More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3261 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3261  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 272 aa  552  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767293  normal  0.718789 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1693  putative hydrolase  76.75 
 
 		 272 aa  435  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800205 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4957  alpha/beta hydrolase fold  76.01 
 
 		 272 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.0565751 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6254  alpha/beta hydrolase fold protein  56.06 
 
 		 277 aa  305  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3137  alpha/beta hydrolase fold  59.32 
 
 		 271 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6488  Alpha/beta hydrolase  58.17 
 
 		 271 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3153  alpha/beta hydrolase fold  59.32 
 
 		 271 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0769848 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2524  alpha/beta hydrolase fold  58.94 
 
 		 271 aa  300  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191212  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3075  alpha/beta hydrolase fold  58.17 
 
 		 267 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3192  alpha/beta hydrolase fold  58.17 
 
 		 267 aa  297  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  50.93 
 
 		 274 aa  274  9e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  48.87 
 
 		 276 aa  257  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  46.9 
 
 		 275 aa  246  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2806  alpha/beta hydrolase fold protein  43.96 
 
 		 284 aa  232  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0990  alpha/beta hydrolase fold  40.59 
 
 		 298 aa  202  7e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15020  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  43.67 
 
 		 297 aa  191  8e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.232435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 		 275 aa  115  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2899  alpha/beta hydrolase fold protein  31.78 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  30.2 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2354  alpha/beta hydrolase fold protein  33.06 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0658883  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  32.59 
 
 		 289 aa  97.1  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0234  hypothetical protein  27.34 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  27.3 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 287 aa  78.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  23.05 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  23.08 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  23.44 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  23.08 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  23.08 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  23.08 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  23.08 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  25.99 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0199  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355967  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  23.44 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1023  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 		 289 aa  75.5  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  28.01 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  22.81 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  23.08 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  22.46 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  28.07 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0902  Alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  22.34 
 
 		 279 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 298 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4484  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 301 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  25.59 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4624  alpha/beta fold family hydrolase  36.36 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.186809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  26.21 
 
 		 284 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0814  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  23.97 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4608  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.692037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  29.56 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1797  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.696369  normal  0.363758 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.75 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  22.27 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3781  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.668878  normal  0.527561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0430  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  29.03 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  25.56 
 
 		 333 aa  68.9  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  24.37 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3012  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  27.44 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3237  alpha/beta hydrolase fold protein  24.26 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  26.78 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  28.29 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  25.38 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.62 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.62 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 		 297 aa  67  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2875  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  24.42 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  25 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  26.33 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>