More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3808 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  67.78 
 
 
574 aa  764    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
578 aa  1173    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  68.98 
 
 
577 aa  758    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  41.5 
 
 
1827 aa  425  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  44.08 
 
 
608 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  41.29 
 
 
740 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  41.49 
 
 
523 aa  358  9.999999999999999e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  39.89 
 
 
747 aa  351  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  39.52 
 
 
1038 aa  330  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  39.82 
 
 
767 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  39.18 
 
 
648 aa  322  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  37.48 
 
 
1450 aa  320  5e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  37.39 
 
 
601 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  36.94 
 
 
3145 aa  317  3e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  37.54 
 
 
602 aa  317  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  38.38 
 
 
747 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  41.2 
 
 
542 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  36.2 
 
 
620 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  36.49 
 
 
620 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.31 
 
 
689 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  38.39 
 
 
520 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  37.01 
 
 
615 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.09 
 
 
454 aa  306  5.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.02 
 
 
760 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  38.31 
 
 
703 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  43.18 
 
 
529 aa  303  6.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  36.85 
 
 
688 aa  302  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.89 
 
 
1034 aa  300  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  37.84 
 
 
639 aa  298  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  40 
 
 
438 aa  296  5e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  36.43 
 
 
714 aa  293  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  41.1 
 
 
1005 aa  293  6e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  38.08 
 
 
626 aa  291  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  39.36 
 
 
556 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  37.27 
 
 
612 aa  287  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  37.1 
 
 
636 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  36.77 
 
 
935 aa  281  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  35.76 
 
 
955 aa  281  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  35.33 
 
 
615 aa  281  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  36.47 
 
 
626 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  36.47 
 
 
614 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  35.64 
 
 
714 aa  280  7e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  36.3 
 
 
626 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  36.3 
 
 
614 aa  277  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  36.93 
 
 
484 aa  277  4e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  36.3 
 
 
614 aa  277  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  36.3 
 
 
614 aa  277  4e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  39.83 
 
 
472 aa  276  8e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
653 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  33.33 
 
 
653 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  36.75 
 
 
1764 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  36.41 
 
 
614 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  36.12 
 
 
611 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  40.31 
 
 
473 aa  274  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 
662 aa  273  5.000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  35.81 
 
 
637 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  35.95 
 
 
635 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  35.95 
 
 
635 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  38.49 
 
 
540 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  31.55 
 
 
681 aa  259  8e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  31.01 
 
 
603 aa  259  8e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  40.69 
 
 
412 aa  256  9e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  40.74 
 
 
636 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  32.3 
 
 
1677 aa  253  9.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  36.56 
 
 
527 aa  252  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 
592 aa  251  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 
637 aa  250  6e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  33.45 
 
 
607 aa  248  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.43 
 
 
545 aa  246  9e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  34.55 
 
 
546 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  44.51 
 
 
387 aa  244  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 
457 aa  244  3e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  36.04 
 
 
646 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  35.24 
 
 
780 aa  244  3e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  34.6 
 
 
550 aa  243  6e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  34.9 
 
 
649 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  34.9 
 
 
649 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  42.62 
 
 
1212 aa  243  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0550  TPR repeat-containing protein  34.46 
 
 
595 aa  237  4e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  37.12 
 
 
872 aa  233  6e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 
611 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  33.33 
 
 
1077 aa  231  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 
545 aa  231  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  37.82 
 
 
545 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 
583 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 
1454 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 
1451 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  35.18 
 
 
545 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  36.16 
 
 
588 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  35.76 
 
 
558 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 
571 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  36.14 
 
 
573 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  35.97 
 
 
496 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  35.97 
 
 
600 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0115  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 
579 aa  213  7.999999999999999e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.165397  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 
546 aa  213  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  40.96 
 
 
389 aa  211  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 
559 aa  209  8e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  37.06 
 
 
1073 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  33.71 
 
 
503 aa  208  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>