More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1506 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  100 
 
 
404 aa  780    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  78.52 
 
 
399 aa  570  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  79.28 
 
 
400 aa  556  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  76.61 
 
 
399 aa  527  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  78.52 
 
 
399 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  76.73 
 
 
399 aa  510  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  76.34 
 
 
399 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1203  major facilitator transporter  76.34 
 
 
399 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446653  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1112  major facilitator transporter  78.01 
 
 
399 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  76.34 
 
 
399 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  76.13 
 
 
398 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  76.13 
 
 
398 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  76.13 
 
 
429 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  76.13 
 
 
398 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  76.13 
 
 
429 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  76.13 
 
 
398 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  76.13 
 
 
398 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2837  major facilitator family transporter  73.91 
 
 
398 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  43.87 
 
 
394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  48.62 
 
 
397 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  48.83 
 
 
395 aa  305  7e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  47.03 
 
 
383 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  44.8 
 
 
403 aa  300  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  51.26 
 
 
415 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  48.14 
 
 
403 aa  296  6e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  48.4 
 
 
405 aa  293  4e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  50.66 
 
 
394 aa  290  4e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4726  major facilitator transporter  50.67 
 
 
394 aa  289  6e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.445553  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  44.44 
 
 
390 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  50.67 
 
 
394 aa  285  8e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  51.25 
 
 
402 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00295222  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  49.72 
 
 
415 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2143  major facilitator transporter  51.25 
 
 
402 aa  282  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1477  major facilitator transporter  48.28 
 
 
391 aa  282  9e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14668  hitchhiker  0.0000166249 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1738  major facilitator superfamily MFS_1  51.52 
 
 
402 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.567776  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  47.46 
 
 
389 aa  278  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  49.58 
 
 
403 aa  276  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  45.95 
 
 
407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  47.35 
 
 
389 aa  272  7e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7258  major facilitator superfamily MFS_1  51.56 
 
 
407 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173664  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  44.66 
 
 
399 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  44.38 
 
 
399 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  44.38 
 
 
399 aa  265  7e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  44.35 
 
 
385 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4774  major facilitator superfamily MFS_1  46.49 
 
 
389 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1224  MFS permease  41.11 
 
 
415 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0405  transporter  46.76 
 
 
403 aa  257  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.474552  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  40.7 
 
 
399 aa  256  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  40.7 
 
 
399 aa  256  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3219  major facilitator superfamily MFS_1  47.86 
 
 
396 aa  256  6e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  40.7 
 
 
399 aa  256  7e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  43.84 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0185  major facilitator transporter  48.28 
 
 
410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  38.85 
 
 
393 aa  253  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1108  major facilitator superfamily MFS_1  47.18 
 
 
396 aa  252  7e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0153  major facilitator superfamily MFS_1  46.02 
 
 
419 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2920  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 
389 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  40.62 
 
 
394 aa  249  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  41.83 
 
 
394 aa  249  4e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4800  major facilitator transporter  48.56 
 
 
412 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  42.7 
 
 
410 aa  249  8e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.807255 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  41.83 
 
 
394 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  39.06 
 
 
413 aa  248  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  41.83 
 
 
394 aa  248  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  41.83 
 
 
394 aa  248  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5392  major facilitator transporter  48.56 
 
 
412 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0287626  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5469  major facilitator transporter  48.56 
 
 
412 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414502  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  41.83 
 
 
394 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4363  major facilitator transporter  47.53 
 
 
403 aa  247  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3939  major facilitator superfamily MFS_1  48.62 
 
 
408 aa  246  6.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.798126  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  41.84 
 
 
394 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  42.11 
 
 
394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  41.58 
 
 
394 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  41.58 
 
 
394 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  41.58 
 
 
394 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  41.83 
 
 
399 aa  243  5e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6889  major facilitator transporter  42.5 
 
 
400 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398856  normal  0.655887 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  41.32 
 
 
394 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2949  major facilitator transporter  48.76 
 
 
405 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137006  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  41.1 
 
 
398 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  41.3 
 
 
387 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4811  major facilitator transporter  47.85 
 
 
410 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5352  major facilitator transporter  47.85 
 
 
410 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660653  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  39.05 
 
 
389 aa  233  5e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  39.05 
 
 
389 aa  233  5e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  41.22 
 
 
399 aa  233  6e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 
406 aa  232  9e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3317  major facilitator transporter  48.26 
 
 
411 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.209632 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  39.85 
 
 
406 aa  231  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  37.81 
 
 
405 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  37.81 
 
 
405 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  37.81 
 
 
405 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  38.55 
 
 
391 aa  227  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4753  major facilitator superfamily MFS_1  50.4 
 
 
407 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.84562  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  39.43 
 
 
426 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1580  major facilitator superfamily MFS_1  50.73 
 
 
425 aa  226  8e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.551753  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  43.29 
 
 
405 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3959  major facilitator superfamily MFS_1  42.51 
 
 
406 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.177015  normal  0.0110236 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3845  major facilitator superfamily MFS_1  42.51 
 
 
406 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0254807  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  43.29 
 
 
399 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>