More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3709 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0282  hypothetical protein  82.22 
 
 		 388 aa  639    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.548142  hitchhiker  0.0000619818 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5859  hypothetical protein  80.15 
 
 		 388 aa  640    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0228  hypothetical protein  81.96 
 
 		 388 aa  635    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000368299 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3400  ABC efflux pump, inner membrane subunit  82.22 
 
 		 388 aa  640    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.089365  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0204  hypothetical protein  82.22 
 
 		 388 aa  643    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20132  unclonable  0.000000000008111 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1794  hypothetical protein  79.64 
 
 		 388 aa  639    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173513  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2805  hypothetical protein  81.96 
 
 		 388 aa  637    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.275109  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0220  hypothetical protein  82.22 
 
 		 388 aa  636    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0301  hypothetical protein  81.96 
 
 		 388 aa  637    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157711  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3709  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  777    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.392463  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1164  ABC transporter, permease protein  64.08 
 
 		 387 aa  484  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.440199  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2405  hypothetical protein  64.08 
 
 		 387 aa  481  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0262818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  60.21 
 
 		 388 aa  475  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1459  hypothetical protein  62.02 
 
 		 388 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.789839  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0988  protein of unknown function DUF214  60.21 
 
 		 388 aa  456  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3263  protein of unknown function DUF214  60.47 
 
 		 388 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1986  hypothetical protein  60.36 
 
 		 388 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0628  protein of unknown function DUF214  57.44 
 
 		 391 aa  413  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0398137 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0255  hypothetical protein  54.59 
 
 		 389 aa  402  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  39.31 
 
 		 394 aa  271  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.656867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1512  hypothetical protein  37.36 
 
 		 396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1759  hypothetical protein  37.18 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0251  protein of unknown function DUF214  36.26 
 
 		 440 aa  215  9e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03340  ABC transporter permease  36.36 
 
 		 431 aa  210  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0817  hypothetical protein  32.69 
 
 		 393 aa  203  3e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000337382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2580  protein of unknown function DUF214  33.24 
 
 		 400 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2258  protein of unknown function DUF214  32.75 
 
 		 402 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2023  hypothetical protein  29.34 
 
 		 395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3164  protein of unknown function DUF214  27.14 
 
 		 454 aa  124  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  29.04 
 
 		 371 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  26.57 
 
 		 414 aa  94.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  27.07 
 
 		 421 aa  93.2  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  25.45 
 
 		 421 aa  89  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  25.06 
 
 		 404 aa  86.7  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  25.06 
 
 		 404 aa  86.3  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  25.18 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  27.44 
 
 		 421 aa  82.8  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  30.06 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  24.35 
 
 		 642 aa  80.5  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  29.58 
 
 		 403 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  28 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  25.44 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  24.17 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  24.41 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  24.91 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  29.21 
 
 		 640 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  25.18 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  27.6 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  26.69 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  28.62 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  23.99 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  27.86 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  27.57 
 
 		 643 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  28.36 
 
 		 400 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  26.85 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0937  hypothetical protein  31.75 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.391687  hitchhiker  0.00182616 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  27.95 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  27.14 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  26.88 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  28 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3316  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.19 
 
 		 461 aa  73.9  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0101247  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  22.55 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3708  ABC transporter permease protein  30.25 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1059  hypothetical protein  28.98 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  24.63 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  29.46 
 
 		 488 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0989  ABC transporter efflux protein  25.45 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.150458  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  26.27 
 
 		 403 aa  72.8  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.45 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  27.65 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  27.11 
 
 		 387 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  28.17 
 
 		 652 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  30.23 
 
 		 650 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  27.54 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  22.6 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  25.37 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.84 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  27.73 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  27.65 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  25.26 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  34.75 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  25.13 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  26.3 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  29.05 
 
 		 641 aa  70.1  0.00000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  33.91 
 
 		 642 aa  70.1  0.00000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  29.05 
 
 		 641 aa  69.7  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  23.92 
 
 		 405 aa  69.7  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1485  protein of unknown function DUF214  22.94 
 
 		 417 aa  69.7  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.608649 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  27.53 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3939  protein of unknown function DUF214  26.07 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  20.55 
 
 		 387 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  25.25 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  22.02 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  28.63 
 
 		 641 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  28.11 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  25.86 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  31.91 
 
 		 696 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  24.43 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  27.7 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  24.63 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>