242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3152 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3507  cobaltochelatase subunit CobN  55.69 
 
 
1253 aa  1349    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09801  cobalamin biosynthetic protein CobN  33.23 
 
 
1245 aa  814    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1306  cobaltochelatase subunit CobN  48.45 
 
 
1263 aa  1134    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3149  cobN/magnesium chelatase family protein  55.19 
 
 
1254 aa  1370    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1170  cobaltochelatase  71.47 
 
 
1220 aa  1803    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.345597  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3015  cobaltochelatase subunit CobN  55.15 
 
 
1254 aa  1377    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  39.82 
 
 
1209 aa  793    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0331  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  34.78 
 
 
1262 aa  822    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  34.18 
 
 
1259 aa  681    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  44.05 
 
 
1253 aa  1098    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0558  cobaltochelatase, CobN subunit  38.95 
 
 
1453 aa  858    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3112  cobaltochelatase subunit CobN  40.2 
 
 
1213 aa  824    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2815  cobaltochelatase, CobN subunit  45.48 
 
 
1247 aa  1091    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.265823 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2269  cobaltochelatase subunit CobN  55.61 
 
 
1253 aa  1347    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  47.85 
 
 
1288 aa  1176    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4586  cobaltochelatase subunit CobN  55.81 
 
 
1248 aa  1353    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465963  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3461  CobN/magnesium chelatase  35.86 
 
 
1304 aa  658    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2099  cobaltochelatase subunit CobN  75.45 
 
 
1281 aa  1950    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3098  cobaltochelatase subunit CobN  55.8 
 
 
1257 aa  1375    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391048  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  41.57 
 
 
1193 aa  824    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  31.92 
 
 
1220 aa  687    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4806  cobaltochelatase subunit CobN  75.71 
 
 
1269 aa  1961    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140016  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5367  cobaltochelatase, CobN subunit  39.86 
 
 
1426 aa  873    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1576  cobaltochelatase subunit CobN  76.6 
 
 
1270 aa  1988    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104948  normal  0.435931 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1059  cobaltochelatase, CobN subunit  39.15 
 
 
1435 aa  869    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3152  cobaltochelatase subunit CobN  100 
 
 
1267 aa  2580    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456868  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1121  cobaltochelatase, CobN subunit  39.85 
 
 
1256 aa  827    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229116  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2773  cobaltochelatase subunit CobN  54.86 
 
 
1253 aa  1343    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0158  cobaltochelatase  49.8 
 
 
1235 aa  1155    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.75394  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1357  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  39.22 
 
 
1242 aa  846    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.250832 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  41.72 
 
 
1206 aa  812    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0921  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.75 
 
 
1245 aa  811    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.308916  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2647  cobaltochelatase CobN subunit  48.52 
 
 
1260 aa  1141    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.844431  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  47.82 
 
 
1263 aa  1141    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  34.24 
 
 
1258 aa  705    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1877  cobaltochelatase subunit CobN  48.54 
 
 
1263 aa  1145    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3366  cobaltochelatase subunit CobN  52.16 
 
 
1240 aa  1174    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2407  cobaltochelatase subunit CobN  74.77 
 
 
1278 aa  1924    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1518  cobaltochelatase subunit CobN  40.87 
 
 
1364 aa  729    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0461692  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0738  cobaltochelatase subunit CobN  45.18 
 
 
1286 aa  1025    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1954  cobaltochelatase subunit CobN  75.29 
 
 
1281 aa  1941    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68761  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0648  cobaltochelatase, CobN subunit  41.19 
 
 
1409 aa  869    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08851  cobalamin biosynthetic protein CobN  34.63 
 
 
1253 aa  790    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000327208 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  34.75 
 
 
1255 aa  712    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5591  Cobaltochelatase  40.6 
 
 
1207 aa  813    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.270637 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0145  cobaltochelatase subunit CobN  40.77 
 
 
1212 aa  800    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1859  Cobaltochelatase  35.16 
 
 
1302 aa  672    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.243773 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  43.59 
 
 
1222 aa  872    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  47.14 
 
 
1290 aa  1157    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2533  cobaltochelatase subunit CobN  40.66 
 
 
1198 aa  819    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1646  cobaltochelatase subunit CobN  85.05 
 
 
1267 aa  2193    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244329  normal  0.0408694 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0883  cobaltochelatase subunit CobN  71.47 
 
 
1220 aa  1803    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.221354  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2482  cobaltochelatase, CobN subunit  41.1 
 
 
1203 aa  799    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.440822  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0636  cobaltochelatase subunit CobN  46.37 
 
 
1247 aa  1053    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411028  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6126  cobaltochelatase subunit CobN  43.15 
 
 
1238 aa  863    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173021  hitchhiker  0.00419275 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2352  cobaltochelatase, CobN subunit  41.6 
 
 
1444 aa  860    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.113617  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2219  cobaltochelatase subunit CobN  57.82 
 
 
1248 aa  1390    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1177  cobaltochelatase subunit CobN  75.71 
 
 
1269 aa  1965    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2496  cobaltochelatase subunit CobN  40.66 
 
 
1198 aa  817    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315782  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  43.35 
 
 
1237 aa  919    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0132  cobaltochelatase subunit CobN  43.61 
 
 
1363 aa  1093    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305949  normal  0.0126467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2710  cobaltochelatase subunit CobN  44.12 
 
 
1222 aa  877    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.381245  decreased coverage  0.0000125335 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  45.79 
 
 
1247 aa  1102    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1557  cobaltochelatase subunit CobN  76.75 
 
 
1270 aa  1990    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25970  cobaltochelatase subunit CobN  57.9 
 
 
1248 aa  1395    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.359324  normal  0.429696 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  41.65 
 
 
1194 aa  838    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1657  cobaltochelatase subunit CobN  75.71 
 
 
1269 aa  1965    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  37.12 
 
 
1244 aa  810    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1269  cobaltochelatase subunit CobN  48.6 
 
 
1263 aa  1137    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5746  cobaltochelatase, CobN subunit  63.62 
 
 
1273 aa  1587    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000307872 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1631  cobaltochelatase subunit CobN  75.71 
 
 
1269 aa  1964    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498133  normal  0.0450481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2495  cobaltochelatase, CobN subunit  41.61 
 
 
1196 aa  796    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.148712 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2196  cobaltochelatase, CobN subunit  41.83 
 
 
1191 aa  850    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0587089  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1759  cobaltochelatase subunit CobN  48.32 
 
 
1273 aa  1144    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193122  normal  0.0775991 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  34.41 
 
 
1256 aa  722    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1005  Cobaltochelatase  34.9 
 
 
1298 aa  660    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1582  cobaltochelatase subunit CobN  76.42 
 
 
1269 aa  1950    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0866134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2422  cobaltochelatase subunit CobN  55.24 
 
 
1253 aa  1344    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.842189  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17590  cobaltochelatase subunit CobN  40.49 
 
 
1199 aa  793    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0816  cobaltochelatase, CobN subunit  40.2 
 
 
1175 aa  731    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2878  cobaltochelatase subunit CobN  40.38 
 
 
1190 aa  769    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4862  cobaltochelatase subunit CobN  42.58 
 
 
1266 aa  867    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114113  normal  0.358132 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2541  cobaltochelatase subunit CobN  40.66 
 
 
1198 aa  817    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  41.18 
 
 
1205 aa  845    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1615  cobaltochelatase subunit CobN  71.4 
 
 
1220 aa  1800    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144906  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  46.19 
 
 
1261 aa  1143    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09821  cobalamin biosynthetic protein CobN  33.75 
 
 
1245 aa  815    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  41.19 
 
 
1207 aa  783    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2131  cobaltochelatase subunit CobN  52.39 
 
 
1330 aa  1056    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0808058  normal  0.0966772 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09611  cobalamin biosynthetic protein CobN  34.76 
 
 
1245 aa  838    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10041  cobalamin biosynthetic protein CobN  34.62 
 
 
1262 aa  824    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.460676 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  41.7 
 
 
1406 aa  879    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0787  cobaltochelatase subunit CobN  46.93 
 
 
1249 aa  1045    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14911  cobalamin biosynthetic protein CobN  38.37 
 
 
1259 aa  812    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.629118 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0277  cobaltochelatase subunit CobN  71.47 
 
 
1220 aa  1803    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.408292  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1377  cobaltochelatase, CobN subunit  51.61 
 
 
1293 aa  1290    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.376222  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5001  cobaltochelatase subunit CobN  84.55 
 
 
1269 aa  2169    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0676394  decreased coverage  0.00000811844 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1291  cobaltochelatase, CobN subunit  42.03 
 
 
1264 aa  823    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.526885  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1938  cobaltochelatase subunit CobN  75.45 
 
 
1281 aa  1949    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.812521  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0749  cobalamin biosynthesis protein CobN, putative  31.14 
 
 
1244 aa  632  1e-179  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>