24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2477 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3870  hypothetical protein  60.83 
 
 		 743 aa  884    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2477  hypothetical protein  100 
 
 		 763 aa  1575    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0815  hypothetical protein  61.74 
 
 		 760 aa  888    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0810  hypothetical protein  50.58 
 
 		 658 aa  593  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1200  hypothetical protein  52.24 
 
 		 640 aa  595  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000043038  normal  0.447188 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3875  hypothetical protein  50.5 
 
 		 659 aa  592  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5604  hypothetical protein  39.85 
 
 		 772 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4500  hypothetical protein  41.07 
 
 		 748 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.764548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0820  hypothetical protein  44.26 
 
 		 761 aa  501  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  48.33 
 
 		 1107 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3464  hypothetical protein  51.61 
 
 		 524 aa  66.2  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242954  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2851  hypothetical protein  52.73 
 
 		 765 aa  66.6  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.215576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  26.52 
 
 		 1086 aa  64.7  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5274  alpha-L-rhamnosidase  43.86 
 
 		 897 aa  63.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  23.57 
 
 		 1276 aa  61.2  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3739  hypothetical protein  50.94 
 
 		 128 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  22.71 
 
 		 1141 aa  59.7  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2219  hypothetical protein  44.64 
 
 		 184 aa  59.7  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1378  hypothetical protein  44.83 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  40.35 
 
 		 818 aa  54.7  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1593  hypothetical protein  26.53 
 
 		 326 aa  50.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559192  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3180  hypothetical protein  34.88 
 
 		 170 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3428  hypothetical protein  35.42 
 
 		 720 aa  47.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.660009  hitchhiker  0.0000342661 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  29.38 
 
 		 801 aa  44.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>