18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1906 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1906  GP60  100 
 
 		 339 aa  699    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000000738533  normal  0.0210495 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1672  gp60  64.44 
 
 		 311 aa  411  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0382632  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1033  gp60  64.44 
 
 		 311 aa  411  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1036  hypothetical protein  66.67 
 
 		 180 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215145  normal  0.0235886 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3448  hypothetical protein  32.05 
 
 		 237 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2069  hypothetical protein  35.79 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0794  hypothetical protein  38.36 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436094 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6266  hypothetical protein  39.71 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01960  hypothetical protein  38.67 
 
 		 318 aa  50.1  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1053  gifsy-1 prophage PrpO  33.33 
 
 		 327 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0283915  hitchhiker  0.00000186889 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2284  gifsy-1 prophage PrpO  33.33 
 
 		 325 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0857509  normal  0.0949977 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1083  gifsy-1 prophage PrpO  33.33 
 
 		 327 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00906063  hitchhiker  0.00000468495 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1259  phage O family protein  26.35 
 
 		 315 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000280847  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3439  putative transcriptional regulator  22.98 
 
 		 249 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119584  unclonable  9.09525e-17 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1433  phage O protein family  27.06 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000630558  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4446  phage O protein family  26.67 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  unclonable  0.00000000141211 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2834  replication protein O  30.59 
 
 		 294 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119993  normal  0.314144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1318  hypothetical protein  25.23 
 
 		 255 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>