More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2273 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2273  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 246 aa  497  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  0.452458 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0171  short chain dehydrogenase  64.63 
 
 		 246 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.808724 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3786  short chain dehydrogenase  63.01 
 
 		 246 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0896  short chain dehydrogenase  62.6 
 
 		 246 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2301  short chain dehydrogenase  57.32 
 
 		 246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00458311  hitchhiker  0.00750193 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2567  short chain dehydrogenase  56.28 
 
 		 245 aa  278  5e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6249  short chain dehydrogenase  56.68 
 
 		 245 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.69 
 
 		 248 aa  256  3e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0498  short chain dehydrogenase  56.1 
 
 		 243 aa  248  6e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.795397 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.41 
 
 		 254 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.904003  normal  0.571542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1708  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 		 250 aa  198  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.361807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4050  short chain dehydrogenase  39.02 
 
 		 243 aa  192  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1219  short chain dehydrogenase  38.06 
 
 		 243 aa  192  5e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 		 247 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.500614 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1950  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.35 
 
 		 255 aa  188  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0143  short chain dehydrogenase  42.21 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2832  short chain dehydrogenase  43.03 
 
 		 244 aa  185  6e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0580098  normal  0.214495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.38 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 		 249 aa  181  9.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.726547  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 		 245 aa  171  6.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2164  short chain dehydrogenase  41.7 
 
 		 247 aa  169  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1026  short chain dehydrogenase  40.48 
 
 		 270 aa  169  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.969015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5791  short chain dehydrogenase  42.91 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1597  short chain dehydrogenase  44.08 
 
 		 245 aa  161  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139184  normal  0.109463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7180  short chain dehydrogenase  41.94 
 
 		 248 aa  159  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3976  short chain dehydrogenase  46.5 
 
 		 245 aa  158  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00930617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.58 
 
 		 244 aa  152  5e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 		 252 aa  152  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 		 251 aa  146  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22830  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  37.45 
 
 		 247 aa  146  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.702609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 		 247 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0680281  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.362714  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 		 254 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12109  short-chain type dehydrogenase  37.34 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0969854  normal  0.809118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03335  putative oxidoreductase  32.4 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 		 247 aa  125  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286474  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01390  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  34.15 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.253341 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 		 252 aa  122  5e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5001  short chain dehydrogenase  34.65 
 
 		 256 aa  118  9e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5382  short chain dehydrogenase  34.65 
 
 		 256 aa  118  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5089  short chain dehydrogenase  34.65 
 
 		 256 aa  118  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  30.89 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13470  short chain dehydrogenase  29.39 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2462  putative short chain dehydrogenase  36 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13825  short chain dehydrogenase  34.01 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4895  short chain dehydrogenase  31.12 
 
 		 258 aa  111  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000739396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 		 258 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5628  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1759  hypothetical protein  33.61 
 
 		 240 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1177  short chain dehydrogenase  33.07 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0117  short chain dehydrogenase  29.84 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1759  hypothetical protein  33.61 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.53 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2218  short chain dehydrogenase  29.96 
 
 		 249 aa  106  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2452  short chain dehydrogenase  31.98 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3806  short chain dehydrogenase  31.97 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.187681 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3863  short chain dehydrogenase  29.6 
 
 		 260 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 		 249 aa  101  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.786749  normal  0.588294 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396452 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4129  short chain dehydrogenase  30.58 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3487  short chain dehydrogenase  30.61 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.841301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.71 
 
 		 241 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.914636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 		 247 aa  99.4  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.59 
 
 		 253 aa  99  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0427  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.51 
 
 		 256 aa  99  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 		 249 aa  99  7e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000668025  hitchhiker  0.00000185563 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1490  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 		 239 aa  99  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5291  short chain dehydrogenase  28.63 
 
 		 260 aa  98.6  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.75 
 
 		 249 aa  98.2  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2785  short chain dehydrogenase  29.58 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.73728  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0632  short chain dehydrogenase  27.94 
 
 		 249 aa  95.1  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4782  short chain dehydrogenase  31.08 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.75 
 
 		 257 aa  94.4  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3014  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  30.31 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.698047  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.21 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.261261  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0151  short chain dehydrogenase  28.57 
 
 		 261 aa  93.2  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1201  short chain dehydrogenase  30.12 
 
 		 289 aa  93.2  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0718298  normal  0.0224844 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1537  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.69 
 
 		 245 aa  92.8  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1188  short chain dehydrogenase  29.72 
 
 		 291 aa  92.8  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0152839  normal  0.145128 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.74 
 
 		 230 aa  92.4  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.95 
 
 		 238 aa  92.4  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.88847  normal  0.739494 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0352  short chain dehydrogenase  28.51 
 
 		 259 aa  92.4  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0885  short chain dehydrogenase  26.72 
 
 		 250 aa  92  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4421  short chain dehydrogenase  28.45 
 
 		 249 aa  92  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.794825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>