50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3382 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3382  Phage-related protein tail component-like protein  100 
 
 
1103 aa  2253    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000619193 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1698  bacteriophage protein  40.57 
 
 
1051 aa  551  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.0762686 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3882  hypothetical protein  37.84 
 
 
1100 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.673506  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1694  hypothetical protein  37.89 
 
 
1092 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1634  hypothetical protein  38.4 
 
 
1133 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154038  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1062  host specificity protein J  36.94 
 
 
1101 aa  496  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0785  carbohydrate-binding family V/XII protein  36.8 
 
 
1221 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08300  putative phage-related protein, tail component  36.66 
 
 
1219 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0627181  hitchhiker  0.0000838912 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  35.46 
 
 
1543 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2940  prophage LambdaSo, host specificity protein J, putative  34.63 
 
 
1341 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7024  Fibronectin type III domain protein  37.52 
 
 
3006 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2219  fibronectin, type III domain-containing protein  35.44 
 
 
1061 aa  439  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3882  Fibronectin type III domain protein  37.47 
 
 
3238 aa  439  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2374  fibronectin type III domain-containing protein  34.32 
 
 
1067 aa  435  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.213672  normal  0.639425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2576  Protein of unknown function DUF1983  33.78 
 
 
1816 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6222  Fibronectin type III domain protein  37.02 
 
 
2140 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  37.23 
 
 
3286 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5047  Fibronectin type III domain protein  37.04 
 
 
2899 aa  431  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  37.03 
 
 
3521 aa  433  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3927  hypothetical protein  35.98 
 
 
2007 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  36.7 
 
 
2900 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2426  type III fibronectin  34.53 
 
 
1188 aa  422  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.506749  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3120  hypothetical protein  36.5 
 
 
1157 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0703076 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  36.32 
 
 
1157 aa  419  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  35.97 
 
 
1158 aa  414  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  35.97 
 
 
1158 aa  414  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1086  host specificity protein J  35.44 
 
 
1116 aa  412  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  35.92 
 
 
1159 aa  411  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  36.05 
 
 
1159 aa  412  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2109  hypothetical protein  38.69 
 
 
1159 aa  410  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000420238  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0880  host specificity protein  36.39 
 
 
1157 aa  411  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1158  host specificity protein J  35.3 
 
 
1116 aa  412  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.410108  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0913  hypothetical protein  35.18 
 
 
1137 aa  409  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00750  hypothetical protein  38.69 
 
 
1132 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10054  tail:host specificity protein  38.69 
 
 
1132 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1638  hypothetical protein  38.52 
 
 
1132 aa  405  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498718 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1203  fibronectin type III domain-containing protein  38.52 
 
 
1159 aa  404  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272473  normal  0.0174889 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2772  fibronectin, type III  32.75 
 
 
1194 aa  405  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00979345 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  34.73 
 
 
1120 aa  402  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  34.73 
 
 
1120 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0443  putative prophage LambdaSo, host specificity protein J  35.17 
 
 
1057 aa  392  1e-107  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0663  gp29  33.76 
 
 
1059 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000117932 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2168  host specificity protein  41.4 
 
 
522 aa  369  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524267  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1474  fibronectin type III domain protein  39.78 
 
 
1012 aa  313  1e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1802  hypothetical protein  43.41 
 
 
951 aa  239  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0582533 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1639  fibronectin type III domain-containing protein  37.19 
 
 
881 aa  204  6e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.994447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2167  hypothetical protein  30 
 
 
837 aa  154  8.999999999999999e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.981242  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3498  Phage-related protein tail component-like protein  25.37 
 
 
960 aa  144  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1893  Phage-related protein tail component-like  24.94 
 
 
1644 aa  68.6  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0293426 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2232  Phage-related protein tail component-like protein  30 
 
 
1915 aa  45.4  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>