More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2132 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 198 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  65.26 
 
 		 191 aa  254  8e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  64.92 
 
 		 192 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  63.87 
 
 		 192 aa  247  9e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  63.87 
 
 		 192 aa  247  9e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  62.83 
 
 		 222 aa  245  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  63.16 
 
 		 193 aa  244  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  62.11 
 
 		 191 aa  239  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  62.83 
 
 		 191 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  60.64 
 
 		 196 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  60.64 
 
 		 196 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  60.64 
 
 		 196 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  60.41 
 
 		 197 aa  233  9e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  62.23 
 
 		 193 aa  233  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  59.9 
 
 		 197 aa  230  8.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  59.9 
 
 		 197 aa  230  8.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  58.73 
 
 		 194 aa  229  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  53.06 
 
 		 196 aa  214  5e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  53.06 
 
 		 196 aa  214  7e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  53.06 
 
 		 196 aa  214  9e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  53.06 
 
 		 196 aa  214  9e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  53.06 
 
 		 196 aa  214  9e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  53.06 
 
 		 196 aa  214  9e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  52.55 
 
 		 196 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  52.55 
 
 		 196 aa  212  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  52.55 
 
 		 196 aa  212  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  52.43 
 
 		 189 aa  177  7e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  48.89 
 
 		 185 aa  169  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  51.38 
 
 		 217 aa  168  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  47.87 
 
 		 192 aa  167  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  47.78 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  51.33 
 
 		 190 aa  154  9e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  44.68 
 
 		 190 aa  148  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  41.94 
 
 		 202 aa  143  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  41.4 
 
 		 318 aa  128  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  39.78 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  39.56 
 
 		 181 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  37.84 
 
 		 197 aa  114  8.999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  39.57 
 
 		 186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  38.33 
 
 		 180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  41.94 
 
 		 182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  40.82 
 
 		 197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  36.26 
 
 		 199 aa  111  6e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  39.57 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  40 
 
 		 197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  40.62 
 
 		 190 aa  108  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  38.17 
 
 		 198 aa  107  9.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  39.06 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  37.7 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  35.71 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  39.04 
 
 		 204 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  41.18 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  39.04 
 
 		 204 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  41.18 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  38.74 
 
 		 219 aa  105  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  34.36 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  39.01 
 
 		 183 aa  105  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  36.36 
 
 		 203 aa  104  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  36.87 
 
 		 193 aa  104  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  36.56 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  36.26 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  37.23 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  38.12 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  39.07 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  42.76 
 
 		 307 aa  100  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  42.76 
 
 		 307 aa  100  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  36.56 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  36.46 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  35.2 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  38.74 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  36.09 
 
 		 176 aa  99.8  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  36.26 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  40.32 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  38.04 
 
 		 201 aa  99  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  34.92 
 
 		 188 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  38.59 
 
 		 197 aa  99  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  38.71 
 
 		 184 aa  99  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  37.1 
 
 		 201 aa  98.6  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  37.57 
 
 		 186 aa  99  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3655  Resolvase domain protein  37.43 
 
 		 212 aa  99  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0554731  normal  0.301287 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  36.65 
 
 		 204 aa  98.6  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  36.65 
 
 		 204 aa  98.6  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  36.65 
 
 		 204 aa  98.6  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  34.92 
 
 		 187 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  34.92 
 
 		 190 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  35.16 
 
 		 184 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3338  resolvase domain-containing protein  41.18 
 
 		 186 aa  98.2  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  36.36 
 
 		 188 aa  98.2  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  34.02 
 
 		 188 aa  97.8  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  35.18 
 
 		 196 aa  97.8  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  36.84 
 
 		 205 aa  97.8  9e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  34.97 
 
 		 186 aa  97.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  35.52 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  34.62 
 
 		 184 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  33.16 
 
 		 196 aa  96.7  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  34.08 
 
 		 184 aa  96.7  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  35.29 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  33.14 
 
 		 188 aa  97.1  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  35.96 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>