29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3394 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3394  HK97 family phage major capsid protein  100 
 
 		 397 aa  814    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000537798 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1682  HK97 family phage major capsid protein  37.79 
 
 		 418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1600  phage major capsid protein, HK97 family  38.73 
 
 		 433 aa  228  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0649  Phage major capsid protein, HK97  38.64 
 
 		 465 aa  216  7e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296668  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1339  HK97 family phage major capsid protein  34.58 
 
 		 418 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.124448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1567  HK97 family phage major capsid protein  35.46 
 
 		 414 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.944174  decreased coverage  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1634  major head protein  34.79 
 
 		 405 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2067  prophage LambdaSo, HK97 family major capsid protein  35.34 
 
 		 433 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.023752  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1668  phage major capsid protein, HK97  34.52 
 
 		 403 aa  194  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3318  HK97 family phage major capsid protein  35.34 
 
 		 433 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0235436 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0362  HK97 family phage major capsid protein  33.42 
 
 		 449 aa  189  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0991  HK97 family phage major capsid protein  33.42 
 
 		 449 aa  189  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2592  phage major capsid protein, HK97 family  34.45 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.339104 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4465  phage major capsid protein, HK97 family  30.89 
 
 		 405 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2963  prophage LambdaSo, HK97 family major capsid protein  34.29 
 
 		 396 aa  179  7e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0461  major phage capsid subunit precursor  40.42 
 
 		 417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.561977 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0642  phage major head protein  33.08 
 
 		 403 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3579  phage major capsid protein, HK97  29.73 
 
 		 411 aa  136  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.978109  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3943  HK97 family phage major capsid protein  27.49 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.204605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3892  hypothetical protein  26.12 
 
 		 421 aa  90.5  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0353742 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  23.75 
 
 		 579 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2837  hypothetical protein  24.65 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0998237  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  23.83 
 
 		 386 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  25.11 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2954  phage major capsid protein, HK97  25.52 
 
 		 281 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.624972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2910  phage major capsid protein, HK97  25.52 
 
 		 281 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  25.84 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3078  phage major capsid protein, HK97  25 
 
 		 282 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  21.33 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>