230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1602 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1602  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 306 aa  634    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  80.13 
 
 		 305 aa  510  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.279544  normal  0.182339 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1324  putative myo-inositol catabolism LolE protein  79.68 
 
 		 308 aa  511  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2649  hypothetical protein  80.27 
 
 		 306 aa  501  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0432409  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0911  hypothetical protein  79.6 
 
 		 306 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1442  AP endonuclease  79.6 
 
 		 306 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0438  hypothetical protein  79.6 
 
 		 306 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1653  AP endonuclease  79.6 
 
 		 306 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0724  AP endonuclease  79.6 
 
 		 306 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1829  hypothetical protein  79.26 
 
 		 306 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0766527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1675  AP endonuclease  79.26 
 
 		 306 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173299  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50050  2-keto-myo-inositol dehydratase  61.02 
 
 		 303 aa  391  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3499  iolE protein  61.22 
 
 		 301 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3273  AP endonuclease  61.72 
 
 		 301 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0853475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1301  xylose isomerase domain-containing protein  58.88 
 
 		 309 aa  350  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1340  xylose isomerase domain-containing protein  59.21 
 
 		 309 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0939  xylose isomerase-like TIM barrel  58.55 
 
 		 309 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00907131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1421  xylose isomerase domain-containing protein  58.55 
 
 		 309 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3316  xylose isomerase domain-containing protein  57.43 
 
 		 309 aa  347  1e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1399  xylose isomerase domain-containing protein  58.22 
 
 		 309 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1238  putative myo-inositol catabolism protein  58.42 
 
 		 309 aa  345  6e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4565  xylose isomerase-like TIM barrel  58.22 
 
 		 309 aa  343  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0833957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1894  xylose isomerase domain-containing protein  57.89 
 
 		 309 aa  341  7e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.21993 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0067  xylose isomerase domain-containing protein  58.75 
 
 		 318 aa  341  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0290166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2932  xylose isomerase domain-containing protein  57.95 
 
 		 308 aa  340  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688703 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1342  Myo-inosose-2 dehydratase  56.6 
 
 		 296 aa  335  5e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2995  Myo-inosose-2 dehydratase  55.86 
 
 		 296 aa  334  9e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3333  Myo-inosose-2 dehydratase  54.83 
 
 		 296 aa  331  1e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1596  xylose isomerase domain-containing protein  53.61 
 
 		 310 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3040  xylose isomerase domain-containing protein  54.48 
 
 		 368 aa  323  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1869  AP endonuclease  54.48 
 
 		 350 aa  322  4e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2968  AP endonuclease  54.48 
 
 		 306 aa  321  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0043  xylose isomerase domain-containing protein  51.67 
 
 		 308 aa  300  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  47.32 
 
 		 924 aa  271  9e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2835  xylose isomerase domain-containing protein  48.6 
 
 		 310 aa  265  5.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2325  xylose isomerase domain-containing protein  48.1 
 
 		 303 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1674  xylose isomerase domain-containing protein  45.27 
 
 		 298 aa  260  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4013  Myo-inosose-2 dehydratase  39.12 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3560  xylose isomerase domain-containing protein  41.98 
 
 		 300 aa  236  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1577  myo-inositol catabolism protein  38.05 
 
 		 298 aa  235  6e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.357804  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4213  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.67 
 
 		 340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.22 
 
 		 305 aa  231  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0078  hypothetical protein  40.41 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0086  myo-inositol catabolism protein IolE  39.12 
 
 		 297 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1133  Myo-inosose-2 dehydratase  41.22 
 
 		 305 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459716  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0303  myo-inositol catabolism protein  37.37 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2531  putative IolE protein  37.37 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32551e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2299  myo-inositol catabolism protein  37.02 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0486  putative myo-inositol catabolism protein  40.14 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7800  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  38.7 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4656  xylose isomerase domain-containing protein  37.63 
 
 		 298 aa  223  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2255  myo-inositol catabolism protein  37.37 
 
 		 298 aa  223  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3839  xylose isomerase domain-containing protein  39.86 
 
 		 300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0671  hypothetical protein  40.54 
 
 		 300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0715  hypothetical protein  40.2 
 
 		 300 aa  218  7.999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3285  sugar phosphate isomerase/epimerase, IolE  40.41 
 
 		 302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4017  xylose isomerase domain-containing protein  40.07 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5694  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.61 
 
 		 300 aa  208  7e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1620  hypothetical protein  36.82 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1615  hypothetical protein  36.82 
 
 		 298 aa  203  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4706  inosose dehydratase  36.86 
 
 		 301 aa  195  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000727756  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2336  hypothetical protein  36.96 
 
 		 237 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4190  xylose isomerase-like TIM barrel  36.75 
 
 		 371 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.720259  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2981  Myo-inosose-2 dehydratase  31.58 
 
 		 359 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.833328 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3138  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.58 
 
 		 359 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5989  xylose isomerase domain-containing protein  31.7 
 
 		 312 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  0.171061 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.01 
 
 		 294 aa  139  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4855  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  43.62 
 
 		 205 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0821972  normal  0.0636139 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1696  Myo-inosose-2 dehydratase  28.97 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2612  xylose isomerase domain-containing protein  30.74 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3352  Myo-inosose-2 dehydratase  28.47 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0467219  normal  0.0568196 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1816  xylose isomerase domain-containing protein  29.54 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.670883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4487  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.99 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3969  xylose isomerase domain-containing protein  29.26 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0171269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3346  xylose isomerase-like TIM barrel  28.42 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0217845  normal  0.180586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0947  xylose isomerase-like TIM barrel  29.21 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1429  xylose isomerase domain-containing protein  29.21 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.66 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1247  putative myo-inositol catabolism protein  28.09 
 
 		 313 aa  102  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1362  Myo-inosose-2 dehydratase  29.45 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1407  xylose isomerase domain-containing protein  28.37 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1886  xylose isomerase domain-containing protein  28.38 
 
 		 308 aa  99.4  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206917 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7455  hypothetical protein  28.79 
 
 		 292 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1348  xylose isomerase domain-containing protein  28.72 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4573  xylose isomerase-like TIM barrel  28.03 
 
 		 308 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3079  Myo-inosose-2 dehydratase  30.74 
 
 		 287 aa  96.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.977094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50250  hypothetical protein  27.59 
 
 		 307 aa  96.3  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  29.57 
 
 		 271 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1271  xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.24 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2054  xylose isomerase domain-containing protein  25.17 
 
 		 308 aa  93.6  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8495  Myo-inosose-2 dehydratase  29.09 
 
 		 311 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1309  xylose isomerase domain-containing protein  27.68 
 
 		 308 aa  92.8  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0386  xylose isomerase domain-containing protein  28.11 
 
 		 306 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4055  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.17 
 
 		 297 aa  92.4  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1722  xylose isomerase-like TIM barrel  27.31 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.688264  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3595  Myo-inosose-2 dehydratase  26.77 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0273  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.27 
 
 		 278 aa  89.7  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1422  xylose isomerase-like  26.71 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0452084  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1981  Myo-inosose-2 dehydratase  27.27 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.162742  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3018  hypothetical protein  25.09 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.130345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>