46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1911 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1911  putative phage repressor  100 
 
 		 331 aa  677    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal  0.0833716 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2380  peptidase S24, S26A and S26B  42.34 
 
 		 421 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000103067  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  44.53 
 
 		 240 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3217  putative phage repressor  41.09 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111001  normal  0.682159 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1406  repressor protein  30.92 
 
 		 211 aa  98.2  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0402463  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 224 aa  93.2  5e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3556  repressor protein CI  36.59 
 
 		 235 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860167  hitchhiker  9.00539e-18 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  36.8 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  35.2 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  28.19 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  35.2 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  34.4 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  32.8 
 
 		 217 aa  67  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  35.56 
 
 		 210 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  32.56 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0734  putative phage repressor  26.72 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  34.44 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 212 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  31.58 
 
 		 214 aa  62  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  29.1 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  46.38 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  29.1 
 
 		 210 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  29.55 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0018  putative phage repressor  35.58 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  27.94 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0133  putative phage repressor  28.68 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.149707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3831  putative phage repressor  35.2 
 
 		 246 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0743  S24 family peptidase  30.71 
 
 		 218 aa  51.2  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0792  S24 family peptidase  30.71 
 
 		 218 aa  51.2  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.597552  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  34.41 
 
 		 205 aa  50.4  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  25.68 
 
 		 220 aa  49.3  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  23.32 
 
 		 209 aa  49.3  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  24.87 
 
 		 209 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 209 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0218  putative phage repressor  27.84 
 
 		 225 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.528514  normal  0.247085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8300  nner membrane protease subunit 1-like protein  34.92 
 
 		 101 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0989  S24 family peptidase  34.83 
 
 		 239 aa  45.4  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1854  putative phage repressor  31.03 
 
 		 241 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0873919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0189  putative phage repressor  27.91 
 
 		 225 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1234  putative prophage repressor  30.48 
 
 		 153 aa  44.3  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000530915  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0805  conserved hypothetical protein, putative peptidase S24  23.48 
 
 		 211 aa  44.3  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  27.37 
 
 		 206 aa  44.3  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0139  putative phage repressor  29.89 
 
 		 215 aa  43.5  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  29.55 
 
 		 292 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  24.3 
 
 		 243 aa  43.1  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>