More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2117 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  89.95 
 
 		 398 aa  749    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 398 aa  815    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  81.66 
 
 		 393 aa  652    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  81.66 
 
 		 393 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  81.66 
 
 		 393 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  82.41 
 
 		 393 aa  679    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  82.16 
 
 		 393 aa  679    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  82.66 
 
 		 393 aa  682    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  82.91 
 
 		 393 aa  682    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  81.66 
 
 		 393 aa  674    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  89.2 
 
 		 398 aa  741    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  82.16 
 
 		 393 aa  679    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  81.66 
 
 		 393 aa  673    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  82.91 
 
 		 393 aa  682    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  81.66 
 
 		 393 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  82.16 
 
 		 393 aa  679    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  81.66 
 
 		 393 aa  653    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  81.66 
 
 		 393 aa  652    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  63.57 
 
 		 406 aa  535  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  65.03 
 
 		 396 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  65.28 
 
 		 417 aa  531  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  65.03 
 
 		 396 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  62.63 
 
 		 404 aa  527  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  65.8 
 
 		 394 aa  522  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  56.17 
 
 		 407 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  56.1 
 
 		 406 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  52.31 
 
 		 420 aa  409  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  53.71 
 
 		 450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  53.91 
 
 		 426 aa  402  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  55.86 
 
 		 406 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 426 aa  402  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  53.81 
 
 		 398 aa  395  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0186  valine-pyruvate aminotransferase  53.25 
 
 		 402 aa  389  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.39776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  53.99 
 
 		 416 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0362  GntR family transcriptional regulator  53.21 
 
 		 426 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  44.82 
 
 		 396 aa  363  2e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  47.18 
 
 		 397 aa  362  4e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 383 aa  359  5e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 395 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 395 aa  356  5e-97  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 395 aa  356  5e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 405 aa  353  2e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  49 
 
 		 406 aa  350  2e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  44.56 
 
 		 401 aa  350  3e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 395 aa  350  3e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  48.58 
 
 		 395 aa  343  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  44.99 
 
 		 394 aa  341  1e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  45.05 
 
 		 394 aa  341  1e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  41.34 
 
 		 397 aa  338  7e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  45.69 
 
 		 388 aa  333  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 403 aa  330  2e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  46.98 
 
 		 377 aa  329  6e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 393 aa  324  1e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  40.21 
 
 		 395 aa  324  1e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  42.08 
 
 		 405 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  41.24 
 
 		 400 aa  322  6e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 408 aa  317  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 399 aa  317  3e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  42.33 
 
 		 410 aa  316  5e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  41.01 
 
 		 400 aa  316  5e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 410 aa  315  6e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  42.33 
 
 		 410 aa  315  8e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  47.89 
 
 		 400 aa  312  4.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  41.81 
 
 		 398 aa  311  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2486  putative transcriptional regulator, GntR family  40.49 
 
 		 406 aa  310  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 397 aa  308  1.0000000000000001e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  40.86 
 
 		 395 aa  307  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  42 
 
 		 404 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  39.69 
 
 		 433 aa  306  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 398 aa  306  5.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  40.36 
 
 		 395 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  40.87 
 
 		 397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  41.16 
 
 		 400 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 414 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3004  aminotransferase, class I and II  42.53 
 
 		 411 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.184923  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 399 aa  302  6.000000000000001e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  40.36 
 
 		 399 aa  301  1e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  38.56 
 
 		 386 aa  300  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 340 aa  300  4e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 437 aa  298  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 395 aa  298  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  38.72 
 
 		 435 aa  298  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  41.03 
 
 		 402 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  41.03 
 
 		 402 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  38.97 
 
 		 404 aa  295  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  37.79 
 
 		 446 aa  295  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  37.44 
 
 		 433 aa  294  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 413 aa  291  1e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 399 aa  290  4e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  38.83 
 
 		 397 aa  289  5.0000000000000004e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 397 aa  289  6e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 416 aa  288  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  37.62 
 
 		 463 aa  288  1e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  37.79 
 
 		 436 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  45.13 
 
 		 402 aa  286  4e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  38.94 
 
 		 441 aa  286  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  37.6 
 
 		 401 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  42.05 
 
 		 402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  36.92 
 
 		 438 aa  283  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>