More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1157 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1157  porin  100 
 
 		 379 aa  751    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  61.82 
 
 		 381 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  62.34 
 
 		 381 aa  448  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  61.82 
 
 		 381 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  58.59 
 
 		 379 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  61.37 
 
 		 379 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  57.88 
 
 		 383 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  58.59 
 
 		 379 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  58.59 
 
 		 379 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  58.85 
 
 		 379 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  57.62 
 
 		 383 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  58.33 
 
 		 379 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  59.84 
 
 		 381 aa  424  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  61.39 
 
 		 380 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  61.11 
 
 		 380 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  58.81 
 
 		 374 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  58.59 
 
 		 379 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  57.97 
 
 		 376 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  56.52 
 
 		 383 aa  388  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  56.3 
 
 		 383 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  55.53 
 
 		 384 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  53.49 
 
 		 384 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  51.54 
 
 		 384 aa  358  7e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  51.54 
 
 		 384 aa  358  7e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  51.54 
 
 		 384 aa  358  7e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  51.54 
 
 		 384 aa  358  7e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  51.54 
 
 		 384 aa  358  7e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  51.54 
 
 		 384 aa  358  7e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  51.54 
 
 		 384 aa  358  7e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  51.76 
 
 		 380 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  50.51 
 
 		 414 aa  353  4e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  51.51 
 
 		 380 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  52.84 
 
 		 375 aa  351  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  52.32 
 
 		 375 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  50.66 
 
 		 380 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  50.25 
 
 		 380 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  49.75 
 
 		 380 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  50.66 
 
 		 380 aa  345  6e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  54.26 
 
 		 383 aa  345  6e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  50.9 
 
 		 392 aa  343  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  55.61 
 
 		 409 aa  343  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  51.55 
 
 		 375 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  51.55 
 
 		 375 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  50 
 
 		 384 aa  342  8e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  49.75 
 
 		 379 aa  342  9e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  50.88 
 
 		 383 aa  339  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  51.26 
 
 		 383 aa  338  7e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  49.87 
 
 		 391 aa  338  8e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  49.62 
 
 		 409 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  49.62 
 
 		 409 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  49.46 
 
 		 384 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  48.91 
 
 		 384 aa  335  9e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  48.91 
 
 		 384 aa  335  9e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  48.91 
 
 		 384 aa  335  9e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  49.18 
 
 		 384 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  50 
 
 		 384 aa  333  4e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  48.63 
 
 		 391 aa  333  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  48.62 
 
 		 384 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  48.62 
 
 		 384 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  48.62 
 
 		 384 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  50.13 
 
 		 375 aa  332  8e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  48.37 
 
 		 384 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  48.37 
 
 		 384 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  48.07 
 
 		 383 aa  331  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  48.76 
 
 		 390 aa  329  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  48.12 
 
 		 384 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  47.12 
 
 		 384 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  49.46 
 
 		 385 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  47.67 
 
 		 396 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  48.15 
 
 		 411 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  49.73 
 
 		 377 aa  316  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  48.39 
 
 		 386 aa  315  9e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  47.55 
 
 		 386 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  47.7 
 
 		 386 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  48.91 
 
 		 387 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  47 
 
 		 394 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  47.33 
 
 		 381 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  49.07 
 
 		 377 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  48.35 
 
 		 386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  47.99 
 
 		 386 aa  305  6e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  46.74 
 
 		 394 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  45.78 
 
 		 386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  45.1 
 
 		 383 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  46.03 
 
 		 391 aa  299  6e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0849  OmpC family outer membrane porin  44.99 
 
 		 384 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153062  normal  0.0195066 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  45.43 
 
 		 377 aa  295  9e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  46.13 
 
 		 389 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  46.13 
 
 		 389 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5966  porin  47.09 
 
 		 380 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.084261 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  45.36 
 
 		 403 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  45.88 
 
 		 389 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  45.91 
 
 		 471 aa  292  7e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  47.44 
 
 		 383 aa  292  8e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  45.05 
 
 		 382 aa  290  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  50.27 
 
 		 361 aa  288  8e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  45.23 
 
 		 383 aa  288  9e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  50.13 
 
 		 363 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  44.97 
 
 		 383 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  44.97 
 
 		 383 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  44.72 
 
 		 383 aa  286  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>