217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2182 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2182  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
270 aa  542  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00977715 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1066  transcriptional regulator, XRE family  87.41 
 
 
270 aa  441  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3414  XRE family transcriptional regulator  87.78 
 
 
270 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5755  XRE family transcriptional regulator  81.92 
 
 
269 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2471  XRE family transcriptional regulator  82.31 
 
 
269 aa  410  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0866  XRE family transcriptional regulator  82.69 
 
 
269 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692318  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2337  XRE family transcriptional regulator  82.31 
 
 
269 aa  410  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146062 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1226  putative DNA-binding protein  81.23 
 
 
271 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.179938  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1067  hypothetical protein  81.23 
 
 
271 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1073  hypothetical protein  81.23 
 
 
271 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2432  XRE family transcriptional regulator  80.77 
 
 
269 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.732467  normal  0.678442 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0725  hypothetical protein  80.84 
 
 
271 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0212373  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1816  XRE family transcriptional regulator  80.38 
 
 
269 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2428  XRE family transcriptional regulator  80.38 
 
 
269 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2289  hypothetical protein  80.84 
 
 
271 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2996  hypothetical protein  80.84 
 
 
271 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1603  hypothetical protein  80.46 
 
 
271 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0869  transcriptional regulator  79.55 
 
 
271 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.939079  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1007  XRE family transcriptional regulator  49.41 
 
 
284 aa  249  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3439  transcriptional regulator, XRE family  49.8 
 
 
266 aa  248  5e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2728  DNA-binding protein  51.71 
 
 
282 aa  248  6e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.925835  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3292  helix-turn-helix domain protein  50.2 
 
 
266 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0773  transcriptional regulator, XRE family  52.16 
 
 
270 aa  234  9e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0622  hypothetical protein  52.16 
 
 
270 aa  234  9e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0588  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  58.63 
 
 
280 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2362  helix-turn-helix domain-containing protein  54.37 
 
 
257 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298592  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0530  XRE family transcriptional regulator  55.3 
 
 
264 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0566101  hitchhiker  0.0000527807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0248  helix-turn-helix domain protein  57.14 
 
 
275 aa  216  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0240027  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  43.82 
 
 
280 aa  185  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1824  transcriptional regulator, XRE family  41.96 
 
 
259 aa  181  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.375176 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  39.85 
 
 
301 aa  176  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  41.7 
 
 
283 aa  176  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  41.73 
 
 
280 aa  175  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  40.55 
 
 
303 aa  168  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1269  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2494  helix-turn-helix domain protein  39.68 
 
 
265 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106258  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  33.72 
 
 
276 aa  159  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  40.52 
 
 
317 aa  159  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2137  helix-turn-helix domain protein  38.62 
 
 
283 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.291672  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  40.94 
 
 
279 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4741  XRE family transcriptional regulator  40.89 
 
 
263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3425  XRE family transcriptional regulator  40.89 
 
 
263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  38.96 
 
 
295 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1979  transcriptional regulator, XRE family  37.98 
 
 
277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4092  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 
263 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  38.1 
 
 
280 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3211  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
263 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.663604  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6148  XRE family transcriptional regulator  39.2 
 
 
284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.171229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3948  hypothetical protein  39.68 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00019593  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  38.55 
 
 
299 aa  145  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4269  helix-turn-helix domain protein  37.8 
 
 
279 aa  145  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0718578  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4526  XRE family transcriptional regulator  40.08 
 
 
257 aa  145  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421002  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3997  XRE family transcriptional regulator  37.9 
 
 
278 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  38.08 
 
 
313 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  37.8 
 
 
275 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2624  transcriptional regulator, XRE family  38.15 
 
 
274 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 
297 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2807  transcriptional regulator, XRE family  36.95 
 
 
258 aa  142  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  41.44 
 
 
303 aa  142  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  38.65 
 
 
276 aa  142  8e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3276  transcriptional regulator, XRE family  38.2 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3598  transcriptional regulator, XRE family  38.95 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  39.42 
 
 
289 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3367  transcriptional regulator, XRE family  35.97 
 
 
278 aa  139  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2287  transcriptional regulator, XRE family  37.85 
 
 
278 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  38.37 
 
 
289 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  38.37 
 
 
289 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  36.86 
 
 
293 aa  136  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  37.98 
 
 
293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  36.15 
 
 
318 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  39.13 
 
 
277 aa  135  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2467  XRE family transcriptional regulator  36.19 
 
 
285 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0930  helix-turn-helix domain-containing protein  34.5 
 
 
297 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971481  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2759  transcriptional regulator, XRE family  36.25 
 
 
278 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468237  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5385  XRE family transcriptional regulator  37.6 
 
 
289 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49793  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  41.3 
 
 
284 aa  132  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1115  XRE family transcriptional regulator  38.06 
 
 
312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  40.6 
 
 
286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  33.47 
 
 
282 aa  129  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5666  putative transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 
273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2768  XRE family transcriptional regulator  40.44 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4719  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3644  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4317  helix-turn-helix domain protein  35.22 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  33.73 
 
 
292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  36.86 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8368  XRE family transcriptional regulator  35.25 
 
 
288 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1162  XRE family transcriptional regulator  34.77 
 
 
281 aa  126  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157815  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3876  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 
285 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  37.19 
 
 
307 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1066  helix-turn-helix domain-containing protein  36.78 
 
 
289 aa  125  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1431  XRE family transcriptional regulator  35.04 
 
 
303 aa  125  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1995  helix-turn-helix domain protein  38.14 
 
 
289 aa  125  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2702  helix-turn-helix domain protein  37.87 
 
 
284 aa  125  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  38 
 
 
281 aa  125  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7525  helix-turn-helix domain protein  33.08 
 
 
294 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5170  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 
280 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.624653  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  35.9 
 
 
290 aa  124  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  37.8 
 
 
281 aa  124  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7046  helix-turn-helix domain protein  39.66 
 
 
278 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>