More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2167 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2167  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 369 aa  741    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159789  hitchhiker  0.00000436019 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6806  OmpC family outer membrane porin  76.24 
 
 		 383 aa  567  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3394  OmpC family outer membrane porin  79.9 
 
 		 383 aa  564  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1119  outer membrane porin, OmpC family  79.63 
 
 		 383 aa  565  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.561071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0884  porin  70.19 
 
 		 362 aa  501  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1091  putative outer membrane porin  69.65 
 
 		 363 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0743  outer membrane porin, putative  69.65 
 
 		 362 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000425296  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1086  putative outer membrane porin  69.65 
 
 		 362 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420468  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1244  porin  69.65 
 
 		 362 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289233  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2270  putative outer membrane porin  69.65 
 
 		 362 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1583  putative outer membrane porin  69.65 
 
 		 362 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0360665  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3014  putative outer membrane porin  69.65 
 
 		 362 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000144829  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0843  OmpC family outer membrane porin  65.61 
 
 		 375 aa  472  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0712597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0880  outer membrane protein (porin)-like protein  67.98 
 
 		 360 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2320  outer membrane protein (porin)-like protein  65.92 
 
 		 360 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0798185  normal  0.76892 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2410  outer membrane protein (porin)-like protein  65.18 
 
 		 359 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.08631  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1798  outer membrane protein (porin)-like  65.18 
 
 		 359 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.660059  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5737  outer membrane protein (porin)-like  66.02 
 
 		 359 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0160198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2455  outer membrane protein (porin)-like protein  66.01 
 
 		 361 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00019464  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2414  outer membrane protein (porin)-like protein  65.18 
 
 		 358 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200003  decreased coverage  0.00381795 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3611  porin  46.23 
 
 		 370 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1412  porin  45.77 
 
 		 371 aa  280  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170387  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1352  outer membrane porin  46.03 
 
 		 371 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0561388  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2592  outer membrane porin protein  46.03 
 
 		 371 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1437  outer membrane porin  46.03 
 
 		 371 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817141  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1242  putative outer membrane porin  45.77 
 
 		 371 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0213  putative outer membrane porin  45.77 
 
 		 371 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0486  putative outer membrane porin  45.77 
 
 		 371 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.278408  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1086  putative outer membrane porin  45.77 
 
 		 371 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1296  outer membrane protein (porin)  46.11 
 
 		 368 aa  275  9e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5754  porin  45.83 
 
 		 368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.363123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3975  porin  46.39 
 
 		 369 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0863036  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4550  porin  45.83 
 
 		 368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.537681 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4439  porin  46.39 
 
 		 369 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.989602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4097  porin  45.83 
 
 		 367 aa  272  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5307  porin Gram-negative type  45.36 
 
 		 361 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3818  porin  44.88 
 
 		 369 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2589  porin Gram-negative type  42.36 
 
 		 358 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2999  porin Gram-negative type  41.49 
 
 		 354 aa  252  7e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.959541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2271  porin  42.09 
 
 		 355 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0154536  hitchhiker  0.000000413543 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2760  putative porin signal peptide protein  42.17 
 
 		 353 aa  236  6e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102409  normal  0.556039 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2136  porin signal peptide protein  41.43 
 
 		 352 aa  229  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1313  OmpC family outer membrane porin  39.4 
 
 		 399 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0122268  normal  0.936999 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1174  porin  38.44 
 
 		 363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2314  porin  40.45 
 
 		 350 aa  203  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224998 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6941  outer membrane protein (porin)  39.73 
 
 		 373 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000000310318  normal  0.643054 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2933  porin  38.14 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435653 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1236  outer membrane porin lipoprotein transmembrane  39.4 
 
 		 369 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7242  outer membrane protein (porin)  34.96 
 
 		 372 aa  186  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264722  normal  0.33817 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3132  porin  32.61 
 
 		 376 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.011649  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  34.23 
 
 		 357 aa  139  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  31.13 
 
 		 355 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  31.13 
 
 		 355 aa  139  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  31.03 
 
 		 355 aa  136  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  31.97 
 
 		 367 aa  136  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  33.33 
 
 		 368 aa  135  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  33.33 
 
 		 358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  32.35 
 
 		 355 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  32.46 
 
 		 352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  31.99 
 
 		 352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  34.33 
 
 		 368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  32.36 
 
 		 377 aa  125  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  31.83 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  31.83 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  31.65 
 
 		 363 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  33.74 
 
 		 383 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0181  outer membrane protein (porin)  34.73 
 
 		 385 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  33.25 
 
 		 362 aa  122  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  32.11 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  33.68 
 
 		 449 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  31.84 
 
 		 371 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  33.6 
 
 		 363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  32.81 
 
 		 363 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  32.81 
 
 		 363 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  31.61 
 
 		 353 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  32.34 
 
 		 363 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  32.02 
 
 		 363 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  32.02 
 
 		 363 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  32.02 
 
 		 363 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  32.42 
 
 		 353 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  33.58 
 
 		 376 aa  116  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  33.16 
 
 		 367 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2365  porin  30.56 
 
 		 379 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1072  outer membrane porin  30.56 
 
 		 379 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  32.58 
 
 		 387 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  31.59 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  32.49 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  31.59 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  31.97 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  31.25 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  31.97 
 
 		 392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4230  outer membrane porin  31.11 
 
 		 379 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000540205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  31.25 
 
 		 386 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  37.39 
 
 		 383 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  31.07 
 
 		 361 aa  113  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  36.55 
 
 		 384 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  30.79 
 
 		 354 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4837  outer membrane protein, (porin)  30.5 
 
 		 374 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00816794 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  31.19 
 
 		 383 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  31.77 
 
 		 358 aa  112  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>