More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2245 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  100 
 
 
338 aa  682    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  86.06 
 
 
359 aa  578  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3676  LacI family transcription regulator  85.45 
 
 
323 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  43.12 
 
 
330 aa  301  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4573  LacI family transcription regulator  47.26 
 
 
326 aa  280  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0936264  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1273  transcriptional regulator, LacI family  43.6 
 
 
326 aa  265  7e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3061  transcriptional regulator, LacI family  43.16 
 
 
326 aa  264  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  42.12 
 
 
335 aa  258  7e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  42.73 
 
 
335 aa  255  8e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  42.12 
 
 
335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1193  transcriptional regulator, LacI family  43.14 
 
 
326 aa  248  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.502548  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  41.72 
 
 
337 aa  245  9e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  40.98 
 
 
342 aa  236  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1063  LacI family transcription regulator  41.46 
 
 
325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  39.76 
 
 
342 aa  231  9e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  39.76 
 
 
342 aa  231  9e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4613  LacI family transcription regulator  40.43 
 
 
335 aa  229  7e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0168  DNA-binding transcriptional regulator CytR  39.34 
 
 
347 aa  228  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  37.58 
 
 
335 aa  228  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.31 
 
 
339 aa  227  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  39.14 
 
 
335 aa  226  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0182  DNA-binding transcriptional regulator CytR  39.45 
 
 
347 aa  225  9e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  41.21 
 
 
332 aa  223  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  37.5 
 
 
343 aa  222  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  37.5 
 
 
343 aa  222  7e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  37.5 
 
 
341 aa  222  8e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  37.5 
 
 
341 aa  222  8e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  37.5 
 
 
341 aa  222  8e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  37.5 
 
 
341 aa  222  8e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.76111 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  37.5 
 
 
341 aa  222  8e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  37.5 
 
 
341 aa  222  8e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5391  DNA-binding transcriptional regulator CytR  37.96 
 
 
330 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.504328  normal  0.696689 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  40.98 
 
 
335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  38.82 
 
 
349 aa  219  5e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  38.91 
 
 
334 aa  218  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4424  DNA-binding transcriptional regulator CytR  37 
 
 
341 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4426  DNA-binding transcriptional regulator CytR  37 
 
 
341 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4494  DNA-binding transcriptional regulator CytR  37 
 
 
341 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4310  DNA-binding transcriptional regulator CytR  37 
 
 
341 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4116  alanine racemase  41.59 
 
 
334 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4340  DNA-binding transcriptional regulator CytR  37 
 
 
341 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.302828  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4039  DNA-binding transcriptional regulator CytR  37.92 
 
 
341 aa  217  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3795  DNA-binding transcriptional regulator CytR  39.45 
 
 
356 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1484  transcriptional regulator, LacI family  34.77 
 
 
331 aa  215  9e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1637  LacI family transcription regulator  39.88 
 
 
337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.455476 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  39.88 
 
 
349 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0116  DNA-binding transcriptional regulator CytR  38.91 
 
 
356 aa  212  7.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  35.54 
 
 
332 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  35.54 
 
 
332 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  35.24 
 
 
332 aa  210  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  35.24 
 
 
332 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.25 
 
 
337 aa  210  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  35.54 
 
 
332 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  37.27 
 
 
346 aa  209  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  35.54 
 
 
332 aa  209  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  35.24 
 
 
332 aa  209  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  35.24 
 
 
332 aa  209  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  35.24 
 
 
332 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  35.24 
 
 
332 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0506  LacI family transcription regulator  37.73 
 
 
332 aa  208  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549777  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.45 
 
 
338 aa  207  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  34.44 
 
 
332 aa  206  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  37.13 
 
 
368 aa  206  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  37.12 
 
 
344 aa  205  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.93 
 
 
342 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.945809  hitchhiker  0.0011577 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4766  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.59 
 
 
336 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148883  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1050  transcriptional regulator, LacI family  40.84 
 
 
335 aa  202  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.107431  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  37.73 
 
 
337 aa  202  7e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  35.74 
 
 
336 aa  202  7e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  35.98 
 
 
348 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  34.24 
 
 
331 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  37.8 
 
 
353 aa  200  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  35.26 
 
 
332 aa  200  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  34.95 
 
 
332 aa  199  6e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  34.95 
 
 
330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  39.7 
 
 
348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  37.58 
 
 
352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2904  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.65 
 
 
339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  33.44 
 
 
355 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  32.72 
 
 
335 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0294  LacI family transcription regulator  34.04 
 
 
335 aa  193  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.28119  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2680  alanine racemase  37.73 
 
 
338 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.769144  normal  0.967228 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1243  LacI family transcription regulator  38.04 
 
 
339 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4839  putative LacI family transcriptional regulator  38.84 
 
 
358 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0301104 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  32.23 
 
 
342 aa  192  5e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  38.18 
 
 
333 aa  192  7e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  36.36 
 
 
332 aa  192  9e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0343  transcriptional regulator, LacI family  34.52 
 
 
327 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  31.91 
 
 
331 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  32.04 
 
 
340 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  33.03 
 
 
332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  34.94 
 
 
331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.12 
 
 
352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3410  transcriptional regulator, LacI family  38.04 
 
 
343 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  35.35 
 
 
329 aa  190  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3708  transcriptional regulator, LacI family  37.73 
 
 
343 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36497  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.13 
 
 
336 aa  189  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 
335 aa  189  5.999999999999999e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0524  alanine racemase  40.72 
 
 
339 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  36.09 
 
 
334 aa  189  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>