More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1531 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1531  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 260 aa  519  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0450484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2686  extracellular solute-binding protein family 3  82.69 
 
 		 260 aa  433  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1432  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  83.08 
 
 		 260 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6491  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  71.92 
 
 		 260 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.353302  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3140  extracellular solute-binding protein  75.38 
 
 		 260 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3156  extracellular solute-binding protein  76.15 
 
 		 260 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2527  extracellular solute-binding protein  75.38 
 
 		 260 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3855  extracellular solute-binding protein family 3  64.62 
 
 		 256 aa  345  5e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3835  extracellular solute-binding protein family 3  71.85 
 
 		 257 aa  341  8e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3136  extracellular solute-binding protein  69.33 
 
 		 257 aa  339  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0231  extracellular solute-binding protein family 3  65.52 
 
 		 255 aa  338  4e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3698  extracellular solute-binding protein family 3  62.45 
 
 		 256 aa  338  5.9999999999999996e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7224  ABC transporter substrate binding protein (nopaline)  70.04 
 
 		 257 aa  338  7e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0235  extracellular solute-binding protein family 3  65.52 
 
 		 255 aa  337  9e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4163  extracellular solute-binding protein family 3  69.75 
 
 		 257 aa  334  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0682  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  62.69 
 
 		 257 aa  328  5.0000000000000004e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0638  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  62.69 
 
 		 257 aa  328  5.0000000000000004e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.890453  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3808  extracellular solute-binding protein  61.92 
 
 		 257 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902335  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4924  extracellular solute-binding protein  61.86 
 
 		 261 aa  305  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263703 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0207  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  53.23 
 
 		 260 aa  297  9e-80  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.670956  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2239  flagellar hook protein FlgE  49.21 
 
 		 257 aa  259  2e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000435982  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0687  extracellular solute-binding protein  48.88 
 
 		 265 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0413327  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  48.88 
 
 		 265 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  48.51 
 
 		 265 aa  251  7e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  48.51 
 
 		 265 aa  251  7e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  48.51 
 
 		 265 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  48.13 
 
 		 265 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  48.13 
 
 		 265 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  48.13 
 
 		 265 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0947  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  48.13 
 
 		 265 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  48.13 
 
 		 265 aa  249  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  52.54 
 
 		 265 aa  249  4e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1758  hook assembly protein, flagella  51.93 
 
 		 250 aa  248  9e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000345404  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2345  extracellular solute-binding protein  53.19 
 
 		 273 aa  246  3e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.949438  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2439  extracellular solute-binding protein  43.7 
 
 		 259 aa  232  5e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.732764  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2487  extracellular solute-binding protein  43.7 
 
 		 259 aa  232  5e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1926  solute-binding family 1 protein  48 
 
 		 250 aa  232  6e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2005  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  44.44 
 
 		 262 aa  231  8.000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1924  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  42.19 
 
 		 259 aa  224  1e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1126  extracellular solute-binding protein family 3  46.29 
 
 		 271 aa  223  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.390537  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1925  solute-binding family 1 protein  46.26 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1150  extracellular solute-binding protein  43.9 
 
 		 281 aa  223  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.3 
 
 		 503 aa  217  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1928  extracellular solute-binding protein  44.94 
 
 		 278 aa  216  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.16 
 
 		 503 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.45 
 
 		 489 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  45.45 
 
 		 489 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0212  amino acid ABC transporter, substrate-binding  41.86 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.45 
 
 		 489 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4150  extracellular solute-binding protein family 3  45.58 
 
 		 268 aa  212  5.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0790  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.26 
 
 		 483 aa  208  6e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.124129  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  42.86 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  41.26 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  41.98 
 
 		 264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.73 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.22 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  43.27 
 
 		 266 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  43.27 
 
 		 266 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  43.27 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  43.27 
 
 		 266 aa  192  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  41.5 
 
 		 266 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  42.86 
 
 		 266 aa  191  8e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  42.52 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  42.45 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  41.48 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  42.86 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  41.13 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  42.45 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  41.13 
 
 		 264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  41.8 
 
 		 266 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  40.75 
 
 		 264 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0781  amino-acid ABC transporter extracellular-binding protein yckK  40.61 
 
 		 252 aa  188  5.999999999999999e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.98 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.98 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1824  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.98 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0726824  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.98 
 
 		 284 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  41.51 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.98 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.98 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.98 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  40.75 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  43.32 
 
 		 264 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  41.29 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  42.86 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  40.38 
 
 		 264 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  40.38 
 
 		 264 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  40.38 
 
 		 264 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.23 
 
 		 266 aa  184  8e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  39.26 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  42.91 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  42.04 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  41.8 
 
 		 264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  43.72 
 
 		 253 aa  182  7e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  39.85 
 
 		 266 aa  181  8.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  39.85 
 
 		 266 aa  181  8.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  39.85 
 
 		 266 aa  181  8.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  39.02 
 
 		 266 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.85 
 
 		 267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0296  extracellular solute-binding protein  38.7 
 
 		 263 aa  179  4.999999999999999e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  40.23 
 
 		 266 aa  176  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>