178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1568 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1568  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 487 aa  976    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2766  Tetratricopeptide TPR_4  68.33 
 
 		 492 aa  622  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1361  hypothetical protein  66.38 
 
 		 499 aa  620  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.995153  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1218  hypothetical protein  41.53 
 
 		 602 aa  306  6e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3327  hypothetical protein  42.11 
 
 		 602 aa  285  9e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.65009 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  34.87 
 
 		 611 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  38.13 
 
 		 545 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  37.98 
 
 		 571 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  35.28 
 
 		 545 aa  213  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  37.53 
 
 		 600 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  37.88 
 
 		 545 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  37.53 
 
 		 496 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.26 
 
 		 545 aa  211  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  37.12 
 
 		 559 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  35.81 
 
 		 588 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 607 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4231  TPR repeat-containing protein  36.45 
 
 		 536 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  36.71 
 
 		 573 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  35.41 
 
 		 546 aa  204  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 593 aa  202  8e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 		 592 aa  192  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  33.69 
 
 		 387 aa  188  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  34.84 
 
 		 653 aa  188  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  34.84 
 
 		 653 aa  188  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 		 602 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  32.68 
 
 		 389 aa  186  8e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  33.33 
 
 		 360 aa  184  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  32.78 
 
 		 556 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0955  TPR domain-containing protein  34.26 
 
 		 705 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497218  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1212  hypothetical protein  33.98 
 
 		 385 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  33.16 
 
 		 505 aa  179  9e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  33.93 
 
 		 601 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  33 
 
 		 1038 aa  179  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.16 
 
 		 604 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 955 aa  177  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 		 542 aa  176  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  34.56 
 
 		 472 aa  176  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  33.76 
 
 		 1450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 		 607 aa  174  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0462  TPR domain-containing protein  36.99 
 
 		 711 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317996  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 574 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1949  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 		 598 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.411479  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2044  TPR domain-containing protein  36.71 
 
 		 598 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  33.17 
 
 		 1005 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 578 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  33.9 
 
 		 872 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  31.92 
 
 		 703 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  33.5 
 
 		 935 aa  163  6e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33 
 
 		 1034 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 		 608 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.84 
 
 		 760 aa  162  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  33.78 
 
 		 577 aa  162  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0045  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 451 aa  160  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.9 
 
 		 3145 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  28.61 
 
 		 630 aa  159  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 		 529 aa  159  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  32.61 
 
 		 1077 aa  158  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  29.4 
 
 		 527 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 		 767 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 688 aa  157  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  31.28 
 
 		 503 aa  157  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 1212 aa  157  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  33.16 
 
 		 1677 aa  156  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1511  TPR domain-containing protein  31.32 
 
 		 525 aa  153  7e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000212111  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  29.2 
 
 		 615 aa  150  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 		 502 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 740 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  30.32 
 
 		 473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0486  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.73 
 
 		 689 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  30.87 
 
 		 502 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  30.87 
 
 		 502 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 595 aa  147  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  27.51 
 
 		 780 aa  147  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  29.96 
 
 		 714 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  28.01 
 
 		 550 aa  144  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 		 484 aa  144  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0104  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 		 406 aa  144  5e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.010788  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 1454 aa  143  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 1451 aa  143  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.31 
 
 		 454 aa  143  8e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  31.49 
 
 		 714 aa  143  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 747 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1516  TPR domain-containing protein  31.61 
 
 		 360 aa  141  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0304  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.42 
 
 		 646 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.860081  normal  0.111747 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  33.25 
 
 		 558 aa  140  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 		 546 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0842  TPR domain-containing protein  32.51 
 
 		 509 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 646 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1363  TPR domain-containing protein  32.51 
 
 		 509 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.134471  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0511  TPR domain-containing protein  32.51 
 
 		 509 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.893562  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0645  TPR repeat-containing protein  32.51 
 
 		 509 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  33.23 
 
 		 747 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 1827 aa  138  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 649 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 649 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 		 636 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  27.64 
 
 		 1764 aa  138  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 		 1073 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>