92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3199 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3199  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  100 
 
 		 394 aa  795    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0555142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3106  hypothetical protein  41.1 
 
 		 392 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1346  aromatic hydrocarbon degradation protein  34.09 
 
 		 391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000227507  hitchhiker  0.0000118499 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0576  putative long-chain fatty acid transport protein  30.23 
 
 		 400 aa  176  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00218092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0379  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.02 
 
 		 463 aa  143  4e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2202  SalD  29.7 
 
 		 430 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.476706  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0645  membrane protein involved in aromatic hydrocarbon degradation  30.34 
 
 		 438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54968  normal  0.132324 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2203  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.47 
 
 		 422 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.92236  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1799  long-chain fatty acid transport protein  27.41 
 
 		 455 aa  109  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.471886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2542  outer membrane protein, OMPP1/FadL/TodX family  26.68 
 
 		 447 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0142574  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2170  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.68 
 
 		 447 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000480388  decreased coverage  0.000000000685095 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2180  long-chain fatty acid ABC transporter  26 
 
 		 381 aa  104  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000739013  hitchhiker  0.00000487757 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4038  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.96 
 
 		 410 aa  93.2  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.813812  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3997  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.96 
 
 		 410 aa  92.8  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0634877  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3896  hypothetical protein  26.56 
 
 		 442 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2498  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.47 
 
 		 437 aa  86.7  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.953303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0456  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.52 
 
 		 462 aa  80.5  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000969908  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0747  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.3 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000126668  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0449  aromatic hydrocarbon degradation protein  24.18 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0024  toluene transport protein, putative  22.82 
 
 		 461 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.137484  normal  0.133309 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1467  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.41 
 
 		 468 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.524718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2053  aromatic hydrocarbon degradation protein  26.41 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000452049  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2113  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.53 
 
 		 364 aa  70.1  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.628404  normal  0.519362 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1551  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.46 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0286516  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1535  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.56 
 
 		 453 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.745918 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2776  putative transporter protein  25.07 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356239  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0032  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.2 
 
 		 466 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0548  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.76 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.117969  hitchhiker  0.0000578498 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3558  Outer membrane protein (CymD)  25 
 
 		 460 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0239673  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0378  outer membrane protein transport protein, OMPP1/FadL/TodX family  27.76 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1379  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.52 
 
 		 450 aa  65.5  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.918562  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4639  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.78 
 
 		 458 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3563  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.78 
 
 		 458 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.811834  normal  0.361655 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0339  OMPP1/FadL/TodX family outer membrane protein  22.41 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.746595  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2708  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  20.7 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589559 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0428  OMPP1/FadL/TodX family toluene transport protein  23.83 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000260266  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4111  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.73 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129657  normal  0.252995 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2330  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.29 
 
 		 475 aa  60.1  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402524  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1800  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.26 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.839799  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2658  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.96 
 
 		 450 aa  58.9  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000308676  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3082  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.91 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000123053  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3234  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.4 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3342  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.23 
 
 		 436 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15331  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3004  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.69 
 
 		 450 aa  55.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.853487  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0843  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  20.53 
 
 		 472 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5672  aromatic hydrocarbon degradation protein  22.63 
 
 		 456 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.224746  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0065  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.74 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.709413 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1585  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  19.84 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0053  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.56 
 
 		 471 aa  53.5  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1338  long-chain fatty acid outer membrane transporter  22.7 
 
 		 417 aa  53.5  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1758  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.61 
 
 		 430 aa  53.1  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.407775  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0891  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.65 
 
 		 453 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00668397  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0893  outer membrane protein P1, putative  24.41 
 
 		 422 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.325084  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1669  membrane protein  22.69 
 
 		 427 aa  50.8  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2745  long-chain fatty acid outer membrane transporter  22.85 
 
 		 435 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00852795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4009  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.74 
 
 		 441 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2531  long-chain fatty acid outer membrane transporter  22.85 
 
 		 435 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876174  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1834  hypothetical protein  22.4 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0420265  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2580  long-chain fatty acid outer membrane transporter  22.85 
 
 		 435 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00696507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03834  Long-chain fatty acid transport protein  21.63 
 
 		 464 aa  50.8  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000417169  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4378  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.39 
 
 		 441 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.335616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2620  long-chain fatty acid outer membrane transporter  22.85 
 
 		 437 aa  50.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0208452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2634  long-chain fatty acid outer membrane transporter  22.85 
 
 		 437 aa  50.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0127967  hitchhiker  0.00000000000285546 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0339  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.29 
 
 		 452 aa  49.7  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000148311  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3370  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.54 
 
 		 458 aa  50.1  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2250  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24 
 
 		 407 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1488  outer membrane protein transport protein (OMPP1/FadL/TodX)  22.54 
 
 		 415 aa  48.9  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000022561  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2044  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.27 
 
 		 419 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00212006  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6026  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.68 
 
 		 431 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2596  long chain fatty acid transport protein  21.74 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0488563  normal  0.346925 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1588  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.21 
 
 		 422 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000227474  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000778  long-chain fatty acid transport protein  26.34 
 
 		 432 aa  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1288  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.19 
 
 		 565 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2609  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.09 
 
 		 439 aa  47.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000112018  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47540  putative outer membrane protein precursor  23.58 
 
 		 424 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.638983 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2436  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.2 
 
 		 438 aa  47.4  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000365967  hitchhiker  0.00491561 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03124  hypothetical protein  24.22 
 
 		 420 aa  47  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1767  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.1 
 
 		 424 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0166103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5803  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.62 
 
 		 432 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2600  long-chain fatty acid outer membrane transporter  21.69 
 
 		 422 aa  46.2  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243825  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4491  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.31 
 
 		 441 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1486  toluene transport protein, putative  21.08 
 
 		 473 aa  46.2  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000112602  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000183  long-chain fatty acid transport protein  22.36 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0205909  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2901  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  20.79 
 
 		 460 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875359  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0821  long-chain fatty acid transport like protein  22.42 
 
 		 457 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1655  aromatic hydrocarbon degradation protein  24.51 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0166252  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2706  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.84 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.327378  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1410  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.67 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.343268  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1772  outer membrane protein transport protein (ompp1/fadl/todx)  22.78 
 
 		 413 aa  43.9  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000672167  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001387  long-chain fatty acid transport protein  25.54 
 
 		 368 aa  43.5  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0500  aromatic hydrocarbon degradation protein  24.02 
 
 		 420 aa  43.1  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0907  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  20.42 
 
 		 430 aa  42.7  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000931505 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>