212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2457 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  100 
 
 		 249 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0757  tol-pal system protein YbgF  89.16 
 
 		 252 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677323  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  88.76 
 
 		 249 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2589  tol-pal system protein YbgF  75.1 
 
 		 249 aa  388  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0692  tol-pal system protein YbgF  75.1 
 
 		 249 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000467208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0675  hypothetical protein  75.5 
 
 		 249 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0840445  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  77.91 
 
 		 249 aa  381  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  76.71 
 
 		 249 aa  374  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  76.71 
 
 		 249 aa  374  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  76.71 
 
 		 249 aa  374  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  76.71 
 
 		 249 aa  374  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  76.71 
 
 		 249 aa  374  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  76.71 
 
 		 249 aa  374  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0767  tol-pal system protein YbgF  75.1 
 
 		 249 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0348274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0315  hypothetical protein  75.1 
 
 		 249 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00113686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0798  hypothetical protein  75.1 
 
 		 249 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00161054  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3887  hypothetical protein  75.1 
 
 		 249 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  77.17 
 
 		 234 aa  360  1e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  58.47 
 
 		 252 aa  292  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  56.52 
 
 		 252 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  55.86 
 
 		 274 aa  279  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  56.97 
 
 		 261 aa  274  8e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  56.56 
 
 		 261 aa  272  3e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  54.07 
 
 		 284 aa  266  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  43.48 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  42.86 
 
 		 253 aa  201  9e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0273  TPR repeat-containing protein  42.39 
 
 		 243 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0105531  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  43.48 
 
 		 259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0301  tol-pal system protein YbgF  41.98 
 
 		 243 aa  194  9e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.658955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3396  tol-pal system protein YbgF  39.45 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14649  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3404  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 268 aa  192  6e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  41.95 
 
 		 261 aa  184  9e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  41.95 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  41.74 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  38.93 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  40 
 
 		 243 aa  168  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  37.77 
 
 		 265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1942  tol-pal system protein YbgF  36.4 
 
 		 283 aa  148  9e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  30.9 
 
 		 304 aa  142  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  34.4 
 
 		 265 aa  139  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0780  tol-pal system protein YbgF  32.71 
 
 		 265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2337  tetratricopeptide region  30.31 
 
 		 274 aa  121  9e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123403  normal  0.0632651 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  30.45 
 
 		 271 aa  108  6e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  31.22 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  28.04 
 
 		 265 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  30 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  30.45 
 
 		 272 aa  105  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  26.84 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 257 aa  99  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  31.16 
 
 		 273 aa  92.4  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  30.41 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  30.41 
 
 		 268 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  28.16 
 
 		 276 aa  89.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  29.38 
 
 		 268 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  30.24 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  29.03 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  28.3 
 
 		 279 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  29 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  28.08 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  27.15 
 
 		 322 aa  82  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  29.27 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  27.23 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  29.41 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  23.46 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  33.91 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2536  tol-pal system protein YbgF  26.73 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000911459  hitchhiker  0.000142623 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1744  Tol-Pal system YbgF  26.73 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000201827  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  27.45 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  29.79 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1748  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000756054  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1529  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  normal  0.395847 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  32.79 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  32.79 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  35.92 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  32.79 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000136736  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2746  hypothetical protein  27.09 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  26.77 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  34.95 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1787  tol-pal system protein YbgF  26.24 
 
 		 249 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000124758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  28.72 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1609  tetratricopeptide domain-containing protein  26.96 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000616267  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2529  hypothetical protein  26.07 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000104047  normal  0.0224917 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  24.65 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2219  tetratricopeptide domain-containing protein  26.15 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85463  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  23.92 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  34.65 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  34.65 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  34.65 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  34.65 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  34.65 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2366  hypothetical protein  25.59 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000582291  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2438  hypothetical protein  25.59 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000167584  normal  0.413869 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  25.69 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  33.01 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  33.01 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>