hypothetical protein  34.47 
 
 		 602 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  32.13 
 
 		 1764 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 		 556 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 520 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 		 438 aa  197  5.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  32.96 
 
 		 457 aa  197  6e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 620 aa  196  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  29.85 
 
 		 615 aa  196  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2766  Tetratricopeptide TPR_4  35.75 
 
 		 492 aa  195  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  33.26 
 
 		 472 aa  194  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  32.3 
 
 		 620 aa  193  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5711  Tetratricopeptide TPR_2 domain-containing protein  34.57 
 
 		 488 aa  193  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  34.32 
 
 		 872 aa  193  8e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3327  hypothetical protein  34.42 
 
 		 602 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.65009 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1361  hypothetical protein  33.05 
 
 		 499 aa  192  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.995153  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 780 aa  189  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  30.38 
 
 		 550 aa  188  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  32.79 
 
 		 648 aa  188  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 		 639 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  29.85 
 
 		 1677 aa  188  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.37 
 
 		 760 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  33.27 
 
 		 612 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  32.49 
 
 		 527 aa  187  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  33.53 
 
 		 626 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 		 614 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 614 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  33.53 
 
 		 614 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 714 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  33.53 
 
 		 614 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 		 614 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  33.46 
 
 		 626 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 484 aa  185  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  31.95 
 
 		 662 aa  184  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  29.7 
 
 		 1077 aa  184  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  38.66 
 
 		 1212 aa  183  8.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  33.79 
 
 		 935 aa  183  8.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 637 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 636 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 		 955 aa  181  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 546 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 646 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 		 649 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 		 649 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  32.44 
 
 		 505 aa  180  5.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1516  TPR domain-containing protein  35.28 
 
 		 360 aa  179  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  31.38 
 
 		 714 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  32.68 
 
 		 637 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 		 595 aa  178  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  35.33 
 
 		 387 aa  177  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.47 
 
 		 454 aa  177  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 502 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  35.13 
 
 		 360 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>