More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1573 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1573  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
281 aa  565  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2771  alpha/beta hydrolase fold  83.7 
 
 
277 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1356  Alpha/beta hydrolase fold protein  80 
 
 
277 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.965846 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1561  hydrolase protein  58.65 
 
 
274 aa  304  1e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1662  alpha/beta hydrolase fold protein  57.52 
 
 
274 aa  301  8e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.665083  normal  0.0127757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1992  alpha/beta hydrolase fold  57.14 
 
 
274 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45941  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1133  alpha/beta hydrolase fold  57.2 
 
 
271 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.03617  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1252  alpha/beta fold hydrolase  55.4 
 
 
274 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828608  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  54.28 
 
 
270 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  51.84 
 
 
272 aa  263  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  51.11 
 
 
268 aa  259  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  52.26 
 
 
260 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  49.81 
 
 
260 aa  248  8e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  50.19 
 
 
268 aa  246  4e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  49.81 
 
 
260 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1655  alpha/beta hydrolase fold  49.43 
 
 
273 aa  236  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.831884  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2049  alpha/beta hydrolase fold protein  49.43 
 
 
273 aa  236  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4961  alpha/beta hydrolase fold  48.7 
 
 
269 aa  235  5e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3781  alpha/beta hydrolase fold  48.75 
 
 
279 aa  229  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3175  hypothetical protein  48.5 
 
 
260 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0913717 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2998  alpha/beta hydrolase fold  47.58 
 
 
269 aa  220  2e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.186878 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1330  alpha/beta hydrolase fold  47.92 
 
 
260 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.515623  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1521  alpha/beta hydrolase fold  47.9 
 
 
287 aa  191  8e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  37.36 
 
 
258 aa  155  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  39.76 
 
 
263 aa  126  4e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
256 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 
258 aa  87.4  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 
255 aa  85.1  1e-15  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
264 aa  79  8e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  24 
 
 
279 aa  71.6  1e-11  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  28.32 
 
 
261 aa  72  1e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 
265 aa  72  1e-11  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  27.43 
 
 
315 aa  71.2  2e-11  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  27.12 
 
 
262 aa  71.6  2e-11  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  28.67 
 
 
261 aa  71.2  2e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  27.43 
 
 
315 aa  71.2  2e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 
309 aa  70.9  2e-11  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  27.96 
 
 
261 aa  70.5  3e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  28.67 
 
 
261 aa  68.9  9e-11  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  28.62 
 
 
260 aa  68.9  9e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  46.81 
 
 
294 aa  68.2  2e-10  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 
306 aa  68.2  2e-10  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  3.69585e-05 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  29.52 
 
 
381 aa  67.4  3e-10  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  27.78 
 
 
259 aa  67.4  3e-10  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.94 
 
 
299 aa  67  3e-10  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  28.32 
 
 
261 aa  66.6  4e-10  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  28.32 
 
 
261 aa  66.6  4e-10  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
262 aa  66.6  4e-10  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 
347 aa  66.6  4e-10  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  28.32 
 
 
261 aa  66.6  4e-10  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.35 
 
 
264 aa  66.2  5e-10  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  37.98 
 
 
314 aa  65.9  7e-10  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.27 
 
 
371 aa  65.9  7e-10  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.27 
 
 
371 aa  65.9  7e-10  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  27.36 
 
 
390 aa  65.9  7e-10  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0978  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 
339 aa  65.9  8e-10  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.27 
 
 
371 aa  65.9  8e-10  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
262 aa  65.9  8e-10  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  26.75 
 
 
277 aa  65.5  9e-10  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  29.03 
 
 
256 aa  65.1  1e-09  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  22.26 
 
 
257 aa  65.5  1e-09  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  28.43 
 
 
275 aa  65.1  1e-09  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  22.26 
 
 
257 aa  65.5  1e-09  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  43.43 
 
 
370 aa  65.5  1e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  42.2 
 
 
371 aa  65.1  1e-09  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  22.26 
 
 
257 aa  65.5  1e-09  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.04294e-08 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  29.03 
 
 
256 aa  65.1  1e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  27.88 
 
 
286 aa  64.3  2e-09  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
263 aa  64.3  2e-09  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
252 aa  64.7  2e-09  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 
277 aa  64.3  2e-09  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  29.03 
 
 
256 aa  64.7  2e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  43 
 
 
370 aa  64.3  2e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  24.21 
 
 
257 aa  63.5  3e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  29.3 
 
 
292 aa  63.9  3e-09  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  33.76 
 
 
265 aa  63.5  4e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1333  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 
348 aa  63.5  4e-09  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59598  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2809  alpha/beta hydrolase fold  32.88 
 
 
271 aa  63.2  5e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  35.42 
 
 
329 aa  62.8  6e-09  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 
277 aa  62.8  6e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
265 aa  62.8  6e-09  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0961  alpha/beta hydrolase fold  34.43 
 
 
233 aa  62.4  7e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0172489 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  21.92 
 
 
257 aa  62.4  7e-09  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  27.68 
 
 
261 aa  62.4  8e-09  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40 
 
 
370 aa  62.4  8e-09  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  27.68 
 
 
261 aa  62.4  8e-09  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.68 
 
 
261 aa  62.4  8e-09  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  27.68 
 
 
261 aa  62.4  8e-09  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  27.68 
 
 
261 aa  62.4  8e-09  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  27.68 
 
 
261 aa  62.4  8e-09  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 
272 aa  62  1e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  30.71 
 
 
259 aa  62  1e-08  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.6 
 
 
261 aa  61.6  1e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 
250 aa  61.2  2e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  39.81 
 
 
263 aa  60.8  2e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 
262 aa  61.2  2e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 
282 aa  60.1  4e-08  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  42.99 
 
 
229 aa  60.1  4e-08  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2426  alpha/beta hydrolase fold  41.41 
 
 
408 aa  59.7  5e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.278939 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1098  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
272 aa  59.7  5e-08  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.625731  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>