More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3712 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3712  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 450 aa  896    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.40893 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  71.14 
 
 		 402 aa  568  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5856  secretion protein HlyD  71.02 
 
 		 425 aa  545  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249167  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3403  HlyD family secretion protein  72.82 
 
 		 401 aa  531  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00376035  normal  0.420161 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  70.82 
 
 		 401 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140483  hitchhiker  0.000000766037 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0207  RND family efflux transporter MFP subunit  71.32 
 
 		 400 aa  519  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000100142 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2802  secretion protein HlyD  70.32 
 
 		 401 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0223  RND family efflux transporter MFP subunit  70.82 
 
 		 401 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0304  RND family efflux transporter MFP subunit  70.32 
 
 		 401 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0231  RND family efflux transporter MFP subunit  70.57 
 
 		 401 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2408  secretion protein HlyD  50.12 
 
 		 404 aa  361  1e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000198894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1456  RND family efflux transporter MFP subunit  49.51 
 
 		 405 aa  353  4e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.03 
 
 		 404 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2213  secretion protein HlyD  48.51 
 
 		 407 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.03 
 
 		 405 aa  335  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1983  RND family efflux transporter MFP subunit  48.52 
 
 		 416 aa  331  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  48.64 
 
 		 404 aa  326  6e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2520  RND family efflux transporter MFP subunit  41.93 
 
 		 406 aa  277  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0631  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.01 
 
 		 432 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.137352 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  37.65 
 
 		 405 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  34.15 
 
 		 407 aa  189  7e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03344  acriflavin resistance protein  33.25 
 
 		 417 aa  176  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0254  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.07 
 
 		 417 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.513446 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1756  acriflavin resistance protein  31.46 
 
 		 363 aa  151  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0637221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0820  secretion protein HlyD family protein  33.99 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.495738  hitchhiker  0.000581546 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.25 
 
 		 377 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  28.06 
 
 		 376 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2020  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 		 357 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.519564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  24.69 
 
 		 451 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08701  membrane fusion protein  29.46 
 
 		 392 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0266  acriflavin resistance protein  40.24 
 
 		 212 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.62 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.21 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.104068  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  28.18 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0963  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.73 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0174638  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.28 
 
 		 453 aa  104  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3608  secretion protein HlyD  29.79 
 
 		 400 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221607  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.34 
 
 		 414 aa  103  7e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  29.13 
 
 		 405 aa  102  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0770  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.25 
 
 		 399 aa  101  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0433625  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0321  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30 
 
 		 386 aa  100  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0987  secretion protein HlyD  25.12 
 
 		 419 aa  100  5e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  27.3 
 
 		 357 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2583  secretion protein HlyD family protein  29.84 
 
 		 437 aa  100  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.860708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.85 
 
 		 404 aa  99.8  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  27.73 
 
 		 370 aa  100  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.48 
 
 		 432 aa  100  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 429 aa  98.6  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2811  RND family efflux transporter MFP subunit  30.06 
 
 		 444 aa  99  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4616  secretion protein HlyD  27.63 
 
 		 414 aa  97.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  29.43 
 
 		 408 aa  95.9  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0747  secretion protein HlyD  26.86 
 
 		 357 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.554021  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1334  secretion protein HlyD  26.01 
 
 		 410 aa  95.1  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  26.67 
 
 		 403 aa  95.5  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.06 
 
 		 432 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1955  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.36 
 
 		 400 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159137  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3628  secretion protein HlyD  29.54 
 
 		 361 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  29.11 
 
 		 408 aa  93.6  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  27.69 
 
 		 384 aa  92.8  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1392  RND efflux system membrane fusion protein  26.38 
 
 		 419 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0449025  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1596  secretion protein HlyD family protein  25.68 
 
 		 420 aa  93.2  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0836964  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2261  secretion protein HlyD family protein  30.16 
 
 		 408 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0232169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  26.44 
 
 		 373 aa  92  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3168  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.89 
 
 		 430 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479459  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  25.57 
 
 		 380 aa  91.3  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0225  RND family efflux transporter MFP subunit  27.2 
 
 		 461 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 		 407 aa  90.9  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2042  secretion protein HlyD  28.47 
 
 		 414 aa  90.9  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.617858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  26.98 
 
 		 517 aa  90.9  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  28.62 
 
 		 388 aa  90.9  5e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4166  RND family efflux transporter MFP subunit  27.19 
 
 		 427 aa  90.1  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.19 
 
 		 416 aa  90.5  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  27.5 
 
 		 489 aa  90.5  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5559  secretion protein HlyD  27.25 
 
 		 366 aa  90.1  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0257  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.9 
 
 		 376 aa  90.1  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0635655  hitchhiker  0.00588714 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4180  RND family efflux transporter MFP subunit  27.76 
 
 		 366 aa  89.7  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.249201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  23.41 
 
 		 368 aa  89.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  28.07 
 
 		 370 aa  89.7  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0119  CmeA  26.5 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000105  membrane-fusion protein  27.99 
 
 		 351 aa  89  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.860226  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.49 
 
 		 380 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  28.07 
 
 		 370 aa  89.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  28.07 
 
 		 370 aa  89.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.45 
 
 		 455 aa  89  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.755082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.36 
 
 		 387 aa  89  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  23.62 
 
 		 367 aa  88.6  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1129  RND family efflux transporter MFP subunit  28.06 
 
 		 407 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3268  HlyD family secretion protein  21.13 
 
 		 372 aa  87.8  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.13 
 
 		 368 aa  88.2  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0098  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.53 
 
 		 432 aa  88.2  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  27.49 
 
 		 365 aa  88.2  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  27.49 
 
 		 365 aa  88.2  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  27.49 
 
 		 365 aa  87.8  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  27.49 
 
 		 365 aa  87.8  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  27.49 
 
 		 365 aa  87.8  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  27.49 
 
 		 365 aa  87.8  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  27.49 
 
 		 365 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.23 
 
 		 453 aa  87.4  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2972  secretion protein HlyD  30.89 
 
 		 429 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  25.91 
 
 		 410 aa  87.4  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>