61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2856 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2856  GDSL family lipase  100 
 
 
452 aa  915    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000379569  hitchhiker  0.00852131 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0297  lipase/acylhydrolase  70.59 
 
 
423 aa  594  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223769  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3660  lipolytic protein G-D-S-L family  71.18 
 
 
422 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000531698  hitchhiker  0.0000015866 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3096  lipase/acylhydrolase, putative  66.33 
 
 
428 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.0000000000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2571  lipase/acylhydrolase, putative  62.5 
 
 
425 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000716305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0006  lipase/acylhydrolase, putative  62.5 
 
 
425 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000023586  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3539  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  62.5 
 
 
425 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000245982  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1986  putative lipase/acylhydrolase  62.5 
 
 
425 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000018938  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3110  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  62.5 
 
 
483 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.000000000002324  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0013  lipolytic enzyme, G-D-S-L  62.5 
 
 
483 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000198  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0233  GDSL family lipase  65.28 
 
 
421 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000340097  hitchhiker  0.00372665 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3835  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  62.26 
 
 
425 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00947114  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0250  GDSL family lipase  63.44 
 
 
421 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000480307  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0259  GDSL family lipase  65.64 
 
 
423 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000511681  normal  0.138993 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0311  GDSL family lipase  65.15 
 
 
421 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000971594  hitchhiker  0.00755719 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0331  GDSL family lipase  65.38 
 
 
421 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381329  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2775  lipolytic enzyme, G-D-S-L  65.38 
 
 
421 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000857041  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3430  lipolytic protein  63.59 
 
 
423 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000013234  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3774  lipolytic enzyme, G-D-S-L  61.65 
 
 
384 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000241856  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2273  lipolytic protein G-D-S-L family  40.1 
 
 
420 aa  255  9e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4089  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2328  lipolytic protein G-D-S-L family  38.72 
 
 
429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.403637  normal  0.694344 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2643  lipolytic protein G-D-S-L family  41.48 
 
 
377 aa  249  9e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624519  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0961  GDSL family lipase  38.22 
 
 
439 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.270574 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23690  putative secreted protein  38.76 
 
 
442 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00903335 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1244  lipolytic protein G-D-S-L family  38.24 
 
 
404 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2556  lipolytic protein G-D-S-L family  40.92 
 
 
414 aa  236  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1245  lipolytic protein G-D-S-L family  37.5 
 
 
414 aa  233  7.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3482  lipolytic protein G-D-S-L family  39.3 
 
 
409 aa  230  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20820  Lipolytic enzyme, G-D-S-L domain protein  37.3 
 
 
451 aa  229  6e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6463  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1595  lipolytic protein G-D-S-L family  38.93 
 
 
418 aa  226  5.0000000000000005e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2776  lipolytic protein G-D-S-L family  35.63 
 
 
487 aa  224  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5218  lipolytic protein G-D-S-L family  38.5 
 
 
542 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14350  lysophospholipase L1-like esterase  36.43 
 
 
407 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3061  GDSL family lipase  38.31 
 
 
415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827157  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3984  lipolytic protein G-D-S-L family  34.85 
 
 
430 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.767273  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2528  GDSL family lipase  36.24 
 
 
437 aa  213  7.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.744163 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1831  GDSL family lipase  37.65 
 
 
418 aa  209  7e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0423469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1567  GDSL-like lipase/acylhydrolase family protein  37.31 
 
 
422 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130924  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2481  GDSL family lipase  33.41 
 
 
450 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0964  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.2 
 
 
407 aa  192  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263974  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2664  GDSL family lipase  32.27 
 
 
423 aa  190  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  decreased coverage  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0775  lipolytic protein G-D-S-L family  34.29 
 
 
646 aa  189  7e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812985  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4791  lipolytic protein G-D-S-L family  35.51 
 
 
422 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4719  lipolytic protein G-D-S-L family  34.05 
 
 
407 aa  187  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4444  lipolytic protein G-D-S-L family  33.58 
 
 
794 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0624872  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3879  GDSL family lipase  31.71 
 
 
414 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2070  lipolytic protein G-D-S-L family  34.62 
 
 
395 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.397214  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7004  GDSL family lipase  32.7 
 
 
416 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2832  lipolytic protein G-D-S-L family  31.25 
 
 
396 aa  152  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000255461  decreased coverage  0.0000190518 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09287  extracellular GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00820)  28.57 
 
 
425 aa  151  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.879656 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0237  hypothetical protein  29.12 
 
 
376 aa  147  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4331  hypothetical protein  33.21 
 
 
326 aa  140  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.46242  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3614  lipolytic protein G-D-S-L family  39.81 
 
 
220 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0768739  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2838  lipolytic protein G-D-S-L family  26.65 
 
 
399 aa  96.3  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.902078  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6408  hypothetical protein  27.41 
 
 
1375 aa  85.1  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0724  putative lipase  23.75 
 
 
573 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0740  alpha/beta hydrolase fold family protein  23.12 
 
 
573 aa  55.1  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0142196  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3773  lipolytic enzyme, G-D-S-L  61.76 
 
 
37 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.000000000000131726  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4401  lipolytic protein G-D-S-L family  33.33 
 
 
728 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  36.56 
 
 
270 aa  45.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2134  GDSL family lipase  30.38 
 
 
248 aa  43.1  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.306238  normal  0.090181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>