More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3288 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3288  porin  100 
 
 		 380 aa  768    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1853  outer membrane porin OpcP  77.37 
 
 		 481 aa  610  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0277472  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0486  putative outer membrane porin  76.84 
 
 		 380 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2123  outer membrane porin  76.84 
 
 		 380 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0756  outer membrane porin  76.84 
 
 		 383 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0991  putative outer membrane porin  76.84 
 
 		 383 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0695  putative outer membrane porin  76.84 
 
 		 383 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336216  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1963  putative outer membrane porin  76.84 
 
 		 383 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0844  outer membrane porin  76.84 
 
 		 383 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109957  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5077  porin Gram-negative type  76.44 
 
 		 382 aa  597  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0332495  hitchhiker  0.00543855 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1571  OmpC family outer membrane porin  76.44 
 
 		 382 aa  596  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.319374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0589  outer membrane protein (porin)  79.55 
 
 		 379 aa  593  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4482  porin  79.55 
 
 		 379 aa  591  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5215  porin  79.27 
 
 		 379 aa  591  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.778318 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5070  porin  79.27 
 
 		 379 aa  591  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.58235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5007  porin  79.55 
 
 		 379 aa  591  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3298  porin  79.27 
 
 		 379 aa  591  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406065  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3572  porin  78.15 
 
 		 379 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.52228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1471  OmpC family outer membrane porin  47.81 
 
 		 371 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.620688  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  40.97 
 
 		 385 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  40.71 
 
 		 385 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  41.79 
 
 		 384 aa  237  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  39.14 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  41.29 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  40.05 
 
 		 386 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  38.48 
 
 		 383 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  38.48 
 
 		 383 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  38.48 
 
 		 383 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  39.49 
 
 		 383 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2192  OmpC family outer membrane porin  40.71 
 
 		 387 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.711966 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6404  porin Gram-negative type  41.13 
 
 		 359 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  40.1 
 
 		 383 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  39.85 
 
 		 384 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  39.4 
 
 		 386 aa  225  9e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  39.9 
 
 		 387 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  38.97 
 
 		 402 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  37.91 
 
 		 436 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  37.91 
 
 		 386 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  37.91 
 
 		 436 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  37.91 
 
 		 386 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  37.91 
 
 		 386 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  37.91 
 
 		 386 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  37.91 
 
 		 386 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  37.91 
 
 		 386 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  39.89 
 
 		 385 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3782  porin  39.9 
 
 		 388 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5427  porin  40.15 
 
 		 385 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914056  normal  0.467276 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4842  porin  40.15 
 
 		 385 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  39.53 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  38.85 
 
 		 391 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  37.89 
 
 		 389 aa  210  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5435  porin  39.9 
 
 		 385 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00368116  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  38.68 
 
 		 384 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2227  porin Gram-negative type  38.15 
 
 		 387 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0459424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  38.24 
 
 		 381 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  38.24 
 
 		 379 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  36.45 
 
 		 395 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1012  OmpC family outer membrane porin  37.63 
 
 		 375 aa  205  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000562807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  36.96 
 
 		 383 aa  205  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  38.07 
 
 		 375 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  38.07 
 
 		 375 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2044  OmpC family outer membrane porin  36.66 
 
 		 387 aa  202  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231547  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  38.97 
 
 		 384 aa  202  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  38.97 
 
 		 384 aa  202  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  38.73 
 
 		 384 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  38.97 
 
 		 384 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  38.73 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  38.73 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  38.08 
 
 		 375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  38.73 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2135  porin  38.28 
 
 		 422 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  36.23 
 
 		 383 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  35.71 
 
 		 409 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0285  outer membrane protein (porin)  36.15 
 
 		 367 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  37.41 
 
 		 383 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  35.85 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2206  outer membrane porin  38.19 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0690503  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  37.16 
 
 		 383 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1801  putative porin-related protein  37.08 
 
 		 424 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2189  outer membrane porin  36.76 
 
 		 366 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2048  outer membrane porin  36.76 
 
 		 366 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  35.82 
 
 		 393 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0370  outer membrane porin  37.08 
 
 		 382 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0466  outer membrane porin  37.08 
 
 		 382 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  37.76 
 
 		 379 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  36.95 
 
 		 374 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  37.97 
 
 		 384 aa  192  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  37.62 
 
 		 387 aa  192  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  36.76 
 
 		 381 aa  192  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  39.17 
 
 		 394 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  37.15 
 
 		 375 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  36.45 
 
 		 390 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  35.06 
 
 		 396 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  37.07 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  38.05 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  36.96 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0910  OmpC family outer membrane porin  34.86 
 
 		 354 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106458  normal  0.0412885 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  37.63 
 
 		 403 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  37.65 
 
 		 379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  38.44 
 
 		 379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>