216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3302 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  100 
 
 
323 aa  670  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  92.24 
 
 
323 aa  627  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  88.24 
 
 
323 aa  610  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  88.24 
 
 
323 aa  608  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  81 
 
 
323 aa  559  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  80.69 
 
 
323 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  80.69 
 
 
323 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  80.69 
 
 
323 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  80.69 
 
 
323 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  80.69 
 
 
323 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  80.69 
 
 
323 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  80.69 
 
 
323 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  79.75 
 
 
323 aa  548  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  78.5 
 
 
323 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  77.88 
 
 
323 aa  539  1e-152  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  77.88 
 
 
323 aa  538  1e-152  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  77.88 
 
 
323 aa  539  1e-152  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  76.95 
 
 
323 aa  534  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  77.26 
 
 
323 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  77.26 
 
 
323 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  76.95 
 
 
323 aa  534  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  68.42 
 
 
323 aa  486  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  66.25 
 
 
325 aa  468  1e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0497  membrane dipeptidase  65.62 
 
 
325 aa  465  1e-130  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6182  hypothetical protein  66.04 
 
 
320 aa  464  1e-130  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  65.94 
 
 
325 aa  466  1e-130  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5225  peptidase M19, renal dipeptidase  65 
 
 
325 aa  463  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511272  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0331  membrane dipeptidase  64.38 
 
 
325 aa  458  1e-128  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0308  membrane dipeptidase  64.38 
 
 
325 aa  458  1e-128  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0329  membrane dipeptidase  64.38 
 
 
325 aa  458  1e-128  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371464  normal  0.432124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4899  membrane dipeptidase  64.38 
 
 
325 aa  458  1e-128  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195029  normal  0.655649 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  66.04 
 
 
328 aa  454  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4784  peptidase M19, renal dipeptidase  63.44 
 
 
325 aa  452  1e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0394  renal dipeptidase family protein  62.81 
 
 
325 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  62.19 
 
 
325 aa  448  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  61.8 
 
 
324 aa  435  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1105  peptidase M19, renal dipeptidase  55.45 
 
 
332 aa  391  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  38.94 
 
 
323 aa  253  2e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3861  M19 family peptidase  35.38 
 
 
332 aa  240  3e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3059  peptidase M19, renal dipeptidase  34.06 
 
 
328 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2693  dipeptidase, putative  34.45 
 
 
328 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0578  peptidase M19 renal dipeptidase  35.62 
 
 
336 aa  223  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0876  membrane dipeptidase  33.23 
 
 
329 aa  211  9e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131069  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05502  hypothetical protein  30.3 
 
 
329 aa  206  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001564  microsomal dipeptidase  31.21 
 
 
329 aa  205  6e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.609765  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1239  peptidase M19, renal dipeptidase  31.1 
 
 
346 aa  203  3e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.120176 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2127  peptidase M19, renal dipeptidase  30.3 
 
 
329 aa  197  2e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0146717  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1814  peptidase M19, renal dipeptidase  30.65 
 
 
329 aa  195  9e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3382  peptidase M19, renal dipeptidase  30.5 
 
 
326 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0814  peptidase M19 renal dipeptidase  29.88 
 
 
327 aa  195  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1602  peptidase M19, renal dipeptidase  32.59 
 
 
323 aa  190  3e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.184491  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  32.54 
 
 
377 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  34.02 
 
 
357 aa  188  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  33.43 
 
 
368 aa  183  4e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0917  peptidase M19, renal dipeptidase  33.04 
 
 
386 aa  175  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182228  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  34.1 
 
 
332 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  30.36 
 
 
327 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  30.97 
 
 
311 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0814  multidrug resistance protein B  32.53 
 
 
332 aa  142  8e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  29.63 
 
 
338 aa  141  1e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  26.42 
 
 
348 aa  141  2e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  29.45 
 
 
315 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.19053e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  28.33 
 
 
402 aa  139  5e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  29.5 
 
 
312 aa  139  9e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3840  peptidase M19, renal dipeptidase  28.25 
 
 
335 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  33.47 
 
 
307 aa  138  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  27.7 
 
 
311 aa  136  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3448  Membrane dipeptidase  31.6 
 
 
333 aa  136  6e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  26.74 
 
 
328 aa  133  4e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  3.44928e-05  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0834  twin-arginine translocation pathway signal  28.73 
 
 
387 aa  133  4e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  25.92 
 
 
412 aa  132  7e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3133  twin-arginine translocation pathway signal  28.45 
 
 
387 aa  132  8e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  29.7 
 
 
355 aa  131  1e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3791  renal dipeptidase family protein  28.17 
 
 
396 aa  131  2e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  26.54 
 
 
433 aa  131  2e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  4.16179e-06  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2779  renal dipeptidase family protein  27.79 
 
 
379 aa  130  2e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  29.08 
 
 
326 aa  130  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  29.63 
 
 
602 aa  130  4e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1454  hypothetical protein  27.6 
 
 
329 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0838  peptidase M19, renal dipeptidase  28.17 
 
 
388 aa  127  2e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  25.29 
 
 
399 aa  127  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3509  peptidase M19 renal dipeptidase  27.76 
 
 
388 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  25.43 
 
 
317 aa  126  5e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3700  peptidase M19 renal dipeptidase  27.56 
 
 
388 aa  125  8e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.56612 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0741  peptidase M19 renal dipeptidase  27.56 
 
 
388 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  26.6 
 
 
315 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3577  peptidase M19 renal dipeptidase  27.27 
 
 
388 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  27.33 
 
 
394 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0806  peptidase M19, renal dipeptidase  27.32 
 
 
387 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  26.71 
 
 
444 aa  124  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3183  twin-arginine translocation pathway signal  27.96 
 
 
388 aa  123  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  27.13 
 
 
438 aa  123  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  27.23 
 
 
337 aa  123  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1127  Membrane dipeptidase  31.31 
 
 
297 aa  121  1e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0633246  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  27.66 
 
 
350 aa  121  2e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3166  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  25.47 
 
 
400 aa  118  1e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  27.7 
 
 
313 aa  118  1e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  27.99 
 
 
433 aa  118  2e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3174  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  24.86 
 
 
399 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845004  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0751  twin-arginine translocation pathway signal  25.7 
 
 
391 aa  115  7e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>