More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3611 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3611  porin  100 
 
 		 370 aa  755    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1412  porin  72.63 
 
 		 371 aa  548  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170387  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0213  putative outer membrane porin  71.35 
 
 		 371 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1242  putative outer membrane porin  71.35 
 
 		 371 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3975  porin  74.86 
 
 		 369 aa  544  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0863036  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1086  putative outer membrane porin  71.35 
 
 		 371 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5754  porin  74.57 
 
 		 368 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.363123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0486  putative outer membrane porin  71.35 
 
 		 371 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.278408  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1437  outer membrane porin  71.62 
 
 		 371 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817141  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2592  outer membrane porin protein  71.62 
 
 		 371 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5307  porin Gram-negative type  72.38 
 
 		 361 aa  544  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1352  outer membrane porin  71.62 
 
 		 371 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0561388  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4550  porin  74.57 
 
 		 368 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.537681 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1296  outer membrane protein (porin)  74.29 
 
 		 368 aa  544  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4097  porin  75.14 
 
 		 367 aa  546  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4439  porin  74.86 
 
 		 369 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.989602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3818  porin  74.36 
 
 		 369 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0843  OmpC family outer membrane porin  50.39 
 
 		 375 aa  332  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0712597 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1091  putative outer membrane porin  47.33 
 
 		 363 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0884  porin  48.37 
 
 		 362 aa  305  7e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273334  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2270  putative outer membrane porin  47.83 
 
 		 362 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0743  outer membrane porin, putative  47.83 
 
 		 362 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000425296  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1583  putative outer membrane porin  47.83 
 
 		 362 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0360665  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1244  porin  47.83 
 
 		 362 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289233  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1086  putative outer membrane porin  47.83 
 
 		 362 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420468  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3014  putative outer membrane porin  47.83 
 
 		 362 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000144829  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2999  porin Gram-negative type  43.6 
 
 		 354 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.959541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2589  porin Gram-negative type  43.32 
 
 		 358 aa  279  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2320  outer membrane protein (porin)-like protein  45.6 
 
 		 360 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0798185  normal  0.76892 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2455  outer membrane protein (porin)-like protein  45.87 
 
 		 361 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00019464  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0880  outer membrane protein (porin)-like protein  45.21 
 
 		 360 aa  275  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5737  outer membrane protein (porin)-like  45.36 
 
 		 359 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0160198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2414  outer membrane protein (porin)-like protein  45.36 
 
 		 358 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200003  decreased coverage  0.00381795 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1798  outer membrane protein (porin)-like  45.09 
 
 		 359 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.660059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2410  outer membrane protein (porin)-like protein  45.09 
 
 		 359 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.08631  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7242  outer membrane protein (porin)  40.43 
 
 		 372 aa  266  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264722  normal  0.33817 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2167  OmpC family outer membrane porin  46.03 
 
 		 369 aa  265  8e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159789  hitchhiker  0.00000436019 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6806  OmpC family outer membrane porin  44.1 
 
 		 383 aa  262  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1119  outer membrane porin, OmpC family  44.71 
 
 		 383 aa  259  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.561071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3394  OmpC family outer membrane porin  43.98 
 
 		 383 aa  259  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126338  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2760  putative porin signal peptide protein  40.96 
 
 		 353 aa  258  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102409  normal  0.556039 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6941  outer membrane protein (porin)  40.62 
 
 		 373 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000000310318  normal  0.643054 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2314  porin  40.06 
 
 		 350 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224998 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2271  porin  38.59 
 
 		 355 aa  237  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0154536  hitchhiker  0.000000413543 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2136  porin signal peptide protein  38.07 
 
 		 352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1313  OmpC family outer membrane porin  36.39 
 
 		 399 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0122268  normal  0.936999 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2933  porin  35.29 
 
 		 365 aa  200  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435653 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1174  porin  33.78 
 
 		 363 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1236  outer membrane porin lipoprotein transmembrane  34.59 
 
 		 369 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3132  porin  30.75 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.011649  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  30.5 
 
 		 355 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  30.5 
 
 		 355 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  32.16 
 
 		 352 aa  143  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  30.89 
 
 		 355 aa  139  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  32.89 
 
 		 355 aa  136  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3528  OmpC family outer membrane porin  34.18 
 
 		 372 aa  135  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.169266 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  31.52 
 
 		 362 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  30.16 
 
 		 368 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  31.99 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  32.64 
 
 		 358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  30.94 
 
 		 389 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  30.63 
 
 		 357 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2365  porin  31.19 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1072  outer membrane porin  31.19 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  30.69 
 
 		 386 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  30.69 
 
 		 386 aa  123  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5510  porin  31.15 
 
 		 372 aa  123  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913776  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5230  outer membrane protein, (porin)  30.25 
 
 		 348 aa  123  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  30.32 
 
 		 354 aa  122  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  29.46 
 
 		 371 aa  122  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  30.85 
 
 		 374 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  30.75 
 
 		 367 aa  122  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6332  porin  30.21 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00191281  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  30.61 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  31.78 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  30.97 
 
 		 363 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  29.8 
 
 		 361 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  30.97 
 
 		 363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  30.97 
 
 		 363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3567  porin  28.8 
 
 		 363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000504769  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  30.97 
 
 		 363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5460  porin  31.01 
 
 		 382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.376591 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  30.97 
 
 		 449 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1722  outer membrane protein (porin)  31.55 
 
 		 357 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0914033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  30.97 
 
 		 363 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  30.97 
 
 		 363 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  31.28 
 
 		 354 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  31.28 
 
 		 354 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4912  porin  30.75 
 
 		 382 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.203081  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0804  porin  30.66 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  27.68 
 
 		 352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3704  outer membrane porin  30.68 
 
 		 363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0181941 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  31.79 
 
 		 383 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4230  outer membrane porin  29.43 
 
 		 379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000540205  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0633  putative outer membrane porin  31.16 
 
 		 379 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0832  putative outer membrane porin  31.16 
 
 		 379 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1796  putative outer membrane porin  31.16 
 
 		 379 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0933184  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  31.47 
 
 		 350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  29.38 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  29.38 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>