More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2481 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2161  major facilitator transporter  68 
 
 		 514 aa  651    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0113  major facilitator transporter  71.37 
 
 		 499 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1443  major facilitator transporter  80.34 
 
 		 493 aa  721    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2481  major facilitator transporter  100 
 
 		 496 aa  971    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6518  major facilitator transporter  53 
 
 		 475 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6752  major facilitator transporter  53 
 
 		 475 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0303663 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6341  major facilitator transporter  51.88 
 
 		 475 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7502  major facilitator transporter  52.05 
 
 		 475 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0253072  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1518  major facilitator superfamily permease  50.21 
 
 		 489 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1432  major facilitator family transporter  50.32 
 
 		 489 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0027  putative sugar transport protein  50.11 
 
 		 489 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1172  MFS transporter  50.32 
 
 		 489 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.537598  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1045  major facilitator transporter  35.47 
 
 		 478 aa  256  8e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  31.68 
 
 		 454 aa  251  2e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4107  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 477 aa  220  6e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.338047  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4136  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 477 aa  220  6e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4579  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 487 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4363  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 		 478 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2083  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 507 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.835156  normal  0.347938 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5446  putative MFS superfamily transport protein  30.32 
 
 		 484 aa  182  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1122  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 482 aa  180  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2459  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 471 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489656  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1804  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 470 aa  141  3e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000239079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  26.41 
 
 		 476 aa  140  6e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0861  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 		 483 aa  134  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1813  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 480 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  29.54 
 
 		 457 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  24.83 
 
 		 480 aa  123  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 477 aa  120  6e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  27.36 
 
 		 464 aa  117  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 459 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  28.54 
 
 		 480 aa  117  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 		 423 aa  116  7.999999999999999e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  26.64 
 
 		 460 aa  116  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  26.48 
 
 		 469 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  25.92 
 
 		 460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3296  major facilitator family transporter  28.4 
 
 		 458 aa  114  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2894  General substrate transporter  28.4 
 
 		 458 aa  114  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  25.84 
 
 		 445 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4572  General substrate transporter  26.65 
 
 		 477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  26.38 
 
 		 438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  26.86 
 
 		 446 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 		 451 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  29.01 
 
 		 463 aa  107  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  26.13 
 
 		 452 aa  107  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  27.62 
 
 		 467 aa  106  8e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  27.13 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 461 aa  105  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 463 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  24.8 
 
 		 499 aa  103  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  28.67 
 
 		 490 aa  103  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  28.75 
 
 		 455 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  29.09 
 
 		 459 aa  103  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 447 aa  102  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 457 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 474 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  27.38 
 
 		 446 aa  100  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  24.11 
 
 		 459 aa  100  5e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 474 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 474 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1618  major facilitator transporter  25.22 
 
 		 458 aa  100  6e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 472 aa  99.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  31.86 
 
 		 476 aa  99  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  28.43 
 
 		 455 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 473 aa  98.2  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 442 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.65 
 
 		 472 aa  97.8  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 474 aa  97.8  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0341  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 508 aa  97.1  6e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  25.99 
 
 		 464 aa  97.1  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  26.61 
 
 		 471 aa  96.3  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  26.35 
 
 		 465 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 474 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 465 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  27.99 
 
 		 450 aa  96.3  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 		 444 aa  95.1  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  28.75 
 
 		 452 aa  95.9  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 		 467 aa  95.9  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  28.82 
 
 		 467 aa  95.5  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  25.92 
 
 		 478 aa  95.1  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  28.09 
 
 		 478 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  27.76 
 
 		 478 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0278  major facilitator transporter  24.77 
 
 		 441 aa  95.1  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.672912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  28.09 
 
 		 478 aa  95.1  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  28.09 
 
 		 478 aa  95.1  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  28.09 
 
 		 478 aa  95.1  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  27.76 
 
 		 478 aa  94.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  27.76 
 
 		 478 aa  94  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  30.07 
 
 		 459 aa  94  6e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1863  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 452 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369973  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  35.32 
 
 		 477 aa  93.6  8e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01738  predicted transporter  29.71 
 
 		 452 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.375088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0917  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 469 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01726  hypothetical protein  29.71 
 
 		 452 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.448165  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1853  major facilitator family transporter  29.71 
 
 		 452 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0220731  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  26.26 
 
 		 477 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0866  general substrate transporter  27.16 
 
 		 458 aa  92.8  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.580989  normal  0.629225 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  28.54 
 
 		 442 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>