More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1573 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1573  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 281 aa  565  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2771  alpha/beta hydrolase fold  83.7 
 
 		 277 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1356  Alpha/beta hydrolase fold protein  80 
 
 		 277 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.965846 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1561  hydrolase protein  58.65 
 
 		 274 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1662  alpha/beta hydrolase fold protein  57.52 
 
 		 274 aa  301  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.665083  normal  0.0127757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1992  alpha/beta hydrolase fold  57.14 
 
 		 274 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1133  alpha/beta hydrolase fold  57.2 
 
 		 271 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.03617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1252  alpha/beta fold hydrolase  55.4 
 
 		 274 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828608  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  54.28 
 
 		 270 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  51.84 
 
 		 272 aa  263  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  51.11 
 
 		 268 aa  259  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  52.26 
 
 		 260 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  49.81 
 
 		 260 aa  248  8e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  50.19 
 
 		 268 aa  246  4e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  49.81 
 
 		 260 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1655  alpha/beta hydrolase fold  49.43 
 
 		 273 aa  236  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.831884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2049  alpha/beta hydrolase fold protein  49.43 
 
 		 273 aa  236  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4961  alpha/beta hydrolase fold  48.7 
 
 		 269 aa  235  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3781  alpha/beta hydrolase fold  48.75 
 
 		 279 aa  229  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3175  hypothetical protein  48.5 
 
 		 260 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0913717 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2998  alpha/beta hydrolase fold  47.58 
 
 		 269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186878 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1330  alpha/beta hydrolase fold  47.92 
 
 		 260 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.515623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1521  alpha/beta hydrolase fold  47.9 
 
 		 287 aa  191  8e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  37.36 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  39.76 
 
 		 263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 258 aa  87.4  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 		 265 aa  72  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  28.32 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  24 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  27.43 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  27.43 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  28.67 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  27.12 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  27.96 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  28.62 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  28.67 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  46.81 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  29.52 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  27.78 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.94 
 
 		 299 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  28.32 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  28.32 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  28.32 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.35 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.27 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  27.36 
 
 		 390 aa  65.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.27 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  37.98 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0978  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 		 339 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.27 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  26.75 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  43.43 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  22.26 
 
 		 257 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  22.26 
 
 		 257 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  42.2 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  29.03 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  28.43 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  29.03 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  22.26 
 
 		 257 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  29.03 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  43 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  27.88 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  29.3 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  24.21 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  33.76 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1333  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59598  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2809  alpha/beta hydrolase fold  32.88 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  35.42 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0961  alpha/beta hydrolase fold  34.43 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0172489 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  21.92 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  27.68 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  27.68 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  27.68 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.68 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  27.68 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40 
 
 		 370 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  27.68 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.6 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  30.71 
 
 		 259 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  39.81 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  42.99 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5749  Alpha/beta hydrolase  39.22 
 
 		 408 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.03491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>