More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1160 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  100 
 
 
440 aa  871    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  61.56 
 
 
427 aa  533  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  63.83 
 
 
428 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  62.32 
 
 
428 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  62.32 
 
 
428 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  62.09 
 
 
428 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  60.73 
 
 
428 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  62.8 
 
 
428 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  61.32 
 
 
428 aa  501  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  55.69 
 
 
425 aa  484  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5120  major facilitator superfamily MFS_1  59.26 
 
 
429 aa  481  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  55.92 
 
 
425 aa  478  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  54.85 
 
 
425 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  54.85 
 
 
425 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  54.85 
 
 
425 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  54.85 
 
 
425 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  54.61 
 
 
425 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  55.91 
 
 
425 aa  463  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  55.08 
 
 
425 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  55.42 
 
 
425 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1342  major facilitator family transporter  53.27 
 
 
425 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2520  major facilitator family transporter  53.27 
 
 
452 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  55.15 
 
 
427 aa  455  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1266  major facilitator family transporter  53.02 
 
 
435 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4150  major facilitator transporter  54.61 
 
 
431 aa  451  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.023959  normal  0.746651 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3120  major facilitator superfamily MFS_1  55.69 
 
 
424 aa  448  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  53.1 
 
 
499 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0563  putative integral membrane transport protein  53.03 
 
 
413 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.827821  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1004  major facilitator family transporter  53.03 
 
 
413 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2930  major facilitator superfamily MFS_1  53.22 
 
 
425 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  49.05 
 
 
438 aa  425  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  48.94 
 
 
438 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  51.98 
 
 
442 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  47.36 
 
 
454 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  45.64 
 
 
457 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  47.67 
 
 
443 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3414  major facilitator superfamily MFS_1  45.71 
 
 
438 aa  388  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0442  major facilitator superfamily MFS_1  47.62 
 
 
444 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.327112  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  46.37 
 
 
438 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  46.97 
 
 
443 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  48.28 
 
 
436 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  49.64 
 
 
461 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  45.73 
 
 
447 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  47 
 
 
435 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  45.64 
 
 
438 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  45.39 
 
 
438 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  45.39 
 
 
438 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.78 
 
 
430 aa  347  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  45.14 
 
 
438 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  42.96 
 
 
440 aa  340  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  43.5 
 
 
430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  44.04 
 
 
430 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  44.04 
 
 
430 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  44.64 
 
 
438 aa  335  7e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  43.8 
 
 
430 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  43.8 
 
 
430 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  43.8 
 
 
430 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  43.55 
 
 
430 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  43.8 
 
 
417 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  44.42 
 
 
431 aa  331  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  43.99 
 
 
430 aa  331  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  42.65 
 
 
435 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  42.4 
 
 
435 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  42.16 
 
 
435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  42.16 
 
 
435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  42.16 
 
 
435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  42.4 
 
 
435 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  42.4 
 
 
435 aa  326  5e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  43.12 
 
 
433 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  40 
 
 
453 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  43.89 
 
 
445 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  43.89 
 
 
445 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  43.89 
 
 
445 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  43.89 
 
 
445 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  43.89 
 
 
420 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  41.36 
 
 
436 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  43.89 
 
 
445 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  42.04 
 
 
448 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  41.12 
 
 
436 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2715  major facilitator family transporter  41.71 
 
 
428 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  43.03 
 
 
439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  42.05 
 
 
443 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  42.55 
 
 
439 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  42.05 
 
 
443 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  39.87 
 
 
466 aa  319  6e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  40.15 
 
 
436 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  41 
 
 
443 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  40.15 
 
 
436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  40.55 
 
 
443 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  40.32 
 
 
443 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  42.72 
 
 
440 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  43.54 
 
 
440 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  42.18 
 
 
437 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  40.09 
 
 
443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  42.18 
 
 
437 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1667  gp59  40.91 
 
 
444 aa  309  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00012359  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2169  major facilitator superfamily MFS_1  41.26 
 
 
440 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  41.79 
 
 
433 aa  307  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  41.44 
 
 
437 aa  306  7e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  41.36 
 
 
431 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>