47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3077 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_3077  putative general secretory pathway protein J  100 
 
 		 234 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000785542 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3943  putative general secretory pathway protein J  76.07 
 
 		 228 aa  347  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.173018 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4494  putative general secretory pathway protein J  78.61 
 
 		 201 aa  321  5e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305758  normal  0.13576 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0014  general secretory pathway protein J  62.4 
 
 		 242 aa  293  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2778  general secretory pathway protein J  66.67 
 
 		 242 aa  289  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1883  general secretory pathway protein J  66.67 
 
 		 242 aa  289  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2669  general secretory pathway protein J  66.67 
 
 		 242 aa  289  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0015  general secretion pathway protein J  67.3 
 
 		 242 aa  288  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0015  general secretion pathway protein J  67.3 
 
 		 242 aa  288  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0227  general secretory pathway protein J  67.3 
 
 		 242 aa  288  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.291181  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0056  putative general secretion pathway protein J  62.39 
 
 		 231 aa  287  8e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0045  putative general secretion pathway protein J  61.11 
 
 		 234 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0055  putative general secretion pathway protein J  66.03 
 
 		 224 aa  279  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0954003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0074  putative general secretion pathway protein J  63.18 
 
 		 222 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3237  putative general secretion pathway protein J  61.54 
 
 		 229 aa  278  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.722967  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3511  general secretory pathway protein J  66.5 
 
 		 203 aa  274  8e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0055  general secretion pathway protein  61.54 
 
 		 232 aa  263  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163391  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0015  putative general secretion pathway protein J  63.18 
 
 		 222 aa  261  6e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1064  Type II secretory pathway component PulJ  34.36 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00786562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  36.21 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  37.36 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  36.84 
 
 		 247 aa  95.5  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3387  Type II secretory pathway component PulJ  29.94 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0537  methylation  35.48 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0651  hypothetical protein  35.29 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3224  general secretory pathway J transmembrane protein  27.16 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3131  general secretion pathway protein J  33.59 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.037121 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0672  hypothetical protein  35.65 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.142154  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  33.79 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1078  hypothetical protein  33.09 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1324  methylation  34.4 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3524  hypothetical protein  33.09 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0132086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  29.67 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5692  hypothetical protein  33.33 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434625  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3422  general secretion pathway protein J  27.35 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633509 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  26.88 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  27.33 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0922  Type II secretory pathway component  33.33 
 
 		 217 aa  49.3  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.235402  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3574  general secretion pathway protein J  29.92 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.629666 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  40.68 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2205  type II secretion system protein J  31.34 
 
 		 204 aa  46.6  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0654355  normal  0.781056 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3421  general secretion pathway protein J  30.07 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2535  general secretory pathway protein J  57.14 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0358104  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3406  general secretion pathway protein GspJ  28.17 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  30.7 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4833  putative type II secretion system protein  26.44 
 
 		 191 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3132  general secretion pathway protein J  28.67 
 
 		 201 aa  42  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>