More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2558 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 223 aa  461  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  78.48 
 
 		 223 aa  367  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  76.68 
 
 		 223 aa  362  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  76.04 
 
 		 220 aa  346  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  77.57 
 
 		 220 aa  346  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  75.93 
 
 		 220 aa  345  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  78.67 
 
 		 221 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  78.67 
 
 		 221 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  78.2 
 
 		 221 aa  341  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  75 
 
 		 220 aa  323  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  72.81 
 
 		 220 aa  322  3e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  72.9 
 
 		 229 aa  320  8e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  73.36 
 
 		 220 aa  320  8e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  74.41 
 
 		 229 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  72.9 
 
 		 229 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  72.9 
 
 		 220 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  72.9 
 
 		 220 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  72.9 
 
 		 220 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  48.39 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  46.08 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  45.62 
 
 		 226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  45.16 
 
 		 229 aa  192  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  44.04 
 
 		 227 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  44.6 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  43.46 
 
 		 214 aa  167  8e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  43.46 
 
 		 214 aa  167  8e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  43.32 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  42.72 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  44.55 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  41.04 
 
 		 212 aa  164  9e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  43.66 
 
 		 224 aa  157  9e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  40.28 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  40.38 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  40.69 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  44.76 
 
 		 218 aa  149  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  39.71 
 
 		 230 aa  145  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  39.13 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  37.56 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  38.86 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  39.34 
 
 		 214 aa  135  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4362  Phosphoglycerate mutase  41.43 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  40.84 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  40.21 
 
 		 185 aa  126  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  40.78 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  37.91 
 
 		 220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  34.45 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  34.45 
 
 		 202 aa  112  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  32.97 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  37.32 
 
 		 210 aa  108  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 		 209 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  38.35 
 
 		 440 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  32.21 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  31.88 
 
 		 209 aa  106  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  37.16 
 
 		 237 aa  105  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  30.24 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  33.65 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  33.65 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  36.23 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  39.87 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  35.41 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  28.42 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  41.32 
 
 		 251 aa  99.4  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.78 
 
 		 449 aa  98.2  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  33.94 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  32.86 
 
 		 459 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  34.39 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  37.86 
 
 		 209 aa  98.2  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  32.42 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  32.42 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  32.42 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  34.17 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.63 
 
 		 378 aa  96.3  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  35.16 
 
 		 192 aa  96.3  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  32.47 
 
 		 207 aa  95.5  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  36.08 
 
 		 222 aa  95.1  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  36.08 
 
 		 222 aa  95.1  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 		 216 aa  94.7  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.4 
 
 		 427 aa  94.7  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.17 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  40.45 
 
 		 205 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  41.01 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 		 212 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 		 447 aa  94  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  32.99 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  32.13 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 		 445 aa  93.6  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  31.96 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  32.73 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 		 207 aa  92.8  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  34.56 
 
 		 215 aa  92.8  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  34.56 
 
 		 215 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  34.56 
 
 		 215 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  34.56 
 
 		 215 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>